dTDP-4,6-dideoxy-4-formamido-D-glucose | 1426036-74-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷酸
• 英文名称: dTDP-4,6-dideoxy-4-formamido-D-glucose
• 英文别名: dTDP-D-Qui4NFo；dTDP-4-formamido-4,6-dideoxy-alpha-D-glucose；[(2R,3R,4S,5S,6R)-5-formamido-3,4-dihydroxy-6-methyloxan-2-yl] [hydroxy-[[(2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy]phosphoryl] hydrogen phosphate
• CAS: 1426036-74-9
• 化学式: C₁₇H₂₇N₃O₁₅P₂
• 分子量: 575.36
• InChiKey: QULUVRDLMBXPHO-GJSHGOAISA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -4.8
• 重原子数：
  37
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.71
• 拓扑面积：
  260
• 氢给体数：
  7
• 氢受体数：
  15

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  [(2R,3S,5R)-3-羟基-5-(5-甲基-2,4-二氧代-3,4-二氢-1(2H)-嘧啶基)四氢-2-呋喃基]甲基(3R,4S,5S,6R)-3,4,5-三羟基-6-(羟基甲基)四氢-2H-吡喃-2-基二氢二磷酸酯 在 Escherichia coli 4,6-dehydratase RmlB 、 Francisella tularensis N-formyltransferase WbtJ 、 Streptomyces venezuelae aminotransferase DesI 、 monosodium L-glutamate 作用下， 以 aq. buffer 为溶剂， 反应 12.0h， 生成 dTDP-4,6-dideoxy-4-formamido-D-glucose
  参考文献：
  名称：

  图拉弗朗西斯菌糖N-甲酰基转移酶的三维结构

  摘要：

  在诸如空肠弯曲杆菌和土弗朗西斯菌的致病性革兰氏阴性细菌的O抗原上已观察到N甲酰化糖。然而，直到最近，对于这些异常糖的生物合成所需的N-甲酰基转移酶的整体分子结构还知之甚少。在这里，我们证明，通过对编码该蛋白质wbtj从基因土拉弗朗西斯菌是一种Ñ -formyltransferase上DTDP -4-氨基-4,6-二脱氧，其功能d -葡萄糖作为其底物。该酶在下文中称为WbtJ，显示出对N 10的严格要求甲酰基四氢叶酸为碳源。除了动力学分析外，在存在dTDP糖配体的情况下，酶的三维结构得以解析，标称分辨率为2.1Å。二聚体酶的每个亚基由Met 1至Ser 185定义的“核心”结构域控制。该核心基序带有活性位点残基。在核心结构域之后，最后56个残基折叠成两个α螺旋和一个β发夹基序。发夹基序主要负责亚基：亚基界面，其特征是相当疏水的口袋。从这里提出的研究中，现在知道WbtJ在C-4'氨基糖上起作用

  DOI：

  10.1002/pro.2409