N⁶-benzoyl-3'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-5',8-cyclo-5'-oxo-2'-deoxyadenosine | 211919-87-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 咪唑并嘧啶类
• 英文名称: N⁶-benzoyl-3'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-5',8-cyclo-5'-oxo-2'-deoxyadenosine
• 英文别名: N-[(1R,12S,13S)-13-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-11-oxo-15-oxa-2,4,6,9-tetrazatetracyclo[10.2.1.02,10.03,8]pentadeca-3,5,7,9-tetraen-7-yl]benzamide
• CAS: 211919-87-8
• 化学式: C₂₃H₂₇N₅O₄Si
• 分子量: 465.584
• InChiKey: BFXLGYRJSMKDIQ-DAYGRLMNSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.95
• 重原子数：
  33
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.43
• 拓扑面积：
  108
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N⁶-benzoyl-3'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-5',8-cyclo-5'-oxo-2'-deoxyadenosine 在 sodium tetrahydroborate 作用下， 以 吡啶 、 甲醇 为溶剂， 反应 5.0h， 生成 (5'S)-N⁶-benzoyl-3'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-5',8-cyclo-2'-deoxyadenosine
  参考文献：
  名称：

  Site-Specific Introduction of (5‘S)-5‘,8-Cyclo-2‘-deoxyadenosine into Oligodeoxyribonucleotides

  摘要：

  DOI：

  10.1021/jo980083q
• 作为产物：
  描述：

  N-苯甲酰基-2’-脱氧腺苷 在 咪唑 、 selenium(IV) oxide 、 sodium methylate 、 亚磷酸三乙酯 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 吡啶 、 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 57.0h， 生成 N⁶-benzoyl-3'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-5',8-cyclo-5'-oxo-2'-deoxyadenosine
  参考文献：
  名称：

  Site-Specific Introduction of (5‘S)-5‘,8-Cyclo-2‘-deoxyadenosine into Oligodeoxyribonucleotides

  摘要：

  DOI：

  10.1021/jo980083q

文献信息

• C5‘-Adenosinyl Radical Cyclization. A Stereochemical Investigation
  作者：Maria Luisa Navacchia、Chryssostomos Chatgilialoglu、Pier Carlo Montevecchi

  DOI：10.1021/jo060197z

  日期：2006.6.1

  A variety of substituted 2'-deoxyadenosin-5'-yl radicals 3 were generated under different reaction conditions. Radicals 3 underwent intramolecular cyclization onto the C8-N7 double bond of the adenine moiety leading to aminyl radicals (5'S,8R)-4 and (5'R,8R)-4 and, eventually, to the corresponding cyclonucleosides 5 and 6. The effect of the solvent, the nature of the substituents, and the generation method of radicals 3 on the stereoselectivity of the C5'-radical cyclization have been considered. The observed increase of the (5'S)/(5'R) ratio by increasing the bulkiness of the R-1 group is explained in terms of steric repulsion between R-1 and the purine moiety which favors the C5'-endo conformation, whereas the effect of the water solvent in promoting the (5'R)-stereoselective cyclization is ascribed to intermolecular hydrogen bonding stabilizing the C5'-exo confomation.
• Site-Specific Introduction of (5‘<i>S</i>)-5‘,8-Cyclo-2‘-deoxyadenosine into Oligodeoxyribonucleotides
  作者：Anthony Romieu、Didier Gasparutto、Didier Molko、Jean Cadet

  DOI：10.1021/jo980083q

  日期：1998.7.1