4-acetamido-N-[5-[[5-[[5-[[3-[3-(dimethylamino)propylamino]-3-oxopropyl]carbamoyl]-1-methylpyrrol-3-yl]carbamoyl]-1-methylpyrrol-3-yl]carbamoyl]-1-methylpyrrol-3-yl]-1-methylpyrrole-2-carboxamide | 914256-32-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: 4-acetamido-N-[5-[[5-[[5-[[3-[3-(dimethylamino)propylamino]-3-oxopropyl]carbamoyl]-1-methylpyrrol-3-yl]carbamoyl]-1-methylpyrrol-3-yl]carbamoyl]-1-methylpyrrol-3-yl]-1-methylpyrrole-2-carboxamide
• CAS: 914256-32-9
• 化学式: C₃₄H₄₅N₁₁O₆
• 分子量: 703.801
• InChiKey: XPPRSLAYABZUCD-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.2
• 重原子数：
  51
• 可旋转键数：
  15
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.35
• 拓扑面积：
  198
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  乙酸酐 、 4-叔丁氧羰氨基-1-甲基-1H-吡咯-2-苯并噻唑羧酸甲酯 、 4-氨基-1-甲基-1H-吡咯-2-羧酸甲酯 、 N,N-二甲基-1,3-二氨基丙烷 、 alkaline earth salt of/the/ methylsulfuric acid 以22%的产率得到4-acetamido-N-[5-[[5-[[5-[[3-[3-(dimethylamino)propylamino]-3-oxopropyl]carbamoyl]-1-methylpyrrol-3-yl]carbamoyl]-1-methylpyrrol-3-yl]carbamoyl]-1-methylpyrrol-3-yl]-1-methylpyrrole-2-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of distamycin A polyamides targeting G-quadruplex DNA

  摘要：

  已经通过固态方法合成了多个基于二氟氨基酸分子的酰胺链接的寡吡咯，并通过熔化程序测量了它们与人类分子内G四聚体的相互作用。与二氟氨基酸本身相比，这些分子中有几个表现出增强的四聚体与双链DNA结合的比率，其中包括一个具有2,5-二取代吡咯基团的分子。随吡咯基团数量的增加，四聚体的亲和力增强，建议这与混合沟槽/G四聚体堆叠结合模式一致。

  DOI：

  10.1039/b607707b

文献信息

• Synthesis of distamycin A polyamides targeting G-quadruplex DNA
  作者：Michael J. B. Moore、Francisco Cuenca、Mark Searcey、Stephen Neidle

  DOI：10.1039/b607707b

  日期：——

  A number of amide-linked oligopyrroles based on distamycin molecules have been synthesized by solid-state methods, and their interactions with a human intramolecular G-quadruplex have been measured by a melting procedure. Several of these molecules show an enhanced ratio of quadruplex vs. duplex DNA binding compared to distamycin itself, including one with a 2,5-disubstituted pyrrole group. Quadruplex affinity increases with the number of pyrrole groups, and it is suggested that this is consistent with a mixed groove/G-quartet stacking binding mode.

  已经通过固态方法合成了多个基于二氟氨基酸分子的酰胺链接的寡吡咯，并通过熔化程序测量了它们与人类分子内G四聚体的相互作用。与二氟氨基酸本身相比，这些分子中有几个表现出增强的四聚体与双链DNA结合的比率，其中包括一个具有2,5-二取代吡咯基团的分子。随吡咯基团数量的增加，四聚体的亲和力增强，建议这与混合沟槽/G四聚体堆叠结合模式一致。