Length and rigidity of the spacer impact on aldose reductase inhibition of the 5F-like ARIs in a dual-occupied mode
作者:Yancong Zeng、Ziyou Zheng、Meili Yin、Jiahao Li、Jun Xu、Yinying Tang、Kun Zhang、Zhijun Liu、Shijian Chen、Pinghua Sun、Heru Chen
DOI:10.1016/j.bioorg.2022.106300
日期:2023.2
The primary objective of this study was to investigate the structure–activity relationship of a new series of 5F-like Aldose Reductase Inhibitors (ARIs) using in silico docking method. In this perspective, 6 novel ARIs have been designed and synthesized. Evaluation of the inhibition of these compounds to ALR2 was carried on with epalrestat and 5F as the references. It was found that the spacer of 5F-like
本研究的主要目的是使用计算机对接方法研究一系列新的5F样醛糖还原酶抑制剂 (ARI)的结构-活性关系。从这个角度来看,已经设计并合成了 6 种新颖的 ARI。以依帕司他和5F为参比,评价这些化合物对ALR2的抑制作用。发现5F -like ARIs的间隔区对其抑制活性有很大影响。长度等于 3 ∼ 4 个碳的烷基链的刚性间隔基带来更好的抑制活性。其中,化合物4b被验证为最活跃的ARIs,其IC 50值为16.8 ± 1.3 nM。此外,使用 AutoDock 4.2的计算机对接研究以及使用 GROMACS 2022.1 的分子模拟表明,类似5F的 ARIs采用双占据模式。相互作用能(-25 至 -74 kcal/mol)以及 MM-GBSA 结合自由能(-37 至 -65 kcal/mol)与其 ALR2 抑制常数(2000 至 16.8 nM)呈正相关。对接相互作用很好地解释了构效关系。此后为5F类