1-(β-D-2′-deoxyribofuranosyl)-5,6-dichloro-1H-benzimidazole | 4600-73-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并咪唑类
• 英文名称: 1-(β-D-2′-deoxyribofuranosyl)-5,6-dichloro-1H-benzimidazole
• 英文别名: 5,6-dichloro-1-(2-deoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)benzimidazole；(2r,3s,5r)-5-(5,6-Dichlorobenzimidazol-1-yl)-2-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-3-ol；(2R,3S,5R)-5-(5,6-dichlorobenzimidazol-1-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-ol
• CAS: 4600-73-1
• 化学式: C₁₂H₁₂Cl₂N₂O₃
• 分子量: 303.145
• InChiKey: PESSKGMTBFGAGJ-QJPTWQEYSA-N

物化性质

• 熔点：
  168-169 °C
• 沸点：
  563.4±60.0 °C(predicted)
• 密度：
  1.72±0.1 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.1
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.42
• 拓扑面积：
  67.5
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-(β-D-2′-deoxyribofuranosyl)-5,6-dichloro-1H-benzimidazole 在 吡啶 、 N-溴代丁二酰亚胺(NBS) 、 sodium carbonate 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 乙醇 为溶剂， 反应 0.15h， 生成 2-bromo-5,6-dichloro-1-(2-deoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)benzimidazole
  参考文献：
  名称：

  设计，合成和取代的苯并咪唑的2-脱氧-D-核糖苷作为人类巨细胞病毒感染的潜在药物的抗病毒评估。

  摘要：

  2,5,6-三氯苯并咪唑（1b），2-溴-5,6-二氯苯并咪唑（1c），5,6-二氯苯并咪唑（1d），5,6-二氯苯并咪唑-2-硫酮（1e），5的立体选择性糖基化带有2-deoxy-3的1,6-二氯-2-（甲硫基）苯并咪唑（1f），2-（苄硫基）-5,6-二氯苯并咪唑（1g）和2-氯-5,6-二甲基苯并咪唑（1h），获得了5-二-对-甲苯甲酰基-α-D-赤型五呋喃糖酰氯，得到所需的β-核苷2b-h。随后的脱保护得到相应的游离β-D-2-脱氧核糖苷3b-h。通过用甲醇甲醇钠处理2b来合成2-甲氧基衍生物3i。用叠氮化锂置换2b的2-氯基，然后去除保护基，得到2-叠氮基-5，6-二氯苯并咪唑衍生物（5）。通过在阮内镍上氢解5获得2-氨基衍生物（6）。使用2'-脱氧尿苷（7），N-脱氧核糖呋喃糖基转移酶和1d制备5,6-二氯-2-异丙基氨基-1-（2-脱氧-β-D-赤-呋喃呋喃糖基）苯并咪唑（1

  DOI：

  10.1080/15257770008033000
• 作为产物：
  描述：

  5-甲基苯并咪唑 生成 1-(β-D-2′-deoxyribofuranosyl)-5,6-dichloro-1H-benzimidazole
  参考文献：
  名称：

  设计，合成和取代的苯并咪唑的2-脱氧-D-核糖苷作为人类巨细胞病毒感染的潜在药物的抗病毒评估。

  摘要：

  2,5,6-三氯苯并咪唑（1b），2-溴-5,6-二氯苯并咪唑（1c），5,6-二氯苯并咪唑（1d），5,6-二氯苯并咪唑-2-硫酮（1e），5的立体选择性糖基化带有2-deoxy-3的1,6-二氯-2-（甲硫基）苯并咪唑（1f），2-（苄硫基）-5,6-二氯苯并咪唑（1g）和2-氯-5,6-二甲基苯并咪唑（1h），获得了5-二-对-甲苯甲酰基-α-D-赤型五呋喃糖酰氯，得到所需的β-核苷2b-h。随后的脱保护得到相应的游离β-D-2-脱氧核糖苷3b-h。通过用甲醇甲醇钠处理2b来合成2-甲氧基衍生物3i。用叠氮化锂置换2b的2-氯基，然后去除保护基，得到2-叠氮基-5，6-二氯苯并咪唑衍生物（5）。通过在阮内镍上氢解5获得2-氨基衍生物（6）。使用2'-脱氧尿苷（7），N-脱氧核糖呋喃糖基转移酶和1d制备5,6-二氯-2-异丙基氨基-1-（2-脱氧-β-D-赤-呋喃呋喃糖基）苯并咪唑（1

  DOI：

  10.1080/15257770008033000

文献信息

• Deoxynucleosides with benzimidazoles as aglycone moiety are potent anticancer agents
  作者：Mirosława Koronkiewicz、Zdzisław Chilmonczyk、Zygmunt Kazimerczuk、Andrzej Orzeszko

  DOI：10.1016/j.ejphar.2017.12.018

  日期：2018.2

  and implies a protective role for the kinases against cell death. Downregulation of these enzymes by chemical methods promotes apoptosis in cells. The aim of the present study was to explore the anticancer activity of inhibitors of protein kinases CK2 and PIM-1 on neoplastic cell lines in vitro. We studied a series of deoxynucleosides with various tetrahalobenzimidazoles as aglycone moiety. Cytotoxicity

  在许多癌症病例中，CK2和PIM-1丝氨酸/苏氨酸激酶的含量异常高。细胞中CK2和PIM-1的升高需要抑制细胞凋亡，并暗示激酶对细胞死亡具有保护作用。通过化学方法将这些酶下调可促进细胞凋亡。本研究的目的是探讨蛋白激酶CK2和PIM-1抑制剂在体外对肿瘤细胞系的抗癌活性。我们研究了一系列以各种四卤代苯并咪唑类作为糖苷配基的脱氧核苷。通过流式细胞术和其他方法确定了细胞毒性，被测抑制剂诱导的凋亡，线粒体膜电位，胱天蛋白酶的活性，细胞周期进程的变化以及作用机制。结果表明，所研究的化合物，例如1-（β-D-2'-deoxyribofuranosyl）-4,5,6,7-tetrabromo-1H-benzimidazole，称为K164（也称为TDB），具有多种细胞毒性和促凋亡功效在细胞系中。我们的结果表明，所测试的化合物是用于靶向治疗的潜在抗癌药，尤其是在治疗髓样白血病和雄激素反应性前列腺癌中。
• Introduction of pseudo-base benzimidazole derivatives into nucleosides via base exchange by a nucleoside metabolic enzyme
  作者：Akihiko Hatano、Riki Matsuzaka、Genki Shimane、Hiroyuki Wakana、Kou Suzuki、Chisato Nishioka、Aoi Kojima、Masatoshi Kidowaki

  DOI：10.1016/j.bmc.2023.117411

  日期：2023.8

  organic synthesis, biocatalysis using enzymes provides a more stereoselective and cost-effective approach. Synthesis of unnatural nucleosides by nucleoside base exchange reactions using nucleoside-metabolizing enzymes has previously shown that the 5-position recognition of pyrimidine bases on nucleoside substrates is loose and can be used to introduce functional molecules into pyrimidine nucleosides. Here

  在替代有机合成中，使用酶的生物催化提供了一种更具立体选择性和成本效益的方法。使用核苷代谢酶通过核苷碱基交换反应合成非天然核苷先前表明，核苷底物上嘧啶碱基的5位识别是松散的，可用于将功能分子引入嘧啶核苷中。在这里，我们探索了通过嘧啶核苷磷酸化酶（PyNP）的碱基交换反应将嘌呤假碱基掺入核苷中，证明咪唑五元环是该反应的必要结构。就苯并咪唑而言，碱基交换产生脱氧核糖形式，产率 96%，核糖形式，产率 23%。该反应还用 1 H-咪唑并[4,5-b]吩嗪（一种带有附加环的苯并咪唑类似物）进行，尽管核苷的产率仅为 31%。1 H和咪唑并[4,5-b]吩嗪核苷与 PyNP (PDB 1BRW) 活性位点之间的对接模拟H-咪唑并[4,5-b]吩嗪可以用作 PyNP 的底物。因此，使用PyNP的酶促取代反应可用于将许多嘌呤假碱基和具有各种官能团的苯并咪唑衍生物掺入核苷结构中，其具有作为诊断或治疗剂的潜在用途。
• WO2020016782A5
  申请人：——

  公开号：WO2020016782A5

  公开（公告）日：2022-07-14
• Design, Synthesis, and Antiviral Evaluation of 2-Deoxy-D-Ribosides of Substituted Benzimidazoles as Potential Agents for Human Cytomegalovirus Infections
  作者：Ruiming Zou、Etsuko Kawashima、George A. Freeman、George W. Koszalka、John C. Drach、Leroy B. Townsend

  DOI：10.1080/15257770008033000

  日期：2000.1

  Stereoselective glycosylation of 2,5,6-trichlorobenzimidazole (1b), 2-bromo-5,6-dichlorobenzimidazole (1c), 5,6-dichlorobenzimidazole (1d), 5,6-dichlorobenzimidazole-2-thione (1e), 5,6-dichloro-2-(methylthio)benzimidazole (1f), 2-(benzylthio)-5,6-dichlorobenzimidazole (1g), and 2-chloro-5,6-dimethylbenzimidazole (1h) with 2-deoxy-3,5-di-O-p-toluoyl-alpha-D-erythro-pentofuranosyl chloride was achieved to give the

  2,5,6-三氯苯并咪唑（1b），2-溴-5,6-二氯苯并咪唑（1c），5,6-二氯苯并咪唑（1d），5,6-二氯苯并咪唑-2-硫酮（1e），5的立体选择性糖基化带有2-deoxy-3的1,6-二氯-2-（甲硫基）苯并咪唑（1f），2-（苄硫基）-5,6-二氯苯并咪唑（1g）和2-氯-5,6-二甲基苯并咪唑（1h），获得了5-二-对-甲苯甲酰基-α-D-赤型五呋喃糖酰氯，得到所需的β-核苷2b-h。随后的脱保护得到相应的游离β-D-2-脱氧核糖苷3b-h。通过用甲醇甲醇钠处理2b来合成2-甲氧基衍生物3i。用叠氮化锂置换2b的2-氯基，然后去除保护基，得到2-叠氮基-5，6-二氯苯并咪唑衍生物（5）。通过在阮内镍上氢解5获得2-氨基衍生物（6）。使用2'-脱氧尿苷（7），N-脱氧核糖呋喃糖基转移酶和1d制备5,6-二氯-2-异丙基氨基-1-（2-脱氧-β-D-赤-呋喃呋喃糖基）苯并咪唑（1