7-phenyl-1-(3,4-dichlorobenzyl)-2-aminobenzimidazole | 1224624-75-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并咪唑类
• 英文名称: 7-phenyl-1-(3,4-dichlorobenzyl)-2-aminobenzimidazole
• 英文别名: 1-(3,4-Dichlorobenzyl)-7-Phenyl-1h-Benzimidazol-2-Amine；1-[(3,4-dichlorophenyl)methyl]-7-phenylbenzimidazol-2-amine
• CAS: 1224624-75-2
• 化学式: C₂₀H₁₅Cl₂N₃
• 分子量: 368.265
• InChiKey: JFVMZMBFRZPOFF-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.6
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.05
• 拓扑面积：
  43.8
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  2

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2-硝基联苯 在 3-氯苯甲酰乙腈 、 potassium tert-butylate 、 copper(l) chloride 、 tin(ll) chloride 、 potassium hydroxide 作用下， 以 乙醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 20.67h， 生成 7-phenyl-1-(3,4-dichlorobenzyl)-2-aminobenzimidazole 、 1-(3,4-dichlorobenzyl)-4-phenyl-1H-benzo[d]imidazol-2-amine
  参考文献：
  名称：

  布氏锥虫蝶啶还原酶 1 新型抑制剂的设计、合成和生物学评价

  摘要：

  遗传研究表明，蝶啶还原酶 1 (PTR1) 对原生动物寄生虫布氏锥虫的生存至关重要。在此，我们描述了基于苯并[ d ]咪唑-2-胺衍生物的一系列新型 PTR1 抑制剂的开发和优化。报告了 33 种化合物的数据。该系列最初是由虚拟筛选活动发现的 ( J. Med. Chem ., 2009 , 52, 4454)。这些抑制剂采用了一种替代天然配体生物蝶呤和二氢生物蝶呤以及经典抑制剂如甲氨蝶呤的结合模式。同时使用合理的基础结构药物化学和方法，我们能够与针对有效的活性化合物派生锥虫PTR1（= 7 N中号），其具有在人类和高选择性布氏锥虫二氢叶酸还原酶。不幸的是，这些化合物对寄生虫的活性很弱。动力学研究和分析表明，细胞效力不足的主要原因是化合物对酶的效力不足，从低K m到K i可以看出比率（分别为K m =25 n M和K i =2.3 n M）。

  DOI：

  10.1002/cmdc.201000450

文献信息

• One Scaffold, Three Binding Modes: Novel and Selective Pteridine Reductase 1 Inhibitors Derived from Fragment Hits Discovered by Virtual Screening
  作者：Chidochangu P. Mpamhanga、Daniel Spinks、Lindsay B. Tulloch、Emma J. Shanks、David A. Robinson、Iain T. Collie、Alan H. Fairlamb、Paul G. Wyatt、Julie A. Frearson、William N. Hunter、Ian H. Gilbert、Ruth Brenk

  DOI：10.1021/jm900414x

  日期：2009.7.23

  The enzyme pteridine reductase 1 (PTR1) is a potential target for new compounds to treat human African trypanosomiasis. A virtual screening campaign for fragments inhibiting PTR1 was carried out. Two novel chemical series were identified containing aminobenzothiazole and aminobenzimidazole scaffolds, respectively. One of the hits (2-amino-6-chloro-benzimidazole) was subjected to crystal structure analysis and a high resolution crystal structure in complex with PTR1 was obtained, confirming the predicted binding mode. However, the crystal structures of two analogues (2-amino-benzimidazole and 1-(3,4-dichloro-benzyl)-2-amino-benzimidazole) in complex with PTR1 revealed two alternative binding modes. In these complexes, previously unobserved protein movements and water-mediated protein-ligand contacts occurred, which prohibited a correct prediction of the binding modes. On the basis of the alternative binding mode of 1-(3,4-dichloro-benzyl)-2-amino-benzimidazole, derivatives were designed and selective PTR1 inhibitors with low nanomolar potency and favorable physicochemical properties were obtained.