1-(4-aminobenzyl)-N-(1-(4-methoxyphenethyl)piperidin-4-yl)-1H-benzo[d]imidazol-2-amine

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并咪唑类
• 英文名称: 1-(4-aminobenzyl)-N-(1-(4-methoxyphenethyl)piperidin-4-yl)-1H-benzo[d]imidazol-2-amine
• 英文别名: 1-[(4-aminophenyl)methyl]-N-[1-[2-(4-methoxyphenyl)ethyl]piperidin-4-yl]benzimidazol-2-amine
• 化学式: C₂₈H₃₃N₅O
• 分子量: 455.603
• InChiKey: RVIPVRWYACCHTP-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.79
• 重原子数：
  34.0
• 可旋转键数：
  8.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.32
• 拓扑面积：
  68.34
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  6.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  对甲氧基苯乙醇 在 铁粉 、 sodium carbonate 、 氯化铵 、 三乙胺 、 potassium iodide 作用下， 以 乙醇 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 6.0h， 生成 1-(4-aminobenzyl)-N-(1-(4-methoxyphenethyl)piperidin-4-yl)-1H-benzo[d]imidazol-2-amine
  参考文献：
  名称：

  靶向EZH2-EED相互作用的小分子PRC2抑制剂的结构引导开发

  摘要：

  EZH2-胚胎外胚层发育（EED）蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）的破坏是一种新的有前途的癌症治疗策略。我们之前曾报道过阿司咪唑的发现，这是一种靶向 EZH2-EED PPI 的小分子抑制剂。在此，我们报告了 EED 与阿司咪唑复合物在 2.15 Å 处的共晶结构。该结构阐明了阿司咪唑与 EED 的详细结合模式，并为发现具有亲和力K d的新型 EZH2-EED 相互作用抑制剂 DC-PRC2in-01 提供了结构指导设计4.56 μM。DC-PRC2in-01 使PRC2 复合物不稳定，从而导致PRC2 核心蛋白的降解和癌细胞中整体H3K27me3 水平的降低。有效抑制PRC2驱动的淋巴瘤细胞增殖，细胞周期停滞在G0/G1期。总之，这些数据表明 DC-PRC2in-01 可能是一种有效的化学探针，用于研究与 PRC2 相关的生理学和病理学，并为进一步开发提供有前景的化学支架。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.0c02261

文献信息

• Structure-Guided Development of Small-Molecule PRC2 Inhibitors Targeting EZH2–EED Interaction
  作者：Daohai Du、Dandan Xu、Licheng Zhu、Giulia Stazi、Clemens Zwergel、Yanli Liu、Zhongyuan Luo、Yuanqing Li、Yuanyuan Zhang、Kongkai Zhu、Yiluan Ding、Jingqiu Liu、Shijie Fan、Kaiyan Zhao、Naixia Zhang、Xiangqian Kong、Hualiang Jiang、Kaixian Chen、Kehao Zhao、Sergio Valente、Jinrong Min、Wenhu Duan、Cheng Luo

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.0c02261

  日期：2021.6.24

  astemizole to EED and provides a structure-guided design for the discovery of a novel EZH2–EED interaction inhibitor, DC-PRC2in-01, with an affinity Kd of 4.56 μM. DC-PRC2in-01 destabilizes the PRC2 complex, thereby leading to the degradation of PRC2 core proteins and the decrease of global H3K27me3 levels in cancer cells. The proliferation of PRC2-driven lymphomas cells is effectively inhibited, and the cell

  EZH2-胚胎外胚层发育（EED）蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）的破坏是一种新的有前途的癌症治疗策略。我们之前曾报道过阿司咪唑的发现，这是一种靶向 EZH2-EED PPI 的小分子抑制剂。在此，我们报告了 EED 与阿司咪唑复合物在 2.15 Å 处的共晶结构。该结构阐明了阿司咪唑与 EED 的详细结合模式，并为发现具有亲和力K d的新型 EZH2-EED 相互作用抑制剂 DC-PRC2in-01 提供了结构指导设计4.56 μM。DC-PRC2in-01 使PRC2 复合物不稳定，从而导致PRC2 核心蛋白的降解和癌细胞中整体H3K27me3 水平的降低。有效抑制PRC2驱动的淋巴瘤细胞增殖，细胞周期停滞在G0/G1期。总之，这些数据表明 DC-PRC2in-01 可能是一种有效的化学探针，用于研究与 PRC2 相关的生理学和病理学，并为进一步开发提供有前景的化学支架。