2-羟基-4-氨基嘧啶-5-羧酸 | 3650-93-9

• 物质功能分类: 医药中间体 - 杂环化合物 - 嘧啶类化合物
• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 中文名称: 2-羟基-4-氨基嘧啶-5-羧酸
• 英文名称: 5-carboxycytosine
• 英文别名: 5-carboxylcytosine；5-Carboxy-cytosin；Cytosine-5-carboxylic acid；6-amino-2-oxo-1H-pyrimidine-5-carboxylic acid
• CAS: 3650-93-9
• 化学式: C₅H₅N₃O₃
• mdl: MFCD00047368
• 分子量: 155.113
• InChiKey: BLQMCTXZEMGOJM-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 熔点：
  256-257 °C
• 密度：
  1.88±0.1 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  可溶于水基（轻微）

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.9
• 重原子数：
  11
• 可旋转键数：
  1
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.0
• 拓扑面积：
  105
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  4

安全信息

• 危险等级：
  IRRITANT
• 海关编码：
  2933599090
• WGK Germany：
  3
• 危险性防范说明：
  P261,P301+P312,P302+P352,P304+P340,P305+P351+P338
• 危险性描述：
  H302,H315,H319,H335

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-羟基-4-氨基嘧啶-5-羧酸 在 氯化铵 作用下， 以 N-甲基吡咯烷酮 为溶剂， 反应 8.0h， 以87%的产率得到胞嘧啶
  参考文献：
  名称：

  一种胞嘧啶的合成方法

  摘要：

  本发明公开了一种胞嘧啶的合成方法，该方法利用氰乙酸乙酯、尿素、原甲酸三乙酯为原料，依次合成-氰基-2-脲基丙烯酸乙酯、5-乙氧羰基胞嘧啶、5-羧基胞嘧啶、脱羧合成胞嘧啶，并通过细化、修正和完善各步骤工艺，使得合成方法产率高，总收率最高可以达到75.14%，最终提高综合效益，该方法操作简单，实际生产存在困难小，便于规模化应用。

  公开号：

  CN103992278B
• 作为产物：
  描述：

  5-甲基-2'-脱氧胞苷 在 盐酸 、 水 、 Ce⁽⁴⁺⁾*6NO₃^(1-)*C₃₀H₂₇FeN₅O⁽²⁺⁾ 作用下， 反应 63.0h， 生成 2-羟基-4-氨基嘧啶-5-羧酸
  参考文献：
  名称：

  仿生铁复合物实现 TET 酶反应性**

  摘要：

  表观遗传标记 5-甲基-2'-脱氧胞苷 (5mdC) 是最常见的 DNA 修饰。它尤其通过主动去甲基化途径被去除：通过10-11易位5-甲基胞嘧啶双加氧酶(TET)氧化，随后通过碱基切除修复或直接解修饰去除。最近，我们发现合成的铁(IV)-氧配合物[Fe IV (O)(Py 5 Me 2 H)] 2+ ( 1 )可以通过氧化核碱基5-甲基胞嘧啶作为TET的仿生模型(5mC) 与其天然代谢物。在这项工作中，我们使用一系列 HPLC 和 MS 技术证明核苷甚至短寡核苷酸链也可以作为底物。我们发现5mC的5位优选被1氧化，副反应仅发生在所用寡核苷酸的链末端。对1对核苷反应性的详细研究证实了我们的结果；异头中心 (1') 的氧化是最常见的副反应。

  DOI：

  10.1002/anie.202107277

文献信息

• Human Caliciviruses Are a Significant Pathogen of Acute Sporadic Diarrhea in Children of Santiago, Chile
  作者：Miguel L. O'Ryan、Nora Mamani、Aldo Gaggero、Luis Fidel Avendaño、Susana Prieto、Alfredo Peña、Xi Jiang、David O. Matson

  DOI：10.1086/315874

  日期：2000.11

  Human caliciviruses (HuCVs) are increasingly recognized as common pathogens that cause acute sporadic diarrhea in children; however, regional antigenic and genetic diversity complicate detection techniques. Stool samples from children seeking medical attention in 2 outpatient clinics, a large emergency department, and 2 hospital wards were evaluated for HuCVs by reverse transcription—polymerase chain reaction, using primers based on a conserved sequence of the polymerase region of a previously sequenced Chilean strain. HuCVs were detected in 53 (8%) of 684 children 1 month to 5 years of age (mean, 13 months). Detection occurred year-round without a clear seasonal peak, and detection frequency declined from 16% in 1997 to 2% in 1999. The decline may have been due to a change in virus genotype. HuCVs are a significant pathogen of acute sporadic diarrhea in Chilean children, and continuous characterization of genetic diversity will be crucial for appropriate detection.

  人杯状病毒（HuCVs）作为一种常见的病原体，导致儿童急性散发性腹泻的作用日益受到重视；然而，其抗原性和遗传学的区域多样性复杂化了检测技术。本研究采用逆转录-聚合酶链反应，以基于先前智利分离株的聚合酶区域保守序列设计的引物，对两所门诊诊所、一家大型急诊科和两家医院病房中因病就诊的儿童粪便样本进行了HuCVs检测。在684名1个月至5岁的儿童中（平均年龄13个月），有53名（8%）检出HuCVs。检测全年均有发生，无明显季节高峰，且检出频率从1997年的16%下降至1999年的2%。这种下降可能归因于病毒基因型的改变。HuCVs是智利儿童急性散发性腹泻的重要病原体，而持续对遗传多样性进行表征对于正确检测至关重要。
• Cyclization Dichotomy of Esters of 3-Ureido-2-cyano-2-propenoic and 3-Ureido-2-acyl-2-propenoic Acids
  作者：Miroslav Ledvina、Jiří Farkaš

  DOI：10.1135/cccc19941841

  日期：——

  The preparation of E and Z isomers of 3-ureido-2-cyano-2-propenoates Ia - Id and their base-catalyzed isomerization and cyclization to 5-carboxycytosine derivatives IIa - IIf and 5-cyanouracil derivatives IIIa and IIIb is described. Also described is the preparation of 3-ureido-2-acyl-2-propenoates Va - Vd and their base-catalyzed cyclization to 5-carboxy-2(1H)-pyrimidone derivatives VIa - VIc and 5-acyluracils VIIa - VIIc.

  描述了3-脲基-2-氰基-2-丙烯酸酯的Ia - Id的E和Z异构体的制备，以及它们的碱催化异构化和环化到5-羧基胞嘧啶衍生物IIa - IIf和5-氰基尿嘧啶衍生物IIIa和IIIb。还描述了3-脲基-2-酰基-2-丙烯酸酯Va - Vd的制备及其碱催化环化到5-羧基-2(1H)-嘧啶酮衍生物VIa - VIc和5-酰基尿嘧啶VIIa - VIIc。
• Photochemical Deamination and Demethylation of 5-Methylcytosine
  作者：Eric Privat、Lawrence C. Sowers

  DOI：10.1021/tx950182o

  日期：1996.1.1

  gas chromatography/mass spectrometry. Deamination of 5mC to thymine proceeds via formation of the intermediate photohydrate. Formation of 5-substituted cytosine derivatives results from oxidation of the 5-methyl group with initial formation of 5-(hydroxymethyl)cytosine (hmC). Upon exposure to UV light, hmC is converted to cytosine. The conversion of hmC to cytosine likely results from photohydration and

  据信胞嘧啶甲基化在真核细胞发育以及病毒潜伏期中起关键作用。我们一直在研究扰动甲基化模式的化学机制，包括紫外线辐射的影响。我们观察到，在暴露于紫外线下，通过气相色谱/质谱法分析，5-甲基胞嘧啶（5mC）转化为胸腺嘧啶，胞嘧啶和一系列5-取代的胞嘧啶衍生物。5mC的胸腺嘧啶脱氨过程通过形成中间体光合水合物进行。5-取代的胞嘧啶衍生物的形成是由于5-甲基的氧化以及5-（羟甲基）胞嘧啶（hmC）的初始形成。暴露于紫外线下，hmC转化为胞嘧啶。hmC向胞嘧啶的转化可能是由于光合作用和甲醛清除所致。有人提出内源性氧化和水解可以导致DNA中5mC残基的去甲基化。尽管已经广泛讨论了5mC水解为胸腺嘧啶的脱氨反应，但尚未描述5mC的脱甲基作用。
• Excision of 5-Carboxylcytosine by Thymine DNA Glycosylase
  作者：Lakshmi S. Pidugu、Qing Dai、Shuja S. Malik、Edwin Pozharski、Alexander C. Drohat

  DOI：10.1021/jacs.9b10376

  日期：2019.11.27

  epigenetic mark that is written by methyltransferases, erased through passive and active mechanisms, and impacts transcription, development, diseases including cancer, and aging. Active DNA demethylation involves TET-mediated stepwise oxidation of mC to 5-hydroxymethylcytosine, 5-formylcytosine (fC), or 5-carboxylcytosine (caC), excision of fC or caC by thymine DNA glycosylase (TDG), and subsequent

  5-甲基胞嘧啶 (mC) 是一种表观遗传标记，由甲基转移酶写入，通过被动和主动机制擦除，影响转录、发育、疾病（包括癌症）和衰老。主动 DNA 去甲基化包括 TET 介导的 mC 逐步氧化为 5-羟甲基胞嘧啶、5-甲酰胞嘧啶 (fC) 或 5-羧基胞嘧啶 (caC)，胸腺嘧啶 DNA 糖基化酶 (TDG) 切除 fC 或 caC，以及随后的碱基切除修复。这个基本过程的许多元素定义不明确，包括 caC 的 TDG 切除。为了解决这个问题，我们解决了与 DNA 结合的人类 TDG 的高分辨率结构，其中 cadC（5-羧基-2΄-脱氧胞苷）翻转到其活性位点。这些结构揭示了介导 caC 识别和去除的详细酶-底物相互作用，其中许多涉及水分子。重要的，两个水分子接触 caC 的羧酸氧并准备促进酸催化的 caC 切除。此外，TDG 中依赖于底物的构象变化调节这些水之一的氢键相互作用，从而实现与 caC 的有效相互作用。发现对
• TET‐Like Oxidation in 5‐Methylcytosine and Derivatives: A Computational and Experimental Study
  作者：Niko S. W. Jonasson、Rachel Janßen、Annika Menke、Fabian L. Zott、Hendrik Zipse、Lena J. Daumann

  DOI：10.1002/cbic.202100420

  日期：2021.12.2

  The reactivity of a biomimetic iron(IV)-oxo complex 1 towards a number of methylated cytosine and uracil substrates was investigated. The reaction rates are in very good agreement with the calculated BDEs. C-Methylated compounds such as 5mC, T and 5miC possess a different reactivity than the solely N-methylated compounds 1mC and 1mU.

  研究了仿生铁 (IV)-氧复合物1对多种甲基化胞嘧啶和尿嘧啶底物的反应性。反应速率与计算的 BDE 非常吻合。 C-甲基化化合物如 5mC、T 和 5m i C 具有与单独的N-甲基化化合物 1mC 和 1mU 不同的反应性。