异
戊烯二
磷酸异构酶 (IDI) 催化异
戊烯二
磷酸 (
IPP) 和二甲基烯丙基二
磷酸 (
DMAPP) 的相互转化。这是甲羟
戊酸进入类
异戊二烯生物合成途径的必要步骤。I 型 IDI 催化的异构化涉及
IPP 或
DMAPP 中碳-碳双键的质子化以形成叔碳正离子,然后去质子化。合成了
DMAPP(E-2-
OPP 和 Z-2-
OPP)和
IPP(4-
OPP)的二烯类似物,发现它们是该酶的有效活性部位定向不可逆
抑制剂。大肠杆菌 IDI 和 4-
OPP 之间的 EI 复合物的 X 射线分析表明,存在两种异构体,它们在
抑制剂的烃链中新形成的 C3-C4 双键的立体
化学上存在差异。在两种加合物中,
抑制剂的 C5 都与 C67 的
硫相连。在这些结构中,4-
OPP 中二烯部分质子化时形成的甲基位于 E116 附近,表明该残基参与了质子化步骤。