Arg-Tyr-Leu-Pro-Thr | 72273-85-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: Arg-Tyr-Leu-Pro-Thr
• 英文别名: proctolin；RYLPT；(2S,3R)-2-[[(2S)-1-[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-amino-5-(diaminomethylideneamino)pentanoyl]amino]-3-(4-hydroxyphenyl)propanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]pyrrolidine-2-carbonyl]amino]-3-hydroxybutanoic acid
• CAS: 72273-85-9；72273-86-0；72273-87-1；72273-88-2；72282-50-9；57966-42-4
• 化学式: C₃₀H₄₈N₈O₈
• 分子量: 648.76
• InChiKey: KKUPPLMEDQDAJX-UEHMALFGSA-N

物化性质

• 密度：
  1.43±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -4.5
• 重原子数：
  46
• 可旋转键数：
  17
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  276
• 氢给体数：
  9
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Arg-Tyr-Leu-Pro-Thr 、 N-琥珀酰亚胺 3-碘苯甲酸酯 以 1,4-二氧六环 为溶剂， 反应 0.5h， 生成
  参考文献：
  名称：

  使用位置异构体、氘标记和分子动力学模拟探索肽中的自由基迁移途径

  摘要：

  理解肽中自由基定向解离的关键之一是详细了解介导自由基迁移的因素。肽基可以通过多种方式产生；然而，在大多数情况下，最初产生的自由基必须迁移到其他位置以促进断裂，例如骨架裂解或侧链丢失。本文通过比较邻位、间位和对位的结果来检查自由基迁移的动力学几种肽的-苯甲酰基位置异构体。由几个正交自由基引发剂产生的受限环肽的异构体也被探测为电荷状态的函数。累积起来，结果表明自由基位置的微小变化可以显着影响自由基迁移，肽的整体结构灵活性也是一个重要的控制因素。对邻位与间位或对位敏感的肽 RGYALG 的一个特别有趣的途径一组氘标记的肽完全绘制了取代。然后，这些数据用于优化基于分子动力学的模拟中的参数，随后用于进一步深入了解对自由基迁移动力学影响最大的结构基础。 在新窗口中打开图片

  DOI：

  10.1007/s13361-012-0540-6
• 作为产物：
  描述：

  Boc-O-苄基-L-酪氨酸 在 N-羟基丁二酰亚胺 、 甲烷磺酸 、 tetrafluoroacetic acid 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 生成 Arg-Tyr-Leu-Pro-Thr
  参考文献：
  名称：

  Konopinska, Danuta; Kazanowska, Bernarda; Sobotka, Wieslaw, Bulletin of the Polish Academy of Sciences: Chemistry, 1986, vol. 34, # 7-8, p. 327 - 331

  摘要：

  DOI：

文献信息

• Incorporation of fluoroprolines to proctolin: Study on the effect of a fluorine atom toward peptidic conformation
  作者：Takamasa Kitamoto、Taeko Ozawa、Megumi Abe、Shunsuke Marubayashi、Takashi Yamazaki

  DOI：10.1016/j.jfluchem.2007.12.005

  日期：2008.4

  In spite of quite small steric perturbation, substitution of proline (Pro) in the target pentapeptide proctolin (Arg-Tyr-Leu-Pro-Thr) for (4R)- as well as (4S)-4-fluoroproline led to apparent alteration of the pyrrolidine ring structure which eventually resulted in the significant conformational change of the whole molecules which was assumed on the basis of their NOESY spectra. (C) 2008 Elsevier B.V. All rights reserved.
• Bmp Gene and Fusion Protein
  申请人：Hidaka Chisa

  公开号：US20080260829A1

  公开（公告）日：2008-10-23

  This invention relates to BMP fusion genes, BMP fusion proteins. The invention further relates to methods for treatment using BMP fusion genes and BMP fusion proteins. Additionally, the invention relates to BMP fusion gene and BMP fusion protein pharmaceutical compositions.
• Konopinska, Danuta; Kazanowska, Bernarda; Sobotka, Wieslaw, Bulletin of the Polish Academy of Sciences: Chemistry, 1986, vol. 34, # 7-8, p. 327 - 331
  作者：Konopinska, Danuta、Kazanowska, Bernarda、Sobotka, Wieslaw、Boguslawska-Jaworska, Janina

  DOI：——

  日期：——
• Exploring Radical Migration Pathways in Peptides with Positional Isomers, Deuterium Labeling, and Molecular Dynamics Simulations
  作者：Xing Zhang、Ryan R. Julian

  DOI：10.1007/s13361-012-0540-6

  日期：2013.4.1

  the peptide RGYALG that is sensitive to ortho versus meta or para substitution was fully mapped out by a suite of deuterium labeled peptides. This data was then used to optimize parameters in molecular dynamics-based simulations, which were subsequently used to obtain further insight into the structural underpinnings that most strongly influence the kinetics of radical migration. Open image in new

  理解肽中自由基定向解离的关键之一是详细了解介导自由基迁移的因素。肽基可以通过多种方式产生；然而，在大多数情况下，最初产生的自由基必须迁移到其他位置以促进断裂，例如骨架裂解或侧链丢失。本文通过比较邻位、间位和对位的结果来检查自由基迁移的动力学几种肽的-苯甲酰基位置异构体。由几个正交自由基引发剂产生的受限环肽的异构体也被探测为电荷状态的函数。累积起来，结果表明自由基位置的微小变化可以显着影响自由基迁移，肽的整体结构灵活性也是一个重要的控制因素。对邻位与间位或对位敏感的肽 RGYALG 的一个特别有趣的途径一组氘标记的肽完全绘制了取代。然后，这些数据用于优化基于分子动力学的模拟中的参数，随后用于进一步深入了解对自由基迁移动力学影响最大的结构基础。 在新窗口中打开图片