2-<(1R,3S,4S)-1-benzyl-4<(tert-butoxycarbonyl)amino>-3-(tert-butyldimethylsiloxy)-5-phenylpentyl>-5-(1-hydroxy-2-methylpropyl)imidazole | 541552-04-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: 2-<(1R,3S,4S)-1-benzyl-4<(tert-butoxycarbonyl)amino>-3-(tert-butyldimethylsiloxy)-5-phenylpentyl>-5-(1-hydroxy-2-methylpropyl)imidazole
• 英文别名: tert-butyl N-[(2S,3S,5R)-3-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-[5-(1-hydroxy-2-methylpropyl)-1H-imidazol-2-yl]-1,6-diphenylhexan-2-yl]carbamate
• CAS: 541552-04-9
• 化学式: C₃₆H₅₅N₃O₄Si
• 分子量: 621.936
• InChiKey: MOIGKZDNRWWUDN-JRMWXBRESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  8.34
• 重原子数：
  44
• 可旋转键数：
  16
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  96.5
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-<(1R,3S,4S)-1-benzyl-4<(tert-butoxycarbonyl)amino>-3-(tert-butyldimethylsiloxy)-5-phenylpentyl>-5-(1-hydroxy-2-methylpropyl)imidazole 在 manganese(IV) oxide 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 以90%的产率得到2-<(1R,3S,4S)-1-benzyl-4<(tert-butoxycarbonyl)amino>-3-(tert-butyldimethylsiloxy)-5-phenylpentyl>-5-(2-methylpropionyl)imidazole
  参考文献：
  名称：

  含有杂环P1'-P2'酰胺键等排物的基于羟乙烯的HIV-1蛋白酶抑制剂的合理设计，合成和晶体学分析。

  摘要：

  已经完成了HIV-1蛋白酶高效抑制剂的合理设计和合成。抑制剂SB 206343基于源自MVT-101 / HIV-1蛋白酶复合物结构的模型，并包含一个4（5）-酰基咪唑环，可等位取代P1'-P2'酰胺键。 。它是一种竞争性抑制剂，在pH 6.0下的表观抑制常数为0.6 nM。已通过X射线衍射技术以2.3 A的分辨率确定了结合在HIV-1蛋白酶活性位点上的SB 206343的三维结构，并细化为晶体学差异因子R（=σ平行fo // Fc平行/ sigma值），为0.194。抑制剂通过一系列疏水和极性相互作用保持在酶中。咪唑环的N-3参与与结合的水分子的新型氢键相互作用，证明了咪唑环作为等规替代羟基乙烯基HIV-1蛋白酶中P1'-P2'酰胺键的有效性抑制剂。在咪唑环的N-1与Gly-127的羰基之间以及咪唑的酰基羰基氧与Asp-129的酰胺氮之间还存在氢键相互作用，这说明了4（5）的拟肽性质-酰

  DOI：

  10.1021/jm00045a015
• 作为产物：
  描述：

  (2R,4S,5S)-2-benzyl-5-<(tert-butoxycarbonyl)amino>-4-(tert-butyldimethylsiloxy)-N-(isoxazol-4-yl)-6-phenylhexanamide 在 钯 sodium hydroxide 、 氢气 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醚 为溶剂， 反应 26.25h， 生成 2-<(1R,3S,4S)-1-benzyl-4<(tert-butoxycarbonyl)amino>-3-(tert-butyldimethylsiloxy)-5-phenylpentyl>-5-(1-hydroxy-2-methylpropyl)imidazole
  参考文献：
  名称：

  含有杂环P1'-P2'酰胺键等排物的基于羟乙烯的HIV-1蛋白酶抑制剂的合理设计，合成和晶体学分析。

  摘要：

  已经完成了HIV-1蛋白酶高效抑制剂的合理设计和合成。抑制剂SB 206343基于源自MVT-101 / HIV-1蛋白酶复合物结构的模型，并包含一个4（5）-酰基咪唑环，可等位取代P1'-P2'酰胺键。 。它是一种竞争性抑制剂，在pH 6.0下的表观抑制常数为0.6 nM。已通过X射线衍射技术以2.3 A的分辨率确定了结合在HIV-1蛋白酶活性位点上的SB 206343的三维结构，并细化为晶体学差异因子R（=σ平行fo // Fc平行/ sigma值），为0.194。抑制剂通过一系列疏水和极性相互作用保持在酶中。咪唑环的N-3参与与结合的水分子的新型氢键相互作用，证明了咪唑环作为等规替代羟基乙烯基HIV-1蛋白酶中P1'-P2'酰胺键的有效性抑制剂。在咪唑环的N-1与Gly-127的羰基之间以及咪唑的酰基羰基氧与Asp-129的酰胺氮之间还存在氢键相互作用，这说明了4（5）的拟肽性质-酰

  DOI：

  10.1021/jm00045a015

文献信息

• Rational Design, Synthesis, and Crystallographic Analysis of a Hydroxyethylene-Based HIV-1 Protease Inhibitor Containing a Heterocyclic P1'-P2' Amide Bond Isostere
  作者：Scott K. Thompson、Krishna H. M. Murthy、Baoguang Zhao、Evon Winborne、David W. Green、Seth M. Fisher、Renee L. DesJarlais、Thaddeus A. Jr. Tomaszek、Thomas D. Meek

  DOI：10.1021/jm00045a015

  日期：1994.9

  factor, R (= sigma parallel Fo magnitude of/Fc parallel/sigma magnitude of), of 0.194. The inhibitor is held in the enzyme by a set of hydrophobic and polar interactions. N-3 of the imidazole ring participates in a novel hydrogen-bonding interaction with the bound water molecule, demonstrating the effectiveness of the imidazole ring as an isosteric replacement for the P1'--P2' amide bond in hydroxyethylene-based

  已经完成了HIV-1蛋白酶高效抑制剂的合理设计和合成。抑制剂SB 206343基于源自MVT-101 / HIV-1蛋白酶复合物结构的模型，并包含一个4（5）-酰基咪唑环，可等位取代P1'-P2'酰胺键。 。它是一种竞争性抑制剂，在pH 6.0下的表观抑制常数为0.6 nM。已通过X射线衍射技术以2.3 A的分辨率确定了结合在HIV-1蛋白酶活性位点上的SB 206343的三维结构，并细化为晶体学差异因子R（=σ平行fo // Fc平行/ sigma值），为0.194。抑制剂通过一系列疏水和极性相互作用保持在酶中。咪唑环的N-3参与与结合的水分子的新型氢键相互作用，证明了咪唑环作为等规替代羟基乙烯基HIV-1蛋白酶中P1'-P2'酰胺键的有效性抑制剂。在咪唑环的N-1与Gly-127的羰基之间以及咪唑的酰基羰基氧与Asp-129的酰胺氮之间还存在氢键相互作用，这说明了4（5）的拟肽性质-酰