Discovery of Highly Selective and Potent HDAC3 Inhibitors Based on a 2-Substituted Benzamide Zinc Binding Group
作者:Jian Liu、Younong Yu、Joseph Kelly、Deyou Sha、Abdul-Basit Alhassan、Wensheng Yu、Milana M. Maletic、Joseph L. Duffy、Daniel J. Klein、M. Katharine Holloway、Steve Carroll、Bonnie J. Howell、Richard J. O. Barnard、Scott Wolkenberg、Joseph A. Kozlowski
DOI:10.1021/acsmedchemlett.0c00462
日期:2020.12.10
selectivity of histone deacetylase inhibitors (HDACis) is greatly impacted by the zinc binding groups. In an effort to search for novel zinc binding groups, we applied a parallel medicinal chemistry (PMC) strategy to quickly synthesize substituted benzamide libraries. We discovered a series containing 2-substituted benzamides as the zinc binding group which afforded highly selective and potent HDAC3 inhibitors
组蛋白去乙酰化酶抑制剂 (HDACis) 的选择性受锌结合基团的影响很大。为了寻找新的锌结合基团,我们应用平行药物化学 (PMC) 策略快速合成取代的苯甲酰胺文库。我们发现了一系列含有 2-取代苯甲酰胺作为锌结合基团的系列,它们提供了高度选择性和有效的 HDAC3 抑制剂,例如具有 2-甲硫基苯甲酰胺的化合物16。化合物16抑制 HDAC3 的 IC 50为 30 nM,并且比所有其他 HDAC 同种型具有 >300 倍的前所未有的选择性。有趣的是,2-甲硫的微妙的变化,以在一个2-羟基苯甲酰胺20保留 HDAC3 效力,但失去了对 HDAC 1 和 2 的所有选择性。这种选择性的显着差异是由 HDACis 16和20与 HDAC2 结合的 X 射线晶体结构合理化的,揭示了对催化锌离子的不同结合模式。这一系列 HDAC3 选择性抑制剂用作工具化合物,用于研究在 Jurkat 2C4 细胞模型中为