(2S)-2-[[(2S)-2-[(3,5-dinitrobenzoyl)amino]propanoyl]amino]propanoic acid | 464925-59-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: (2S)-2-[[(2S)-2-[(3,5-dinitrobenzoyl)amino]propanoyl]amino]propanoic acid
• CAS: 464925-59-5
• 化学式: C₁₃H₁₄N₄O₈
• 分子量: 354.276
• InChiKey: CLUBHTGQKUGOML-BQBZGAKWSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.6
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.31
• 拓扑面积：
  187
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  L-丙氨酰-L-丙氨酸 、 2,5-dioxopyrrolidin-1-yl 3,5-dinitrobenzoate 在 碳酸氢钠 作用下， 以 水 为溶剂， 生成 (2S)-2-[[(2S)-2-[(3,5-dinitrobenzoyl)amino]propanoyl]amino]propanoic acid
  参考文献：
  名称：

  金鸡纳生物碱衍生的手性选择剂对肽对映体的手性识别：通过液相色谱，NMR光谱和分子建模的机理研究。

  摘要：

  研究了基于金鸡纳生物碱的手性选择剂对N-保护的肽对映体的手性识别机理。衍生自该选择剂的手性固定相用于液相色谱对映体分离。它显示了对二烷胺的（all-R）-和（all-S）-对映异构体的异常高对映体识别度（alpha = 20），而在肽主链中插入了额外的丙氨酸残基后，手性识别能力明显下降。通过手性选择剂和分析物对映异构体的配合物的NMR光谱，伴随分子建模研究，对这种对映选择性的降低进行了详细研究。分子内NOE的研究提供了选择器的自由和复杂形式的构象状态。对络合物引起的转变的分析产生了分子间相互作用的信息，使我们能够提出结合模型，观察分子间NOE进一步支持了结合模型，表明选择剂和分析物的相对排列。随机分子动力学模拟能够重现色谱保留顺序和能量差异，以及分子间NOE。计算数据用于评估负责分析物结合的分子间作用力。另外，评估了手性选择剂的片段对对映选择性结合事件的相对贡献。

  DOI：

  10.1021/jo0346914

文献信息

• Direct High-Performance Liquid Chromatographic Separation of Peptide Enantiomers:  Study on Chiral Recognition by Systematic Evaluation of the Influence of Structural Features of the Chiral Selectors on Enantioselectivity
  作者：Christoph Czerwenka、Michael Lämmerhofer、Norbert M. Maier、Kari Rissanen、Wolfgang Lindner

  DOI：10.1021/ac020372l

  日期：2002.11.1

  All-R/all-S enantiomers of oligoalanines (Alan, n = 1−10) with N-terminal protection group have been separated by HPLC on chiral stationary phases based on various cinchona alkaloid selectors. Structure−enantioselectivity relationships derived by extensive selector structure optimization provided insights into binding mechanisms and chiral recognition. Their interpretation was supported by X-ray crystal structures of amino acid and dipeptide, respectively, in complex with chiral selector. Optimized selectors have bulky elements representing steric barriers and deep binding pockets that afforded very high enantioselectivities; e.g., for the all-R and all-S enantiomers of N-(3,5-dinitrobenzoyl)alanylalanine, an α-value of 20.0 (corresponding to ΔΔG of −7.43 kJ/mol) was obtained with a chiral stationary phase based on 6‘-(neopentoxy)-9-O-tert-butylcarbamoylcinchonidine. Further, a chiral stationary phase based on 1,4-bis(9-O-quinidinyl)phthalazine was able to distinguish between the all-R and all-S enantiomers of hepta- to decaalanine peptides with enantioselectivity values between 1.8 and 1.9, corresponding to ΔΔG of −1.46 and −1.59 kJ/mol, respectively.

  利用基于各种金鸡纳生物碱选择剂的手性固定相，通过高效液相色谱法分离了带有 N 端保护基团的低聚丙氨酸（Alan，n = 1-10）的全 R/ 全 S 对映异构体。通过对选择剂结构的广泛优化，得出了结构-对映体选择性关系，从而深入了解了结合机制和手性识别。氨基酸和二肽分别与手性选择剂复合的 X 射线晶体结构支持了对它们的解释。优化后的选择子具有代表立体障碍的笨重元素和深结合口袋，可提供非常高的对映选择性；例如，全 R 和全 S 手性选择子的对映选择性都非常高、对于 N-(3,5-二硝基苯甲酰)丙氨酰丙氨酸的全-R 和全-S 对映体，使用基于 6'-（新戊氧基）-9-O-叔丁基氨基甲酰基辛可尼丁的手性固定相，可获得 20.0 的 α 值（对应于 -7.43 kJ/mol 的 ΔΔG）。此外，基于 1,4-双（9-O-奎宁基）酞嗪的手性固定相能够区分七至十丙氨酸肽的全 R 和全 S 对映体，对映体选择性值介于 1.8 和 1.9 之间，对应的 ΔΔG 分别为 -1.46 和 -1.59 kJ/mol。
• Chiral Recognition of Peptide Enantiomers by Cinchona Alkaloid Derived Chiral Selectors:  Mechanistic Investigations by Liquid Chromatography, NMR Spectroscopy, and Molecular Modeling
  作者：Christoph Czerwenka、Mei Mei Zhang、Hanspeter Kählig、Norbert M. Maier、Kenny B. Lipkowitz、Wolfgang Lindner

  DOI：10.1021/jo0346914

  日期：2003.10.1

  The chiral recognition mechanism of a cinchona alkaloid based chiral selector for N-protected peptide enantiomers was investigated. A chiral stationary phase derived from this selector was employed for liquid chromatographic enantiomer separations. It showed exceptionally high enantiomer discrimination for the (all-R)- and (all-S)-enantiomers of dialanine (alpha = 20), while a pronounced loss of chiral

  研究了基于金鸡纳生物碱的手性选择剂对N-保护的肽对映体的手性识别机理。衍生自该选择剂的手性固定相用于液相色谱对映体分离。它显示了对二烷胺的（all-R）-和（all-S）-对映异构体的异常高对映体识别度（alpha = 20），而在肽主链中插入了额外的丙氨酸残基后，手性识别能力明显下降。通过手性选择剂和分析物对映异构体的配合物的NMR光谱，伴随分子建模研究，对这种对映选择性的降低进行了详细研究。分子内NOE的研究提供了选择器的自由和复杂形式的构象状态。对络合物引起的转变的分析产生了分子间相互作用的信息，使我们能够提出结合模型，观察分子间NOE进一步支持了结合模型，表明选择剂和分析物的相对排列。随机分子动力学模拟能够重现色谱保留顺序和能量差异，以及分子间NOE。计算数据用于评估负责分析物结合的分子间作用力。另外，评估了手性选择剂的片段对对映选择性结合事件的相对贡献。