Fragment-based drug design targeting syntenin PDZ2 domain involved in exosomal release and tumour spread
作者:Manon Garcia、Laurent Hoffer、Raphaël Leblanc、Fatiha Benmansour、Mikael Feracci、Carine Derviaux、Antonio Luis Egea-Jimenez、Philippe Roche、Pascale Zimmermann、Xavier Morelli、Karine Barral
DOI:10.1016/j.ejmech.2021.113601
日期:2021.11
syntenin PDZ domains interacting with syndecans. We therefore aimed to develop, through a fragment-based drug design approach, novel inhibitors targeting syntenin-syndecan interactions. We describe here the optimization of a fragment, ‘hit’ C58, identified by in vitro screening of a PDZ-focused fragment library, which binds specifically to the syntenin-PDZ2 domain at the same binding site as the syndecan-2
Syntenin 刺激外泌体的产生,其表达在许多癌症中上调,并与转移性肿瘤的扩散有关。这些作用得到了与 Syndecans 相互作用的 Syntenin PDZ 域的支持。因此,我们的目标是通过基于片段的药物设计方法开发针对合成蛋白-合成蛋白聚糖相互作用的新型抑制剂。我们在这里描述了一个片段的优化,“命中” C58,通过体外筛选以 PDZ 为重点的片段库,它与 syntenin-PDZ2 域在与 syndecan-2 肽相同的结合位点特异性结合。X 射线晶体结构和计算对接被用来指导我们的优化过程并导致化合物45和57 (IC 50 = 33 μM 和 47 μM;分别),两个代表的 Syntenin-syndecan 相互作用抑制剂,它们选择性地影响 Syntenin-外泌体的释放。这些发现表明,有可能鉴定出抑制合成蛋白-合成多糖相互作用和外泌体释放的小分子,这些小分子可能对癌症治疗有用。