N-(2-{(3-Azido-propyl)-[2-(2,2,2-trifluoro-acetylamino)-ethyl]-amino}-ethyl)-2,2,2-trifluoro-acetamide | 646506-05-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N-(2-{(3-Azido-propyl)-[2-(2,2,2-trifluoro-acetylamino)-ethyl]-amino}-ethyl)-2,2,2-trifluoro-acetamide
• CAS: 646506-05-0
• 化学式: C₁₁H₁₆F₆N₆O₂
• 分子量: 378.277
• InChiKey: HRNFHSIYNZREKS-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.35
• 重原子数：
  25.0
• 可旋转键数：
  10.0
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.82
• 拓扑面积：
  110.2
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  4.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-(2-{(3-Azido-propyl)-[2-(2,2,2-trifluoro-acetylamino)-ethyl]-amino}-ethyl)-2,2,2-trifluoro-acetamide 在 palladium on activated charcoal 吡啶 、 氢气 作用下， 以 甲醇 、 四氯化碳 、 乙腈 为溶剂， 反应 0.17h， 生成
  参考文献：
  名称：

  含有核苷酸间磷酸氨基酯键的寡核苷酸2'-脱氧核糖核苷酸的合成和性质，该核苷酸间修饰的侧基以两个氨基或两个羟基官能团结尾。

  摘要：

  已将涉及以双羟乙基和双氨基乙基为末端的取代基的立体化学纯的修饰的二核苷-磷酸酰胺酸酯单次或多次掺入设计成与DNA嘌呤链平行结合的嘧啶型三螺旋形成oligo-2'-脱氧核糖核苷酸中目标。这些修饰的寡2'-脱氧核糖核苷酸形成三重螺旋的能力已通过紫外熔融曲线分析和圆二色性进行了研究。仅涉及具有Rp构型的修饰的磷酸基团的寡核苷酸比亲本磷酸二酯序列形成更稳定的三重螺旋。将修饰结合到第三寡核苷酸链中对三链体的结构影响很小。在pH为7的情况下，两个 与未修饰的寡核苷酸相比，进入第三链的三个或四个修饰的磷酸基团稳定了三链体。用包含以氨基官​​能团结尾的接头的化合物观察到更强的稳定作用。在不完全加和的情况下，稳定性随修饰次数的增加而增加。这可能是由于序列内磷酸基团的环境不同所致。

  DOI：

  10.1016/s0968-0896(03)00273-6
• 作为产物：
  描述：

  2,2,2-Trifluoro-N-(2-{(3-hydroxy-propyl)-[2-(2,2,2-trifluoro-acetylamino)-ethyl]-amino}-ethyl)-acetamide 在 四氯化碳 、 叠氮化锂 、 三苯基膦 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 2.0h， 以70%的产率得到N-(2-{(3-Azido-propyl)-[2-(2,2,2-trifluoro-acetylamino)-ethyl]-amino}-ethyl)-2,2,2-trifluoro-acetamide
  参考文献：
  名称：

  含有核苷酸间磷酸氨基酯键的寡核苷酸2'-脱氧核糖核苷酸的合成和性质，该核苷酸间修饰的侧基以两个氨基或两个羟基官能团结尾。

  摘要：

  已将涉及以双羟乙基和双氨基乙基为末端的取代基的立体化学纯的修饰的二核苷-磷酸酰胺酸酯单次或多次掺入设计成与DNA嘌呤链平行结合的嘧啶型三螺旋形成oligo-2'-脱氧核糖核苷酸中目标。这些修饰的寡2'-脱氧核糖核苷酸形成三重螺旋的能力已通过紫外熔融曲线分析和圆二色性进行了研究。仅涉及具有Rp构型的修饰的磷酸基团的寡核苷酸比亲本磷酸二酯序列形成更稳定的三重螺旋。将修饰结合到第三寡核苷酸链中对三链体的结构影响很小。在pH为7的情况下，两个 与未修饰的寡核苷酸相比，进入第三链的三个或四个修饰的磷酸基团稳定了三链体。用包含以氨基官​​能团结尾的接头的化合物观察到更强的稳定作用。在不完全加和的情况下，稳定性随修饰次数的增加而增加。这可能是由于序列内磷酸基团的环境不同所致。

  DOI：

  10.1016/s0968-0896(03)00273-6