2-<(2R,3S,4S)-1-benzyl-4-<(tert-butoxycarbonyl)amino>-3-(tert-butyldimethylsiloxy)-5-phenylpentyl>-5-formylimidazole | 159949-20-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: 2-<(2R,3S,4S)-1-benzyl-4-<(tert-butoxycarbonyl)amino>-3-(tert-butyldimethylsiloxy)-5-phenylpentyl>-5-formylimidazole
• 英文别名: tert-butyl N-[(2S,3S,5R)-3-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-(5-formyl-1H-imidazol-2-yl)-1,6-diphenylhexan-2-yl]carbamate
• CAS: 159949-20-9
• 化学式: C₃₃H₄₇N₃O₄Si
• 分子量: 577.839
• InChiKey: GCRGMQKOGXIVMT-FGUUHEIUSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.47
• 重原子数：
  41
• 可旋转键数：
  15
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.48
• 拓扑面积：
  93.3
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-<(2R,3S,4S)-1-benzyl-4-<(tert-butoxycarbonyl)amino>-3-(tert-butyldimethylsiloxy)-5-phenylpentyl>-5-formylimidazole 在 manganese(IV) oxide 、 四丁基氟化铵 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醚 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 5.25h， 生成 [(1S,2S,4R)-1-Benzyl-4-(5-butyryl-1H-imidazol-2-yl)-2-hydroxy-5-phenyl-pentyl]-carbamic acid tert-butyl ester
  参考文献：
  名称：

  含有杂环P1'-P2'酰胺键等排物的基于羟乙烯的HIV-1蛋白酶抑制剂的合理设计，合成和晶体学分析。

  摘要：

  已经完成了HIV-1蛋白酶高效抑制剂的合理设计和合成。抑制剂SB 206343基于源自MVT-101 / HIV-1蛋白酶复合物结构的模型，并包含一个4（5）-酰基咪唑环，可等位取代P1'-P2'酰胺键。 。它是一种竞争性抑制剂，在pH 6.0下的表观抑制常数为0.6 nM。已通过X射线衍射技术以2.3 A的分辨率确定了结合在HIV-1蛋白酶活性位点上的SB 206343的三维结构，并细化为晶体学差异因子R（=σ平行fo // Fc平行/ sigma值），为0.194。抑制剂通过一系列疏水和极性相互作用保持在酶中。咪唑环的N-3参与与结合的水分子的新型氢键相互作用，证明了咪唑环作为等规替代羟基乙烯基HIV-1蛋白酶中P1'-P2'酰胺键的有效性抑制剂。在咪唑环的N-1与Gly-127的羰基之间以及咪唑的酰基羰基氧与Asp-129的酰胺氮之间还存在氢键相互作用，这说明了4（5）的拟肽性质-酰

  DOI：

  10.1021/jm00045a015
• 作为产物：
  描述：

  N-(1,1-dimethylethoxycarbonyl)-5(S)-amino-4(S)-(t-butyldimethylsilyloxy)-6-phenyl-2(R)-(phenylmethyl)hexanoic acid 在 钯 sodium hydroxide 、 氢气 、 1-羟基苯并三唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 50.0h， 生成 2-<(2R,3S,4S)-1-benzyl-4-<(tert-butoxycarbonyl)amino>-3-(tert-butyldimethylsiloxy)-5-phenylpentyl>-5-formylimidazole
  参考文献：
  名称：

  含有杂环P1'-P2'酰胺键等排物的基于羟乙烯的HIV-1蛋白酶抑制剂的合理设计，合成和晶体学分析。

  摘要：

  已经完成了HIV-1蛋白酶高效抑制剂的合理设计和合成。抑制剂SB 206343基于源自MVT-101 / HIV-1蛋白酶复合物结构的模型，并包含一个4（5）-酰基咪唑环，可等位取代P1'-P2'酰胺键。 。它是一种竞争性抑制剂，在pH 6.0下的表观抑制常数为0.6 nM。已通过X射线衍射技术以2.3 A的分辨率确定了结合在HIV-1蛋白酶活性位点上的SB 206343的三维结构，并细化为晶体学差异因子R（=σ平行fo // Fc平行/ sigma值），为0.194。抑制剂通过一系列疏水和极性相互作用保持在酶中。咪唑环的N-3参与与结合的水分子的新型氢键相互作用，证明了咪唑环作为等规替代羟基乙烯基HIV-1蛋白酶中P1'-P2'酰胺键的有效性抑制剂。在咪唑环的N-1与Gly-127的羰基之间以及咪唑的酰基羰基氧与Asp-129的酰胺氮之间还存在氢键相互作用，这说明了4（5）的拟肽性质-酰

  DOI：

  10.1021/jm00045a015