1-[(2R,4S,5R)-5-(羟基甲基)-4-硫基四氢呋喃-2-基]-5-甲基嘧啶-2,4-二酮 | 126862-95-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 中文名称: 1-[(2R,4S,5R)-5-(羟基甲基)-4-硫基四氢呋喃-2-基]-5-甲基嘧啶-2,4-二酮
• 英文名称: 3'-thiothymidine
• 英文别名: 1-[(2R,4S,5R)-5-(hydroxymethyl)-4-sulfanyloxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 126862-95-1
• 化学式: C₁₀H₁₄N₂O₄S
• 分子量: 258.298
• InChiKey: LNRCBWCMVHSMBJ-GJMOJQLCSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.3
• 重原子数：
  17
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  79.9
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4,4'-双甲氧基三苯甲基氯 、 1-[(2R,4S,5R)-5-(羟基甲基)-4-硫基四氢呋喃-2-基]-5-甲基嘧啶-2,4-二酮 在 溶剂黄146 作用下， 以 甲醇 、 水 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 3'-S-(4,4'-dimethoxytrityl)-3'-thiothymidine
  参考文献：
  名称：

  含有3'- S-硫代磷酸酯键和3'-末端3'-硫代核苷的寡核苷酸的反向合成（5'→3'）†

  摘要：

  含3'- thionucleosides寡脱氧核苷酸的合成已使用反向方向（5'→3'）的方法探讨的基础上，其含有一个或三苯甲基二甲氧基三苯甲基保护的核苷单体3'-硫醇和一个5'- ø -亚磷酰胺。这些单体相对容易制备，因为基于三苯甲基的保护基优先于5'-羟基以3'-硫醇选择性引入。作为替代方法，可以诱导三苯甲基从5'-氧迁移至3'-硫醇功能。5'→3'的合成寡核苷酸的合成相对内部3'-thionucleosides [产生3'- S]的收率相对较低-硫代磷酸酯（3'-SP）键]和多个3'-SP修饰不能通过该方法引入。然而，反向方法提供了以3'-硫代核苷终止的寡核苷酸的有效途径。这些硫封端的低聚物的直接合成以前没有报道，并且所描述的方法适用于衍生自胸腺嘧啶，胞嘧啶和腺嘌呤的2'-脱氧-3'-硫核苷。

  DOI：

  10.1039/b923545k
• 作为产物：
  描述：

  methyl 5-O-tert-butyldiphenylsilyl-3-iodo-2,3-dideoxy-α-D-threo-pentofuranoside 在 三氟甲磺酸三甲基硅酯 、 四丁基氟化铵 、 sodium methylate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 11.5h， 生成 1-[(2R,4S,5R)-5-(羟基甲基)-4-硫基四氢呋喃-2-基]-5-甲基嘧啶-2,4-二酮
  参考文献：
  名称：

  Convergent synthesis of 2?,3?-dideoxy-3?-mercapto nucleosides ? Potential anti-HIV agents

  摘要：

  Methyl 3-benzoylthio-5-O-tert-butyldiphenylsilyl-2,3-dideoxy-beta-D- erythro-pentofuranoside (4) and its corresponding alpha anomer 5 were synthesized in four steps from 2-deoxy-D-ribose and used as substrates for the synthesis of nucleosides by condensation with silylated thymidine and N-6-isobutyryladenine. The nucleosides were deprotected by treatment with Bu(4)NF in THF followed by reaction with MeONa in MeOH to give 3'-deoxy-3'-mercaptothymidine (8), 2',3'-dideoxy-3'mercaptoadenosine (15) and its corresponding alpha anomer 16. In the latter reactions it was important to use degassed solvents to minimize formation of the corresponding disulfides of purine nucleosides. Using Bu(4)NF, without subsequent reaction with MeONa in the deprotection reaction, resulted in intermolecular transesterification reactions.

  DOI：

  10.1007/bf00812717

文献信息

• Synthesis and phosphorus–sulphur bond cleavage of 3′-thiothymidylyl(3′-5′)thymidine
  作者：Richard Cosstick、Joseph S. Vyle

  DOI：10.1039/c39880000992

  日期：——

  The title compound is readily prepared from 5′-O-monomethoxytrityl-3′-thiothymidine (5); cleavage of the P–S bond can be accomplished by mild oxidative hydrolysis.

  标题化合物易于由5'- O-单甲氧基三苯甲基-3'-硫代胸苷（5）制备；参见图5。P–S键的裂解可通过温和的氧化水解来完成。
• Kinetic parameters and recognition of thymidine analogues with varying functional groups by thymidine phosphorylase
  作者：Akihiko Hatano、Aiko Harano、Yoshikatsu Takigawa、Yasuhiro Naramoto、Keisuke Toda、Yuuichi Nakagomi、Hideyuki Yamada

  DOI：10.1016/j.bmc.2008.01.038

  日期：2008.4.1

  The replacement of 3'-OH of thymidine markedly influenced its catalytic activity with TP. The conversion of pyrimidine nucleosides with modified base moieties to the corresponding 1-phosphate form was poor. The leaving group activity decreased with an increase in aromaticity of the pyrimidine base moiety, because of increased difficulty in polarizing the base by the amino acids local to the active site

  胸苷磷酸化酶（TP，EC 2.4.2.4）通过碱基和核糖基部分均以高特异性识别底物的结构。胸苷的3'-OH取代显着影响TP的催化活性。具有修饰的碱基部分的嘧啶核苷向相应的1-磷酸酯形式的转化很差。离开基团的活性随着嘧啶碱基部分的芳香性的增加而降低，这是因为增加了通过活性位点局部氨基酸使碱基极化的难度。3'和5'官能团的替换趋于降低反应速率和TP转化率。特别地，核糖基3'羟基在结构上对于酶与底物的结合是重要的。
• Anti-retroviral and cytostatic activity of 2′,3′-dideoxyribonucleoside 3′-disulfides
  作者：Béatrice Gerland、Jérôme Désiré、Jan Balzarini、Jean-Luc Décout

  DOI：10.1016/j.bmc.2008.05.065

  日期：2008.7

  report the synthesis, antiviral and cytostatic effects of nucleosides bearing a 3'-disulfide function as prodrugs of potentially active 3'-mercaptonucleotides. The lack of the anti-HIV effects in mutant CEM/TK-cells for most of the thymidine disulfides suggests that a phosphorylation step involving thymidine kinase is necessary for the eventual antiviral activity of the thymidine nucleosides. The comparable

  在本文中，我们报道了具有3'-二硫键功能的核苷作为潜在活性3'-巯基核苷酸的前药的合成，抗病毒和抑制细胞生长的作用。对于大多数的胸苷二硫化物，突变的CEM / TK细胞缺乏抗HIV的作用，这表明，对于胸苷核苷的最终抗病毒活性，涉及胸苷激酶的磷酸化步骤是必需的。大多数二硫化物具有可比的抗HIV活性，并且它们在CEM细胞提取物中的快速还原表明2'，3'-二脱氧-3'-巯基胸苷5'-三磷酸代谢产物具有抑制作用。二硫化物在CEM / 0和Molt4 / C8细胞中的细胞抑制作用似乎强烈依赖于非核苷二硫化物部分的性质，并且在保留抗逆转录病毒活性方面降低了。
• Methods for analysis of gene expression
  申请人：——

  公开号：US20020160361A1

  公开（公告）日：2002-10-31

  This invention provides methods, compositions and kits for gene expression analysis and gene expression profiling. The methods of the invention are highly sensitive; have a wide dynamic range; are rapid and inexpensive; have a high throughput; and allow the simultaneous differential analysis of a defined set of genes. The methods, compositions and kits of the invention also provide tools for gene expression data collection and relational data analysis.

  本发明提供了基因表达分析和基因表达谱分析的方法、组合物和试剂盒。本发明的方法灵敏度高、动态范围广、快速且成本低廉、通量大，可同时对一组确定的基因进行差异分析。本发明的方法、组合物和试剂盒还为基因表达数据收集和关系数据分析提供了工具。
• COSSTICK, RICHARD;VYLE, JOSEPH S., TETRAHEDRON LETT., 30,(1989) N5, C. 4093-4096
  作者：COSSTICK, RICHARD、VYLE, JOSEPH S.

  DOI：——

  日期：——