4-(azidomethyl)-2-nitrobenzonitrile | 1333470-04-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: 4-(azidomethyl)-2-nitrobenzonitrile
• 英文别名: 4-cyano-3-nitrobenzyl azide
• CAS: 1333470-04-4
• 化学式: C₈H₅N₅O₂
• 分子量: 203.16
• InChiKey: RFVOKVSUWFKYCC-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.28
• 重原子数：
  15.0
• 可旋转键数：
  3.0
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.12
• 拓扑面积：
  115.69
• 氢给体数：
  0.0
• 氢受体数：
  4.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-(azidomethyl)-2-nitrobenzonitrile 在 potassium carbonate 、 1-羟基苯并三唑 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 、 三苯基膦 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 、 丙酮 为溶剂， 生成 ethyl (5-chloro-2-{[(4-cyano-3-nitrobenzyl)amino]carbonyl}phenoxy)acetate
  参考文献：
  名称：

  人醛糖还原酶活性位点附近的静电场：2. 氢键引起的新抑制剂和并发症

  摘要：

  振动斯塔克效应光谱用于测量人醛糖还原酶 ( h ALR2)活性位点疏水区的静电场。设计并合成了一种新的含腈抑制剂，并在 1.3 Å 分辨率下确定了其复合物的 X 射线结构，以及辅因子 NADP +和野生型h ALR2。发现腈位于 T113 附近，与氢键相互作用一致。当抑制剂与野生型h结合时，在室温下在腈区观察到两个振动吸收峰ALR2，表明腈探针经历了两种不同的微环境，通过与不存在与腈的氢键的 T113A 突变体相比，可以凭经验将这些微环境分为氢键和非氢键种群。基于该结构的经典分子动力学模拟预测沿腈探针投射的蛋白质电场中的双峰分布。将这两个峰解释为探针腈基团和附近氨基酸侧链之间的氢键形成 - 解离过程用于解释对两个红外波段的观察，并使用模拟来研究这种构象的分子细节改变。

  DOI：

  10.1021/bi200930f
• 作为产物：
  描述：

  4-(溴甲基)-2-硝基苯甲腈 在 sodium azide 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 24.0h， 生成 4-(azidomethyl)-2-nitrobenzonitrile
  参考文献：
  名称：

  人醛糖还原酶活性位点附近的静电场：2. 氢键引起的新抑制剂和并发症

  摘要：

  振动斯塔克效应光谱用于测量人醛糖还原酶 ( h ALR2)活性位点疏水区的静电场。设计并合成了一种新的含腈抑制剂，并在 1.3 Å 分辨率下确定了其复合物的 X 射线结构，以及辅因子 NADP +和野生型h ALR2。发现腈位于 T113 附近，与氢键相互作用一致。当抑制剂与野生型h结合时，在室温下在腈区观察到两个振动吸收峰ALR2，表明腈探针经历了两种不同的微环境，通过与不存在与腈的氢键的 T113A 突变体相比，可以凭经验将这些微环境分为氢键和非氢键种群。基于该结构的经典分子动力学模拟预测沿腈探针投射的蛋白质电场中的双峰分布。将这两个峰解释为探针腈基团和附近氨基酸侧链之间的氢键形成 - 解离过程用于解释对两个红外波段的观察，并使用模拟来研究这种构象的分子细节改变。

  DOI：

  10.1021/bi200930f

文献信息

• Improving the Selectivity of PACE4 Inhibitors through Modifications of the P1 Residue
  作者：Vahid Dianati、Pauline Navals、Frédéric Couture、Roxane Desjardins、Anthony Dame、Anna Kwiatkowska、Robert Day、Yves L. Dory

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.8b01381

  日期：2018.12.27

  Paired basic amino acid cleaving enzyme 4 (PACE4), a serine endoprotease of the proprotein convertases family, has been recognized as a promising target for prostate cancer. We previously reported a selective and potent peptide based inhibitor for PACE4, named the multi-Leu peptide (Ac-LLLLRVKR-NH2 sequence), which was then modified into a more potent and stable compound named C23 with the following structure: Ac-DLeu-LLLRVK-Amba (Amba: 4-amidinobenzylamide). Despite improvements in both in vitro and in vivo profiles of C23, its selectivity for PACE4 over furin was significantly reduced. We examined other Argmimetics instead of Amba to regain the lost selectivity. Our results indicated that the replacement of Amba with 5-(aminomethyl)picolinimidamide increased affinity for PACE4 and restored selectivity. Our results also provide a better insight on how structural differences between 51 pockets of PACE4 and furin could be employed in the rational design of selective inhibitors.