ethyl 6-[(dimethylamino)methyl]-4H-thieno[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate | 15811-13-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 噻吩并吡咯类
• 英文名称: ethyl 6-[(dimethylamino)methyl]-4H-thieno[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate
• 英文别名: 6-(dimethylamino-methyl)-4H-thieno[3,2-b]pyrrole-5-carboxylic acid ethyl ester；6-Dimethylaminomethyl-5-ethoxycarbonyl-thieno<3,2-b>-pyrrol；6-Dimethylaminomethyl-5-carbethoxy-thieno<3.2-b>pyrrol
• CAS: 15811-13-9
• 化学式: C₁₂H₁₆N₂O₂S
• 分子量: 252.337
• InChiKey: YCYZWCLFMYRGQT-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.2
• 重原子数：
  17
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.42
• 拓扑面积：
  73.6
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  ethyl 6-[(dimethylamino)methyl]-4H-thieno[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate 在 potassium carbonate 作用下， 以 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 47.5h， 生成 methyl 6-(methoxymethyl)-4-methyl-thieno[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  Thieno [3,2 - b ]吡咯-5-羧酰胺是组蛋白赖氨酸脱甲基酶KDM1A / LSD1的新型可逆抑制剂。第1部分：高通量筛选和初步探索

  摘要：

  赖氨酸特异性脱甲基酶1 KDM1A（LSD1）调节组蛋白甲基化，并日益被认为是肿瘤学中潜在的治疗靶标。我们报告了使用时间分辨荧光共振能量转移（TR-FRET）技术在KDM1A / CoREST上进行的高通量筛选活动，以鉴定可逆抑制剂。筛选导致115个结果，我们确定了它们的生化IC 50，从而确定了四个化学系列。经过数据分析，我们确定了N-苯基-4 H-噻吩并[3，2- b ]吡咯-5-羧酰胺的化学系列的优先级，为此，我们获得了最有力的X射线结构（化合物19，IC 50= 2.9μM）与酶复合。该化学类别的最初扩展，包括修饰核心结构和修饰苯甲酰胺部分，都指向负责与酶相互作用的部分的定义。初步优化产生了化合物90，该化合物具有亚微摩尔IC 50（0.162μM）抑制酶，能够抑制细胞中的靶标。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.6b01018
• 作为产物：
  描述：

  3-(3-nitro-thiophen-2-yl)-2-oxo-propionic acid ethyl ester 在 盐酸 、 tin(ll) chloride 作用下， 以 乙醇 、 溶剂黄146 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 ethyl 6-[(dimethylamino)methyl]-4H-thieno[3,2-b]pyrrole-5-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  Preparation and Reactions of 5-Carbethoxythieno[3,2-b]pyrrole and Some of Its Derivatives^1,2

  摘要：

  DOI：

  10.1021/jo01031a012

文献信息

• Synthesis of 6-substituted thieno[3,2-b]pyrroles
  作者：Ronald L. Keener、Frederick S. Skelton、Harold Ray Snyder

  DOI：10.1021/jo01268a011

  日期：1968.4
• Preparation and Reactions of 5-Carbethoxythieno[3,2-b]pyrrole and Some of Its Derivatives^1,2
  作者：Walter W. Gale、Alan N. Scott、H. R. Snyder

  DOI：10.1021/jo01031a012

  日期：1964.8
• Thieno[3,2-<i>b</i>]pyrrole-5-carboxamides as New Reversible Inhibitors of Histone Lysine Demethylase KDM1A/LSD1. Part 1: High-Throughput Screening and Preliminary Exploration
  作者：Luca Sartori、Ciro Mercurio、Federica Amigoni、Anna Cappa、Giovanni Fagá、Raimondo Fattori、Elena Legnaghi、Giuseppe Ciossani、Andrea Mattevi、Giuseppe Meroni、Loris Moretti、Valentina Cecatiello、Sebastiano Pasqualato、Alessia Romussi、Florian Thaler、Paolo Trifiró、Manuela Villa、Stefania Vultaggio、Oronza A. Botrugno、Paola Dessanti、Saverio Minucci、Elisa Zagarrí、Daniele Carettoni、Lucia Iuzzolino、Mario Varasi、Paola Vianello

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.6b01018

  日期：2017.3.9

  increasingly recognized as a potential therapeutic target in oncology. We report on a high-throughput screening campaign performed on KDM1A/CoREST, using a time-resolved fluorescence resonance energy transfer (TR-FRET) technology, to identify reversible inhibitors. The screening led to 115 hits for which we determined biochemical IC50, thus identifying four chemical series. After data analysis, we have

  赖氨酸特异性脱甲基酶1 KDM1A（LSD1）调节组蛋白甲基化，并日益被认为是肿瘤学中潜在的治疗靶标。我们报告了使用时间分辨荧光共振能量转移（TR-FRET）技术在KDM1A / CoREST上进行的高通量筛选活动，以鉴定可逆抑制剂。筛选导致115个结果，我们确定了它们的生化IC 50，从而确定了四个化学系列。经过数据分析，我们确定了N-苯基-4 H-噻吩并[3，2- b ]吡咯-5-羧酰胺的化学系列的优先级，为此，我们获得了最有力的X射线结构（化合物19，IC 50= 2.9μM）与酶复合。该化学类别的最初扩展，包括修饰核心结构和修饰苯甲酰胺部分，都指向负责与酶相互作用的部分的定义。初步优化产生了化合物90，该化合物具有亚微摩尔IC 50（0.162μM）抑制酶，能够抑制细胞中的靶标。