N,N-dimethyl-2-(pyridin-2-yl)-1H-benzo[d]imidazol-5-amine | 889664-39-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并咪唑类
• 英文名称: N,N-dimethyl-2-(pyridin-2-yl)-1H-benzo[d]imidazol-5-amine
• 英文别名: 5-Dimethylamino-2-(2-pyridinyl)-benzoimidazole；N,N-dimethyl-2-pyridin-2-yl-3H-benzimidazol-5-amine
• CAS: 889664-39-5
• 化学式: C₁₄H₁₄N₄
• 分子量: 238.292
• InChiKey: YSTYZQZKGJVGQY-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.2
• 重原子数：
  18
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.14
• 拓扑面积：
  44.8
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N,N-dimethyl-2-(pyridin-2-yl)-1H-benzo[d]imidazol-5-amine 在 4-二甲氨基吡啶 、 N-乙基二丙胺 、 sodium methylate 、 sodium hydride 作用下， 以 吡啶 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基乙酰胺 为溶剂， 反应 5.5h， 生成 1-[5-N,N-dimethylamino-2-(2-pyridinyl)benzimidazole]-1'-α-deoxyriboside-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl) ether-3'-O-(2-cyanoethyl N,N-diisopropylphosphoramidite)
  参考文献：
  名称：

  用 DNA 构建模块检测金属离子：荧光吡啶并苯并咪唑核苷

  摘要：

  我们描述了具有 2-pyrido-2-benzimidazole 和 2-quino-2-benzimidazole 作为苷元的新型荧光 N-脱氧核糖苷 (1 和 2)。这些化合物是从以前未知的杂环前体和霍弗氯糖制备的，主要产物是 α 端基异构体。X 射线晶体结构证实了几何结构，并表明吡啶和苯并咪唑环系统在固态下的共面性分别偏离了 154 度和 140 度。在甲醇中，化合物 1 和 2 分别在 360 和 370 nm 处具有最大吸收，在 494 和 539 nm 处具有最大发射。实验揭示了核苷对甲醇中 17 种单价、二价和三价金属离子的不同荧光响应。一种或两种核苷随着 10 种金属离子显示出显着变化。配体-核苷 1 最显着的光谱变化包括荧光红移（Au(+)、Au(3+)）、强猝灭（Cu(2+)、Ni(2+)、Pt(2+)）、和发射强度的显着增强以及红移（Ag(+)、Cd(2+)、Zn(2+)）。配体-核苷

  DOI：

  10.1021/ja0581806
• 作为产物：
  描述：

  5-二甲基氨基-2-硝基苯胺 在 palladium on activated charcoal sodium tetrahydroborate 作用下， 以 甲醇 、 乙酸乙酯 、 硝基苯 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 N,N-dimethyl-2-(pyridin-2-yl)-1H-benzo[d]imidazol-5-amine
  参考文献：
  名称：

  用 DNA 构建模块检测金属离子：荧光吡啶并苯并咪唑核苷

  摘要：

  我们描述了具有 2-pyrido-2-benzimidazole 和 2-quino-2-benzimidazole 作为苷元的新型荧光 N-脱氧核糖苷 (1 和 2)。这些化合物是从以前未知的杂环前体和霍弗氯糖制备的，主要产物是 α 端基异构体。X 射线晶体结构证实了几何结构，并表明吡啶和苯并咪唑环系统在固态下的共面性分别偏离了 154 度和 140 度。在甲醇中，化合物 1 和 2 分别在 360 和 370 nm 处具有最大吸收，在 494 和 539 nm 处具有最大发射。实验揭示了核苷对甲醇中 17 种单价、二价和三价金属离子的不同荧光响应。一种或两种核苷随着 10 种金属离子显示出显着变化。配体-核苷 1 最显着的光谱变化包括荧光红移（Au(+)、Au(3+)）、强猝灭（Cu(2+)、Ni(2+)、Pt(2+)）、和发射强度的显着增强以及红移（Ag(+)、Cd(2+)、Zn(2+)）。配体-核苷

  DOI：

  10.1021/ja0581806

文献信息

• INHIBITORS OF INV(16) LEUKEMIA
  申请人：The University of Virginia Patent Foundation

  公开号：EP3670509A1

  公开（公告）日：2020-06-24

  This invention describes the development of targeted small molecule inhibitors of the inv(16) fusion, the causative agent in ∼12% of acute myeloid leukemia (AML). The inv(16) fusion results in expression of the CBFβ-SMMHC fusion protein in the blood cells of afflicted patients. The present invention provides compounds which inhibit the function of both CBFβ and the CBFβ-SMMHC fusion. These compounds block the growth of an inv(16) leukemia cell line as well as increase its apoptosis, while showing minimal effects against non inv(16) cell lines. As a mechanism to develop inhibitors with selectivity for the CBFβ-SMMHC fusion protein, the present invention further provides dimeric derivatives of these compounds which show both increased potency as well as selectivity for CBFβ-SMMHC. These compounds show potent inhibition of an inv(16) leukemia cell line with minimal effects on non inv(16) cell lines. Analysis of the pharmacokinetics of the developed compounds has made it possible to improve the lifetime of the compound in the plasma of mice to a level commensurate with long-term treatment.

  本发明描述了 inv(16) 融合的靶向小分子抑制剂的开发，inv(16) 融合是 12% 的急性髓性白血病（AML）的致病因子。inv（16）融合会导致患者血细胞中表达 CBFβ-SMMHC 融合蛋白。本发明提供了抑制 CBFβ 和 CBFβ-SMMHC 融合蛋白功能的化合物。这些化合物能阻断inv(16)白血病细胞系的生长，并增加其凋亡，同时对非inv(16)细胞系的影响极小。作为开发对 CBFβ-SMMHC 融合蛋白具有选择性的抑制剂的机制，本发明进一步提供了这些化合物的二聚衍生物，它们对 CBFβ-SMMHC 具有更高的效力和选择性。这些化合物对 inv(16) 白血病细胞系具有强效抑制作用，而对非 inv(16) 细胞系的影响极小。通过对所开发化合物的药代动力学分析，可以将化合物在小鼠血浆中的存活时间延长到与长期治疗相称的水平。
• Cancer therapeutics
  申请人：UNIVERSITY OF VIRGINIA PATENT FOUNDATION

  公开号：US10562890B2

  公开（公告）日：2020-02-18

  This invention relates to compounds that bind to wild-type CBFβ and inhibit CBFβ binding to RUNX proteins. The potent compounds of the invention inhibit this protein-protein interaction at low micromolar concentrations, using allosteric mechanism to achieve inhibition, displace wild-type CBFβ from RUNX1 in cells, change occupancy of RUNX1 on target genes, and alter gene expression of RUNX1 target genes. These inhibitors show clear biological effects consistent with on-target RUNX protein activity. Pharmaceutical compositions containing a compound of the invention and a pharmaceutically acceptable carrier represent a separate embodiment of the invention. Another embodiment of the invention are methods of treating a RUNX-signaling-dependent cancer that expresses wild-type CBFβ in a subject in need thereof by administering to the subject a therapeutically effective amount of a compound of the invention. In one embodiment, the cancer is selected from the group consisting of a RUNX-signaling-dependent leukemia that expresses wild-type CBFβ, lung cancer, bladder cancer, ovarian cancer, uterine cancer, endometrial cancer, breast cancer, liver cancer, pancreatic cancer, stomach cancer, cervical cancer, lymphoma, leukemia, acute myeloid leukemia, acute lymphocytic leukemia, salivary gland cancer, bone cancer, brain cancer, colon cancer, rectal cancer, colorectal cancer, kidney cancer, skin cancer, melanoma, squamous cell carcinoma of the tongue, pleomorphic adenoma, hepatocellular carcinoma, pancreatic cancer, squamous cell carcinoma, and/or adenocarcinoma. In another embodiment, the compounds of the invention can be used to treat a leukemia, lung cancer, ovarian cancer, and/or breast cancer.

  本发明涉及与野生型 CBFβ 结合并抑制 CBFβ 与 RUNX 蛋白结合的化合物。本发明的强效化合物可在低微摩尔浓度下抑制这种蛋白-蛋白相互作用，利用异构机制实现抑制作用，将细胞中的野生型 CBFβ 从 RUNX1 中置换出来，改变 RUNX1 对靶基因的占有率，并改变 RUNX1 靶基因的基因表达。这些抑制剂显示出与靶上 RUNX 蛋白活性一致的明显生物效应。含有本发明化合物和药学上可接受的载体的药物组合物代表了本发明的另一个实施方案。本发明的另一个实施方案是通过向有需要的受试者施用治疗有效量的本发明化合物来治疗表达野生型 CBFβ 的 RUNX 信号依赖性癌症的方法。在一个实施方案中，所述癌症选自由表达野生型 CBFβ 的 RUNX 信号依赖性白血病、肺癌、膀胱癌、卵巢癌、子宫癌、子宫内膜癌、乳腺癌、肝癌、胰腺癌、胃癌、宫颈癌、淋巴瘤、白血病、急性髓性白血病、急性淋巴细胞白血病、急性淋巴细胞白血病、急性髓细胞白血病、急性淋巴细胞白血病、唾液腺癌、骨癌、脑癌、结肠癌、直肠癌、结直肠癌、肾癌、皮肤癌、黑色素瘤、舌鳞癌、多形性腺瘤、肝细胞癌、胰腺癌、鳞状细胞癌和/或腺癌。在另一个实施方案中，本发明的化合物可用于治疗白血病、肺癌、卵巢癌和/或乳腺癌。
• CANCER THERAPEUTICS
  申请人：University Of Virginia Patent Foundation

  公开号：EP3180004B1

  公开（公告）日：2021-01-06
• US8748618B2
  申请人：——

  公开号：US8748618B2

  公开（公告）日：2014-06-10
• US9221764B2
  申请人：——

  公开号：US9221764B2

  公开（公告）日：2015-12-29