几种抗叶酸剂,包括甲氧苄
氨嘧啶 (
TMP) 和一系列炔丙基连接的类似物,可结合来自
炭疽芽孢杆菌的二氢叶酸还原酶(BaDHFR) 的亲和力低于其他细菌物种的典型亲和力。为了指导 BaDHFR 的先导优化,我们探索了一种确定结构-活性关系的新方法,由此酶被改变而类似物保持不变,从根本上扭转了标准的实验设计。酶的活性位点突变体 Ba(F96I)DHFR 和 Ba(Y102F)DHFR 被创建并用酶抑制测定和晶体结构进行评估。对于 Y102F 突变体,抗叶酸剂的亲和力增加了 60 倍,这表明与 Tyr 102 的相互作用对亲和力至关重要。与
TMP 和炔丙基连接的
抑制剂结合的酶的晶体结构揭示了
TMP 抗性的基础,并阐明了 Tyr 102 对
嘧啶和芳环之间的亲脂性接头的影响。