cyclo-(AcPI-β-IP-γ-IP-β-PP-(R)-Cys)-β-Dp | 1346132-63-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物
• 英文名称: cyclo-(AcPI-β-IP-γ-IP-β-PP-(R)-Cys)-β-Dp
• 英文别名: (62R)-N-[3-[3-(dimethylamino)propylamino]-3-oxopropyl]-5,15,21,32,38,48,54,66-octamethyl-3,9,13,19,25,30,36,42,46,52,58,64-dodecaoxo-60-thia-2,5,8,12,15,18,21,24,29,32,35,38,41,45,48,51,54,57,63,66,70,71,73-tricosazanonacyclo[63.2.1.14,7.114,17.120,23.131,34.137,40.147,50.153,56]pentaheptaconta-1(67),4(75),6,14(74),16,20(73),22,31(72),33,37(71),39,47(70),49,53(69),55,65(68)-hexadecaene-62-carboxamide
• CAS: 1346132-63-5
• 化学式: C₆₈H₈₆N₂₆O₁₄S
• 分子量: 1523.66
• InChiKey: WMUNOJWHZCQGBZ-QLKFWGTOSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -4.6
• 重原子数：
  109
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  9.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.37
• 拓扑面积：
  514
• 氢给体数：
  14
• 氢受体数：
  19

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  、 N,N-二甲基-1,3-二氨基丙烷 在 benzotriazol-1-yloxyl-tris-(pyrrolidino)-phosphonium hexafluorophosphate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 0.67h， 以2 mg的产率得到cyclo-(AcPI-β-IP-γ-IP-β-PP-(R)-Cys)-β-Dp
  参考文献：
  名称：

  半胱氨酸环吡咯-咪唑聚酰胺用于 DNA 小凹槽中的序列特异性识别

  摘要：

  吡咯-咪唑 (PI) 聚酰胺是小的 DNA 结合分子，可以以高亲和力和特异性识别预定的 DNA 序列。发夹 PI 聚酰胺已被深入研究；然而，环状 PI 聚酰胺受到的关注较少，主要是因为它们的合成困难。在这里，我们描述了一种使用半胱氨酸和氯乙酰残基生产 PI 聚酰胺的新型环化方法。环化反应在1小时内完成，转化效率高。该方法可用于生产可识别 7 bp DNA 序列的长环状 PI 聚酰胺。含有两个β-丙氨酸分子的环状PI聚酰胺比相应的发夹PI聚酰胺具有更高的亲和力和特异性，表明环状PI聚酰胺可以作为一种新型的DNA结合分子。

  DOI：

  10.1021/ja207440p