5'-O-2-(2-nitrophenyl)propoxycarbonyl-2'-O-acetal levulinyl ester uridine-3'-O-2-cyanoethyl N,N-diisopropyl phosphoramidite | 1161570-47-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 核苷和核苷酸类似物
• 英文名称: 5'-O-2-(2-nitrophenyl)propoxycarbonyl-2'-O-acetal levulinyl ester uridine-3'-O-2-cyanoethyl N,N-diisopropyl phosphoramidite
• 英文别名: 5'-O-2-(2-nitrophenyl)propoxycarbonyl-2'-O-acetal levulinyl ester uridine-3'-O-2-cyanoethyl N,N-diisopropylphosphoramidite
• CAS: 1161570-47-3
• 化学式: C₃₄H₄₆N₅O₁₄P
• 分子量: 779.738
• InChiKey: ZJQCKFGHRHQNAA-MDTSPGDSSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.22
• 重原子数：
  54.0
• 可旋转键数：
  21.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.59
• 拓扑面积：
  240.85
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  17.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-2'-O-acetal levulinyl ester uridine 在 吡啶 、 triethylamine tris(hydrogen fluoride) 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 7.0h， 生成 5'-O-2-(2-nitrophenyl)propoxycarbonyl-2'-O-acetal levulinyl ester uridine-3'-O-2-cyanoethyl N,N-diisopropyl phosphoramidite
  参考文献：
  名称：

  RNA monomers containing O-acetal levulinyl ester groups and their use in RNA microarrays

  摘要：

  本发明涉及在核糖单元的2′和/或5′-羟基官能团处具有O-乙酰缩醛丙酰保护基团的RNA单体。所述单体可以被合并到寡核糖核苷酸或RNA多核苷酸中。此外，该发明涉及所述RNA单体、寡核糖核苷酸和RNA多核苷酸的合成方法，以及它们的去保护方法、所述化合物的使用方法和包含所述化合物的组合物的方法。特别地，这些化合物和包含它们的组合物被用于RNA微阵列的光导向合成方法。

  公开号：

  US09249175B2

文献信息

• Lackey, Jeremy G.; Mitra, Debbie; Somoza, Mark M., Journal of the American Chemical Society, 2009, vol. 131, p. 8496 - 8502
  作者：Lackey, Jeremy G.、Mitra, Debbie、Somoza, Mark M.、Cerrina, Franco、Damha, Masad J.

  DOI：——

  日期：——