Synthesis and evaluation of strand and turn modified ring-extended gramicidin S derivatives
作者:Annemiek D. Knijnenburg、Varsha V. Kapoerchan、Gijsbert M. Grotenbreg、Emile Spalburg、Albert J. de Neeling、Roos H. Mars-Groenendijk、Daan Noort、José M. Otero、Antonio L. Llamas-Saiz、Mark J. van Raaij、Bep Ravensbergen、Peter H. Nibbering、Gijs A. van der Marel、Herman S. Overkleeft、Mark Overhand
DOI:10.1016/j.bmc.2011.04.031
日期:2011.6
describe the crystal structure of previously reported ring-extended gramicidin S (GS) derivative 2 (GS14K4), containing a d-amino acid residue in one of the β-strand regions. This structure is in agreement with a previously reported modeling study of the same molecule. The polar side chain of the additional d-amino acid residue is positioned at the same face of the molecule as the hydrophobic side chains,
在本文中,我们描述了先前报道的扩环的短杆菌肽S(GS)衍生物2(GS14K4)的晶体结构,该衍生物在β链区域之一中包含d-氨基酸残基。该结构与先前报道的相同分子的建模研究一致。额外的d-氨基酸残基的极性侧链与疏水侧链位于分子的同一侧,我们认为由于该化合物2的疏水性比其中链区位于其中的延伸GS衍生物的疏水性小得多完全由l组成-氨基酸。使用该骨架结构作为我们的基准,我们制备了一系列小环延伸的GS类似物,这些类似物在转角区域具有疏水性各不相同的糖氨基酸二肽等排体。我们表明,通过这种方法,可以调节扩展的GS类似物的疏水性,而不会影响二级结构(从NMR和CD光谱中观察到)。生物学评估表明,疏水性与细胞毒性有关,但仍然由于亲水性过强而无法有效裂解人红细胞的GS类似物而导致细菌溶解。