碱基修饰的荧光
核糖核苷类似物探针是监测RNA结构和功能的有价值的工具,因为它们与天然核碱基的结构非常相似。特别是
2-氨基嘌呤,一种对环境高度敏感的
腺苷类似物,是使用最广泛的荧光核苷类似物。但是,只有少数适用于探查RNA分子的结构和识别特性的等排
嘧啶嘧啶核糖核苷类似物可用。本文中,我们描述了衍生自标记
吲哚N的一小部分碱基修饰的
嘧啶核糖核苷类似物的合成和光物理特性-甲基
吲哚和
苯并呋喃到尿
嘧啶的5位上。一种基于5-(
苯并呋喃-2-基)
嘧啶核的类似物,以合理的量子产率在可见光区域显示发射光,重要的是显示出优异的溶剂致变色性。通过T7 RNA聚合酶将相应的
三磷酸底物有效地掺入寡
核糖核苷酸中以产生荧光寡
核糖核苷酸构建体。用荧光寡
核糖核苷酸构建体进行的稳态和时间分辨光谱研究表明,荧光
核糖核苷对生色团与邻近碱基之间的相互作用所引起的环境中的细微变化做出了光物理反应。特别是,如果将
核糖核苷掺入到寡
核糖核