Ncap-[1-11]-OH | 1227750-86-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机聚合物 - 多肽
• 英文名称: Ncap-[1-11]-OH
• 英文别名: N-(5,5-Dimethyl-2-oxohexanoyl)-Gly-L-bMeIle-Gly-L-t-Leu-D-t-Leu-L-t-Leu-D-Ala-L-t-Leu-D-t-Leu-L-Ala-Gly-OH；2-[[(2S)-2-[[(2R)-2-[[(2S)-2-[[(2R)-2-[[(2S)-2-[[(2R)-2-[[(2S)-2-[[2-[[(2S)-2-[[2-[(5,5-dimethyl-2-oxohexanoyl)amino]acetyl]amino]-3,3-dimethylpentanoyl]amino]acetyl]amino]-3,3-dimethylbutanoyl]amino]-3,3-dimethylbutanoyl]amino]-3,3-dimethylbutanoyl]amino]propanoyl]amino]-3,3-dimethylbutanoyl]amino]-3,3-dimethylbutanoyl]amino]propanoyl]amino]acetic acid
• CAS: 1227750-86-8
• 化学式: C₅₇H₁₀₁N₁₁O₁₄
• 分子量: 1164.49
• InChiKey: PJIYEPZJLMJYDN-QZRWQFIVSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.2
• 重原子数：
  82
• 可旋转键数：
  33
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.77
• 拓扑面积：
  375
• 氢给体数：
  12
• 氢受体数：
  14

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3-巯基丙酸乙酯 、 Ncap-[1-11]-OH 在 1-羟基苯并三唑 、 N,N'-二异丙基碳二亚胺 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 24.0h， 生成 Ncap-[1-11]-S(CH2)2CO2Et
  参考文献：
  名称：

  聚乙酰胺B合成亚结构的功能分析：跨膜通道形成肽。

  摘要：

  越长越好： Polytheonamide B是迄今为止鉴定出的最大的非核糖体线性肽，是一种跨膜通道形成肽。现在已经化学合成了其9个亚结构。已经确定了破坏膜和形成离子通道的序列以及增强细胞毒性的序列。

  DOI：

  10.1002/anie.201101533
• 作为产物：
  描述：

  (S)-2-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)-3,3-dimethylpentanoic acid 、 Fmoc-甘氨酸 、 Fmoc-L-丙氨酸 、 Fmoc-D-丙氨酸 、 Fmoc-Gly anhydride 、 Fmoc-L-叔亮氨酸 、 5,5-dimethyl-2-oxohexanoic acid 、 Fmoc-D-叔亮氨酸 在 哌啶 作用下， 以 N-甲基吡咯烷酮 为溶剂， 反应 3.08h， 生成 Ncap-[1-11]-OH
  参考文献：
  名称：

  形成通道的 48-mer 肽聚乙酰胺 B 的固相全合成和双重作用机制

  摘要：

  Polytheonamide B (1) 由于其极其复杂的结构、体外通道形成能力和极强的细胞毒性，是一种独特的肽天然产物。1 的 48 聚体序列包含交替的 d,l-氨基酸，并拥有一系列空间庞大的 β-四取代和氢键形成残基。据信，这些不寻常的结构特征驱动 1 折叠成 4.5 nm 长的管，在质膜上形成跨膜离子通道，并发挥细胞毒性。然而，尽管其潜在的生物学应用，这些不寻常的残基的多次取代显着增加了合成挑战，阻碍了 1 的固相肽合成 (SPPS)。在这项研究中，我们首先通过广泛优化各种因素来解决合成问题。 SPPS。新的保护组策略的适应允许树脂上的 37 聚体肽延长，N 端 11 聚体片段缩合到树脂上。去除 18 个保护基团和树脂以优异的总产率产生了 1 个（4.5%，从 17 个步骤开始 76 个步骤）。SPPS 协议在操作上很简单，并且被证明很容易适应荧光 48 聚体探针 2 的全合成。合成

  DOI：

  10.1021/jacs.8b06755

文献信息

• Total synthesis of the large non-ribosomal peptide polytheonamide B
  作者：Masayuki Inoue、Naoki Shinohara、Shintaro Tanabe、Tomoaki Takahashi、Ken Okura、Hiroaki Itoh、Yuki Mizoguchi、Maiko Iida、Nayoung Lee、Shigeru Matsuoka

  DOI：10.1038/nchem.554

  日期：2010.4

  Polytheonamide B is by far the largest non-ribosomal peptide known at present, and displays extraordinary cytotoxicity (EC50 = 68 pg ml−1, mouse leukaemia P388 cells). Its 48 amino-acid residues include a variety of non-proteinogenic d- and l-amino acids, and the absolute stereochemistry of these amino acids alternate in sequence. These structural features induce the formation of a stable β-strand-type structure, giving rise to an overall tubular structure over 30 Å in length. In a biological setting, this fold is believed to transport cations across the lipid bilayer through a pore, thereby acting as an ion channel. Here, we report the first chemical construction of polytheonamide B. Our synthesis relies on the combination of four key stages: syntheses of non-proteinogenic amino acids, a solid-phase assembly of four fragments of polytheonamide B, silver-mediated connection of the fragments and, finally, global deprotection. The synthetic material now available will allow studies of the relationships between its conformational properties, channel functions and cytotoxicity. Polytheonamide B is a large non-ribosomal peptide with very high bioactivity. The synthesis described here includes the first preparation of several non-proteinogenic amino acids and a general coupling strategy for large non-natural peptides. The synthesis is a key step necessary to understand and utilize the bioactivity of this and similar compounds.

  聚糖酰胺 B 是目前已知的最大的非核糖体肽，具有非凡的细胞毒性（EC50 = 68 pg mlâ1, 小鼠白血病 P388 细胞）。它的 48 个氨基酸残基包括多种非蛋白原性 d 和 l 氨基酸，这些氨基酸的绝对立体化学结构依次交替。这些结构特征促使形成稳定的δ-strand 型结构，从而形成长度超过 30 Ã 的整体管状结构。在生物环境中，这种折叠结构被认为可以通过一个孔隙在脂质双分子层中运输阳离子，从而起到离子通道的作用。在此，我们首次报告了聚神酰胺 B 的化学结构。我们的合成依赖于四个关键阶段的结合：非蛋白源氨基酸的合成、聚草酰胺 B 四个片段的固相组装、银介导的片段连接以及最后的全局脱保护。现在可用的合成材料将有助于研究其构象特性、通道功能和细胞毒性之间的关系。聚神酰胺 B 是一种大型非核糖体多肽，具有极高的生物活性。本文描述的合成包括首次制备几种非蛋白源氨基酸和大型非天然肽的一般偶联策略。该合成是了解和利用该化合物及类似化合物生物活性的关键一步。