5-iodo-2-methylpyrimidin-4-amine | 1239738-87-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 5-iodo-2-methylpyrimidin-4-amine
• CAS: 1239738-87-4
• 化学式: C₅H₆IN₃
• 分子量: 235.027
• InChiKey: TWNRXGLTMILAOX-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.9
• 重原子数：
  9
• 可旋转键数：
  0
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.2
• 拓扑面积：
  51.8
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-iodo-2-methylpyrimidin-4-amine 在 N-氯代丁二酰亚胺 、 copper(l) iodide 、 1,1'-双(二苯膦基)二茂铁二氯化钯(II)二氯甲烷复合物 、 potassium tert-butylate 、 三乙胺 作用下， 以 N-甲基吡咯烷酮 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 8.0h， 生成 5-chloro-2-methyl-6-propyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine
  参考文献：
  名称：

  基于片段的先导发现，以确定靶向丙酮酸脱氢酶激酶 ATP 结合位点的新型抑制剂

  摘要：

  基于片段的先导发现方法应用于丙酮酸脱氢酶激酶 (PDHK)，以发现具有新化学型的 ATP 结合位点抑制剂。针对 PDHK4 的 X 射线片段筛选提供了片段命中1，在 ATP 结合位点的深袋中具有特征性相互作用。虽然已知的抑制剂利用深袋中的几个水分子形成水介导的氢键相互作用，但片段命中与疏水基团在袋中更深地结合。口袋中剩余水分子的置换导致鉴定出抑制效力显着提高的先导化合物7。这种先导化合物具有高配体效率 (LE) 并显示出不错的选择性。两种额外的先导化合物通过合并另一个片段命中2 的结构信息生成具有三环和双环核心的新支架的10和13。这些新型抑制剂在深口袋中的特征相互作用提供了关于 PDHKs ATP 结合位点的新结构见解，并为 PDHKs 抑制剂的开发开辟了新方向。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2021.116283

文献信息

• Fragment-based lead discovery to identify novel inhibitors that target the ATP binding site of pyruvate dehydrogenase kinases
  作者：Tatsuo Akaki、Yuki Bessho、Takashi Ito、Shingo Fujioka、Minoru Ubukata、Genki Mori、Kenji Yamanaka、Takuya Orita、Satoki Doi、Tomoko Iwanaga、Kazutaka Ikegashira、Yoshiji Hantani、Isao Nakanishi、Tsuyoshi Adachi

  DOI：10.1016/j.bmc.2021.116283

  日期：2021.8

  A fragment-based lead discovery approach was applied to Pyruvate Dehydrogenase Kinases (PDHKs) to discover inhibitors against the ATP binding site with novel chemotypes. X-ray fragment screening toward PDHK4 provided a fragment hit 1 with a characteristic interaction in a deep pocket of the ATP binding site. While known inhibitors utilize several water molecules in a deep pocket to form water-mediated

  基于片段的先导发现方法应用于丙酮酸脱氢酶激酶 (PDHK)，以发现具有新化学型的 ATP 结合位点抑制剂。针对 PDHK4 的 X 射线片段筛选提供了片段命中1，在 ATP 结合位点的深袋中具有特征性相互作用。虽然已知的抑制剂利用深袋中的几个水分子形成水介导的氢键相互作用，但片段命中与疏水基团在袋中更深地结合。口袋中剩余水分子的置换导致鉴定出抑制效力显着提高的先导化合物7。这种先导化合物具有高配体效率 (LE) 并显示出不错的选择性。两种额外的先导化合物通过合并另一个片段命中2 的结构信息生成具有三环和双环核心的新支架的10和13。这些新型抑制剂在深口袋中的特征相互作用提供了关于 PDHKs ATP 结合位点的新结构见解，并为 PDHKs 抑制剂的开发开辟了新方向。