δ-(L-α-aminoadipoyl)-L-homocysteinyl-D-valine | 117056-56-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: δ-(L-α-aminoadipoyl)-L-homocysteinyl-D-valine
• 英文别名: N-[(5s)-5-Amino-5-Carboxypentanoyl]-L-Homocysteyl-D-Valine；(2S)-2-amino-6-[[(2S)-1-[[(1R)-1-carboxy-2-methylpropyl]amino]-1-oxo-4-sulfanylbutan-2-yl]amino]-6-oxohexanoic acid
• CAS: 117056-56-1
• 化学式: C₁₅H₂₇N₃O₆S
• 分子量: 377.462
• InChiKey: WDPVNDRNBJNETA-JBLDHEPKSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.4
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.73
• 拓扑面积：
  160
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  δ-(L-α-aminoadipoyl)-L-homocysteinyl-D-valine 生成 (2S)-2-amino-6-[[(3S,5S)-1-[(1R)-1-carboxy-2-methylpropyl]-5-hydroxy-2-oxopyrrolidin-3-yl]amino]-6-oxohexanoic acid
  参考文献：
  名称：

  BALDWIN, JACK E.;NORRIS, WILLIAM J.;FREEMAN, RICHARD T.;BRADLEY, MARK;ADL+, J. CHEM. SOC. CHEM. COMMUN.,(1988) N 16, C. 1128-1130

  摘要：

  DOI：
• 作为产物：
  描述：

  Z(NO2)-Aad-ONb 在 溶剂黄146 、 二异丙胺 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 、 锌 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 90.0h， 生成 δ-(L-α-aminoadipoyl)-L-homocysteinyl-D-valine
  参考文献：
  名称：

  异青霉素N合酶的底物特异性。

  摘要：

  两种来源的高纯度异青霉素N合酶（IPNS）（天然存在于产黄青霉菌中，并通过顶头孢霉的克隆基因在大肠杆菌中表达）已被分离并在体外用于测试天然底物的合成修饰（L -α-氨基-δ-己二酰基）-L-半胱氨酸-D-缬氨酸（ACV）。利用一种非常敏感的程序，利用β-内酰胺诱导β-内酰胺酶的合成，来确定ACV类似物是否可以用作IPNS的底物。检查了多种氨基和羧基末端三肽取代，发现它们引起了正的β-内酰胺酶诱导曲线。但是，没有发现这些修饰能够像ACV一样有效地用作底物。由IPNS和三肽类似物反应形成的一种β-内酰胺产物是独立合成的，并具有抗菌活性。在ACV第二个位置修饰L-半胱氨酸残基导致三肽不能用作底物。ACV第三位的D-缬氨酸残基转化为芳香族氨基酸或高负电性残基（如三氟缬氨酸）会导致底物活性消除和酶抑制剂的产生。

  DOI：

  10.1021/jm00088a028

文献信息

• The Interaction of Isopenicillin N Synthase with Homologated Substrate Analogues δ-(<scp>L</scp>-α-Aminoadipoyl)-<scp>L</scp>-homocysteinyl-<scp>D</scp>-Xaa Characterised by Protein Crystallography
  作者：Adam Daruzzaman、Ian J. Clifton、Robert M. Adlington、Jack E. Baldwin、Peter J. Rutledge

  DOI：10.1002/cbic.201200728

  日期：2013.3.18

  Loose fit: IPNS catalyses the central step in penicillin biosynthesis. Substrate analogues containing L‐homocysteine in place of the natural substrate's L‐cysteine residue are not converted into bicyclic products. Crystal structures for IPNS complexes with two such analogues reveal that the additional CH2 unit affords considerable conformational freedom when these analogues bind to IPNS.

  宽松：IPNS催化青霉素生物合成的关键步骤。包含L-高半胱氨酸代替天然底物L-半胱氨酸残基的底物类似物不会转化为双环产物。具有两个这样的类似物的IPNS配合物的晶体结构表明，当这些类似物与IPNS结合时，额外的CH 2单元可提供相当的构象自由度。
• γ-Lactam formation from tripeptides with isopenicillin N synthase
  作者：Jack E. Baldwin、William J. Norris、Richard T. Freeman、Mark Bradley、Robert M. Adlington、Sadie Long-Fox、Christopher J. Schofield

  DOI：10.1039/c39880001128

  日期：——

  Incubation of isopenicillin N synthase (IPNS) with analogues of the natural substrate [(5S)-5-amino-5-carboxypentanoyl]-L-cysteinyl-D-valine (2) in which the cysteinyl residue was replaced by homocysteine gave epimeric 5-hydroxy γ-lactams (10), with no evidence for the formation of bicyclic products.

  将异openicillin N合酶（IPNS）与天然底物[（5 S）-5-氨基-5-羧基戊酰基] -L-半胱氨酸-D-缬氨酸（2）的类似物一起孵育，其中半胱氨酸残基被高半胱氨酸取代，产生了差向异构5-羟基γ-内酰胺（10），没有形成双环产物的证据。