短杆菌酪肽 | 8011-61-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 中文名称: 短杆菌酪肽
• 英文名称: tyrocidine A
• 英文别名: tyrocidin A；cyclo(D-Phe-Pro-Phe-D-Phe-Asn-Gln-Tyr-Val-Orn-Leu)；3-[(3R,6S,9S,12S,15S,18S,21S,24R,27S,30S)-21-(2-amino-2-oxoethyl)-9-(3-aminopropyl)-3,24,27-tribenzyl-15-[(4-hydroxyphenyl)methyl]-6-(2-methylpropyl)-2,5,8,11,14,17,20,23,26,29-decaoxo-12-propan-2-yl-1,4,7,10,13,16,19,22,25,28-decazabicyclo[28.3.0]tritriacontan-18-yl]propanamide
• CAS: 8011-61-8
• 化学式: C₆₆H₈₇N₁₃O₁₃
• 分子量: 1270.5
• InChiKey: GSXRBRIWJGAPDU-BBVRJQLQSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.8
• 重原子数：
  92
• 可旋转键数：
  19
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.45
• 拓扑面积：
  415
• 氢给体数：
  13
• 氢受体数：
  14

安全信息

• 储存条件：
  -20°C，密闭保存，干燥环境

制备方法与用途

tyrocidine complex 是从芽孢杆菌中最初分离出的一种十环肽混合物。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  短杆菌酪肽 在 magnesium chloride 、 维生素 C 、 酪氨酸酶 作用下， 以 aq. phosphate buffer 为溶剂， 反应 0.25h， 生成
  参考文献：
  名称：

  选择性修饰结构多样肽和蛋白质中酪氨酸残基的酶级联反应

  摘要：

  生物正交化学能够在存在许多反应性官能团和其他细胞实体的情况下选择性地修饰复杂生物分子中的特定部分。这种选择性在生物学中已变得不可或缺，使生物分子能够被衍生、缀合、标记或固定用于成像、生化分析或治疗应用。接受辅因子 S-腺苷甲硫氨酸类似物的甲基转移酶 (MTase) 已广泛用于烷基多样化和生物正交标记。然而，MTases 通常具有严格的底物特异性。在这里，我们介绍了一种更灵活的方法，用于选择性衍生复杂生物分子中的酚类部分。我们的方法依赖于真菌酪氨酸酶和哺乳动物儿茶酚-O-甲基转移酶 (COMT) 的串联酶促反应，这可以影响酚基的顺序羟基化，从而产生随后被 O-烷基化的中间儿茶酚部分。当用于这种组合时，烷氧基化对肽和蛋白质中的酪氨酸残基具有高度选择性，但对肽序列的变化具有显着的耐受性。酪氨酸酶-COMT 被证明可以对多种底物提供高度通用和区域选择性的修饰，包括肽抗肿瘤剂、激素、环肽抗生素和模型

  DOI：

  10.1021/jacs.5b10928
• 作为产物：
  描述：

  在 sodium hydroxide 、 三甲基膦 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 为溶剂， 反应 2.0h， 以14 mg的产率得到短杆菌酪肽
  参考文献：
  名称：

  仅用可见光控制抗菌活性：引入四邻氯偶氮苯氨基酸

  摘要：

  新型四邻氯偶氮苯氨基酸 (CEBA)的引入，通过仅使用可见光实现了 tyrocidine A 类似物的抗菌活性的光开关，从而在良性条件下实现时空控制。带有这种光可切换氨基酸的化合物在红光照射下变得活跃，但在暴露于其他可见光波长时很快关闭。至关重要的是，阳光快速触发红光激活化合物异构化为其原始反式形式，为释放到环境中后的自失活提供了理想的平台。人们发现 Tyrocidine A 的线性类似物可对其抗菌活性提供最佳的光控制，从而在异构化时产生对鲍曼不动杆菌具有活性的化合物。对它们的N端和C端的探索提供了对其结构关键元素的深入了解，并使得获得具有优异菌株选择性和光控制性的新型抗菌剂成为可能。

  DOI：

  10.1002/chem.202102370

文献信息

• Synthesis of tyrocidine a: Use of oxime resin for peptide chain assembly and cyclization
  作者：George Ösapay、Adam Profit、John W. Taylor

  DOI：10.1016/s0040-4039(00)97003-5

  日期：1990.1

  Application of the Kaiser oxime resin to the synthesis of the thirty-membered ring cyclo-decapeptide Tyrocidine A (TA) is described. Assembly of the linear peptide chain and its subsequent cyclization with concomitant cleavage off the solid support were both achieved in high yield (73.2 % and 55 %).

  描述了Kaiser肟树脂在三十元环环十肽酪氨酸A（TA）的合成中的应用。线性肽链的组装及其随后的环化以及伴随的从固体支持物上的裂解均以高收率（73.2％和55％）实现。
• Synthesis of Tyrocidine A and Its Analogues by Spontaneous Cyclization in Aqueous Solution
  作者：Xianzhang Bu、Xiaoming Wu、Guiyang Xie、Zhihong Guo

  DOI：10.1021/ol0263191

  日期：2002.8.1

  C-terminal activation and side chain protection. Here we report a facile, quantitative cyclization method in aqueous ammonia solution for the total syntheses of the cyclic decapeptide antibiotic Tyrocidine A and its analogues from their fully deprotected linear thioester precursors on a solid support. This novel aqueous method is conformation-dependent and may be applicable to syntheses of other natural

  [反应：见正文]肽的头尾环化是一个多步骤的过程，涉及繁琐的C端激活和侧链保护。在这里，我们报告了一种简单，定量的氨水环化方法，用于在固体支持物上从完全脱保护的线性硫代酯前体中完全合成环状十肽抗生素酪氨酸A及其类似物。这种新颖的水性方法是构象依赖性的，并且可适用于其他天然环肽的合成。
• Chemoselective cyclization of unprotected linear peptides by α-ketoacid–hydroxylamine amide-ligation
  作者：Takeo Fukuzumi、Lei Ju、Jeffrey W. Bode

  DOI：10.1039/c2ob25129a

  日期：——

  an alternative approach to the synthesis of peptide macrocycles by the α-ketoacid–hydroxylamine (KAHA) ligation. This reaction allows readily prepared linear peptides to be cyclized without reagents or side-chain protecting groups and delivers a native backbone amide bond at the ligation site. The precursors are prepared with Fmoc-based solid phase peptide synthesis using reagents that we have previously

  环肽由于其受约束的构象，增强的代谢稳定性和改善的生物利用度而成为重要的合成靶标，两者结合在一起使它们成为候选药物的有前途的先导化合物。它们通常是通过精心设计的保护基操纵和侧链保护的线性前体环化的多步序列合成的。在本手稿中，我们公开了通过α-酮酸-羟胺（KAHA）连接来合成肽大环的另一种方法。该反应允许容易制备的线性肽在没有试剂或侧链保护基的情况下环化，并在连接位点递送天然主链酰胺键。使用我们先前公开的试剂通过基于Fmoc的固相肽合成制备前体。除纯化外，无需进行环化后的操​​作或脱保护。该协议被应用于五种不同的环大小和侧链功能的不同环肽天然产物。
• Synthesis and Antibacterial Activities of <i>N</i>-Glycosylated Derivatives of Tyrocidine A, a Macrocyclic Peptide Antibiotic
  作者：Honggang Hu、Jie Xue、Benjamin M. Swarts、Qianli Wang、Qiuye Wu、Zhongwu Guo

  DOI：10.1021/jm801577r

  日期：2009.4.9

  method for macrocyclic glycopeptide synthesis was developed and utilized to synthesize tyrocidine A and its glycosylated derivatives. The method is based on solid-phase peptide synthesis using 2-chlorotrityl resin as the solid-phase support and glycosyl amino acids as building blocks. After glycopeptides with fully protected glycans and side chains were released from the acid-labile resin, their C- and

  开发了一种有效且实用的大环糖肽合成方法，并将其用于合成酪氨酸A及其糖基化衍生物。该方法基于固相肽合成，其中2-氯三苯甲基树脂为固相载体，糖基氨基酸为结构单元。从酸不稳定的树脂中释放出具有完全保护的聚糖和侧链的糖肽后，它们的C-和N-末端在溶液中分子内偶联，以定量产率提供环状糖肽。该合成方法通常应适用于各种大环糖肽。合成酪氨酸A衍生物的生物学研究表明，将聚糖直接连接到酪氨酸A的Asn残基上可减少其抗菌活性，但通过简单的间隔子将聚糖连接到Asn却没有。这些结果揭示了聚糖对糖肽抗生素的活性，可能还有其结构的重要影响。
• Stabilizing the monomeric amyloid-β peptide by tyrocidine A prevents and reverses amyloidogenesis without the accumulation of oligomers
  作者：Gesi Wen、Wenjing Qin、Daoyuan Chen、Youqiao Wang、Xin Yue、Ziyi Liu、Yingnan Cao、Jun Du、Binhua Zhou、Xianzhang Bu

  DOI：10.1039/c7cc00506g

  日期：——

  Stabilizing the monomeric amyloid-β peptide by tyrocidine A prevents accumulation of oligomers.

  通过tyrocidine A稳定单体淀粉样蛋白-β肽，防止寡聚体的积累。