7-hydrazinyl-N-hydroxy-7-oxoheptanamide

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: 7-hydrazinyl-N-hydroxy-7-oxoheptanamide
• 英文别名: 7-hydrazino-N-hydroxy-7-oxoheptanamide
• 化学式: C₇H₁₅N₃O₃
• 分子量: 189.214
• InChiKey: MRLBWYYRDSCBKW-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.3
• 重原子数：
  13
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.71
• 拓扑面积：
  104
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  7-hydrazinyl-N-hydroxy-7-oxoheptanamide 、 2-溴-5-甲氧基苯甲醛 在 二氟乙酸 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 0.5h， 以78%的产率得到N-[(2-bromo-5-methoxyphenyl)methylideneamino]-N'-hydroxyheptanediamide
  参考文献：
  名称：

  剖析crebinostat的结构-活性-关系：用于神经表观遗传调控的脑渗透HDAC抑制剂

  摘要：

  靶向染色质介导的表观遗传调控已成为开发针对广泛中枢神经系统疾病（包括认知障碍和抑郁症）的新型疗法的潜在途径。组蛋白脱乙酰基酶（HDAC）抑制剂已被用作认知增强剂，它影响基因表达的调节和神经可塑性必不可少的其他机制。通过对crebinostat的结构进行系统修饰，crebinostat是一种先前发现的认知增强剂，可影响对记忆至关重要的基因并增强突触形成，并结合基于生化和神经元细胞的筛选，我们发现了一种新型的基于异羟肟酸酯的HDAC抑制剂，此处称为神经氨酸抑制剂，具有增强的作用。与crebinostat相比在诱导神经元组蛋白乙酰化方面的功效。此外，发现神经调节剂在小鼠大脑中的药代动力学特征略高于crebinostat的药代动力学特征。神经调节剂的发现及其对神经元HDAC的作用的证明，为剖析健康和疾病中神经表观遗传调控的分子和细胞机制增添了可用的药理学工具包。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2016.01.022
• 作为产物：
  描述：

  庚二酸二甲酯 在 盐酸羟胺 、 sodium hydroxide 、 肼 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 84.0h， 生成 7-hydrazinyl-N-hydroxy-7-oxoheptanamide
  参考文献：
  名称：

  剖析crebinostat的结构-活性-关系：用于神经表观遗传调控的脑渗透HDAC抑制剂

  摘要：

  靶向染色质介导的表观遗传调控已成为开发针对广泛中枢神经系统疾病（包括认知障碍和抑郁症）的新型疗法的潜在途径。组蛋白脱乙酰基酶（HDAC）抑制剂已被用作认知增强剂，它影响基因表达的调节和神经可塑性必不可少的其他机制。通过对crebinostat的结构进行系统修饰，crebinostat是一种先前发现的认知增强剂，可影响对记忆至关重要的基因并增强突触形成，并结合基于生化和神经元细胞的筛选，我们发现了一种新型的基于异羟肟酸酯的HDAC抑制剂，此处称为神经氨酸抑制剂，具有增强的作用。与crebinostat相比在诱导神经元组蛋白乙酰化方面的功效。此外，发现神经调节剂在小鼠大脑中的药代动力学特征略高于crebinostat的药代动力学特征。神经调节剂的发现及其对神经元HDAC的作用的证明，为剖析健康和疾病中神经表观遗传调控的分子和细胞机制增添了可用的药理学工具包。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2016.01.022

文献信息

• 一种制备Crebinostat中间体7-肼基-N-羟基- 7-氧代庚酰胺的方法
  申请人：上海工程技术大学

  公开号：CN106946740B

  公开（公告）日：2019-07-09

  本发明涉及有机中间体的制备技术领域，具体涉及一种制备Crebinostat中间体7‑肼基‑N‑羟基‑7‑氧代庚酰胺的方法，包括：(1)酰氨化：以庚二酸二甲酯、水合肼、碱为原料，制备7‑肼基‑7‑氧代庚己酸盐；(2)酯化、羟胺取代：将7‑肼基‑7‑氧代庚己酸盐经过酸化后得到7‑肼基‑7‑氧代庚己酸，将7‑肼基‑7‑氧代庚己酸进行酯化，然后与盐酸羟胺反应制备7‑肼基‑N‑羟基‑7‑氧代庚酰胺。该合成路线原料易得、反应条件温和、后处理简单方便、绿色环保、溶剂可回收利用，方便中试、放大，而且收率高。
• Discovery of histone deacetylase 8 selective inhibitors
  作者：Weiping Tang、Tuoping Luo、Edward F. Greenberg、James E. Bradner、Stuart L. Schreiber

  DOI：10.1016/j.bmcl.2011.01.134

  日期：2011.5

  We have developed an efficient method for synthesizing candidate histone deacetylase ( HDAC) inhibitors in 96-well plates, which are used directly in high-throughput screening. We selected building blocks having hydrazide, aldehyde and hydroxamic acid functionalities. The hydrazides were coupled with different aldehydes in DMSO. The resulting products have the previously identified 'cap/linker/biasing element' structure known to favor inhibition of HDACs. These compounds were assayed without further purification. HDAC8-selective inhibitors were discovered from this novel collection of compounds. (C) 2011 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• Fluorous-Based Small-Molecule Microarrays for the Discovery of Histone Deacetylase Inhibitors
  作者：Arturo J. Vegas、James E. Bradner、Weiping Tang、Olivia M. McPherson、Edward F. Greenberg、Angela N. Koehler、Stuart L. Schreiber

  DOI：10.1002/anie.200703198

  日期：2007.10.22
• Dissecting structure–activity-relationships of crebinostat: Brain penetrant HDAC inhibitors for neuroepigenetic regulation
  作者：Balaram Ghosh、Wen-Ning Zhao、Surya A. Reis、Debasis Patnaik、Daniel M. Fass、Li-Huei Tsai、Ralph Mazitschek、Stephen J. Haggarty

  DOI：10.1016/j.bmcl.2016.01.022

  日期：2016.2

  cognitive enhancer that affects genes critical to memory and enhances synaptogenesis, combined with biochemical and neuronal cell-based screening, we identified a novel hydroxamate-based HDAC inhibitor, here named neurinostat, with increased potency compared to crebinostat in inducing neuronal histone acetylation. In addition, neurinostat was found to have a pharmacokinetic profile in mouse brain modestly

  靶向染色质介导的表观遗传调控已成为开发针对广泛中枢神经系统疾病（包括认知障碍和抑郁症）的新型疗法的潜在途径。组蛋白脱乙酰基酶（HDAC）抑制剂已被用作认知增强剂，它影响基因表达的调节和神经可塑性必不可少的其他机制。通过对crebinostat的结构进行系统修饰，crebinostat是一种先前发现的认知增强剂，可影响对记忆至关重要的基因并增强突触形成，并结合基于生化和神经元细胞的筛选，我们发现了一种新型的基于异羟肟酸酯的HDAC抑制剂，此处称为神经氨酸抑制剂，具有增强的作用。与crebinostat相比在诱导神经元组蛋白乙酰化方面的功效。此外，发现神经调节剂在小鼠大脑中的药代动力学特征略高于crebinostat的药代动力学特征。神经调节剂的发现及其对神经元HDAC的作用的证明，为剖析健康和疾病中神经表观遗传调控的分子和细胞机制增添了可用的药理学工具包。
• A New and Economic Synthesis of Crebinostat
  作者：Jiaru Zhang、Yingao Tang、Yaowei Liu、Yongjun Mao

  DOI：10.1080/00304948.2018.1526033

  日期：2018.9.3

  modest ( 59%). Compound 8 was treated with hydroxylamine in methanol at room temperature to produce 5, then coupled with 6 in ethanol to give the final product 1 in 37.4% yield over four steps, with a syn/anti ratio of 1: 1.3. In order to develop a practical and commercial process of preparing crebinostat, a simple and efficient hectogram-scale synthetic route was developed, as shown in Scheme 3. Dimethyl

  Crebinostat (1, Scheme 1) 包含顺/反异构体，是组蛋白脱乙酰酶 (HDAC) 的小分子抑制剂和染色质介导的神经可塑性调节剂。HDAC 抑制剂已成为有希望的中枢神经系统 (CNS) 疾病的新治疗途径。迄今为止，已经开发了两种克雷比司他的合成方法。Stolfa 等人开发了一种从庚二酸 (2) 得到 0.26 g 规模的 1 的五步法，如方案 1 所示。庚二酸 (2) 依次与乙酸酐和邻三苯甲基羟胺反应，得到 75% 的化合物 3屈服。氨基甲酸叔丁酯和1-乙基3-(3-二甲基氨基丙基)碳二亚胺盐酸盐(EDC)用作缩合剂以44％的产率得到化合物4。在一锅法中用TFA和三乙基硅烷将化合物4的-Boc和-Trt基团脱保护后，得到中间体7-肼基-N-羟基-7-氧代庚酰胺(5)，再与4-联苯甲醛(6)偶联得到最终化合物1，刚性旋转异构体顺反比为1:1.3。中间体4和5均需经柱层析纯化