Streptolydigin | 7229-50-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: Streptolydigin
• 英文别名: (2S)-2-[(2S,4E)-4-[(2E,4E,6R)-6-[(1R,3R,4S,5R,8R)-1,4-dimethylspiro[2,9-dioxabicyclo[3.3.1]non-6-ene-8,2'-oxirane]-3-yl]-1-hydroxy-4-methylhepta-2,4-dienylidene]-1-[(2S,5S,6S)-5-hydroxy-6-methyloxan-2-yl]-3,5-dioxopyrrolidin-2-yl]-N-methylpropanamide
• CAS: 7229-50-7
• 化学式: C₃₂H₄₄N₂O₉
• 分子量: 600.709
• InChiKey: KVTPRMVXYZKLIG-NCAOFHFGSA-N

物化性质

• 熔点：
  147-148°
• 比旋光度：
  D25 -93° (c = 1.6 in chloroform)
• 沸点：
  659.54°C (rough estimate)
• 密度：
  1.1852 (rough estimate)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.1
• 重原子数：
  43
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.66
• 拓扑面积：
  147
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  9

制备方法与用途

生物活性

streptolydigin（portamycin）是一种3-乙酰基四酸抗生素，有效抑制细菌RNA聚合酶（bacterial RNA polymerase），其Ki值为18 μM，Kd值为15 μM。它通过与RNA聚合酶结合来抑制RNA合成，但不抑制真核生物RNA聚合酶。streptolydigin具有强大的抗菌活性，尤其对厌氧菌和一些革兰氏阳性需氧菌。

靶点

• Ki: 18 μM (细菌RNA聚合酶)
• Kd: 15 μM (细菌RNA聚合酶)

体外研究

抗生素streptolydigin（Stl）是一种3-乙酰基四酸的衍生物。streptolydigin与RNA聚合酶结合依赖于一个非催化性的镁离子，该离子可能由活性中心桥螺旋中的天冬氨酸螯合。它能以1.8 μM的Ki值抑制嗜热链球菌（T. thermophilus）的RNA聚合酶。streptolydigin通过作用于细菌RNA聚合酶的起始、延伸和焦磷酸化反应来抑制其活性。该化合物与RNA聚合酶内的三个结构元素相互作用：stl口袋、桥螺旋以及触发环区。streptolydigin中的streptolol基团与stl口袋及桥螺旋相互作用，而tetramic酸基团则与触发环区相互作用。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  碳酸氢钠 、 Streptolydigin 、 、 乙二醇 、 水 在 乙醚 、 crude material 作用下， 以 叔丁醇 为溶剂， 反应 27.0h， 生成 Streptolic acid
  参考文献：
  名称：

  Acylation of tirandamycic, streptolic and sorbic acids to cephalosporin

  摘要：

  本发明涉及将链霉亲素、替兰达霉素和山梨酸与青霉素和头孢菌素核进行杂交。

  公开号：

  US04623644A1
• 作为产物：
  描述：

  、 4-diethoxyphosphoryl-N-[(3S,4S)-1,4-dimethyl-2,5-dioxopyrrolidin-3-yl]-N-[(2S,5S,6S)-6-methyl-5-triethylsilyloxyoxan-2-yl]-3-oxobutanamide 在 potassium tert-butylate 、 盐酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 为溶剂， 反应 1.67h， 以60%的产率得到Streptolydigin
  参考文献：
  名称：

  Streptolydigin 的合成，一种有效的细菌 RNA 聚合酶抑制剂

  摘要：

  Streptolydigin 是一种由 Streptomyces lydicus 产生的高效广谱抗生素，可抑制细菌 RNA 聚合酶。我们描述了链球菌素的首次合成，它以高度收敛和完全立体控制的方式组装，最长的线性序列为 24 步，从市售前体开始。组装过程需要制备天然产物的完全精细的链霉和 ydiginic 亚基，然后在三步一锅法中进行高效结合，其中包括 Dieckmann 环化和伴随的酰亚胺开环、Horner-Wadsworth-Emmons 烯化、和脱甲硅烷。

  DOI：

  10.1021/ja107190w

文献信息

• Synthesis of Streptolydigin, a Potent Bacterial RNA Polymerase Inhibitor
  作者：Sergey V. Pronin、Sergey A. Kozmin

  DOI：10.1021/ja107190w

  日期：2010.10.20

  Streptolydigin is a highly potent, broad-spectrum antibiotic produced by Streptomyces lydicus, which inhibits bacterial RNA polymerase. We describe the first synthesis of streptolydigin, which was assembled in a highly convergent and fully stereocontrolled fashion with a longest linear sequence of 24 steps starting from commercially available precursors. The assembly process entailed preparation of

  Streptolydigin 是一种由 Streptomyces lydicus 产生的高效广谱抗生素，可抑制细菌 RNA 聚合酶。我们描述了链球菌素的首次合成，它以高度收敛和完全立体控制的方式组装，最长的线性序列为 24 步，从市售前体开始。组装过程需要制备天然产物的完全精细的链霉和 ydiginic 亚基，然后在三步一锅法中进行高效结合，其中包括 Dieckmann 环化和伴随的酰亚胺开环、Horner-Wadsworth-Emmons 烯化、和脱甲硅烷。
• Acylation of tirandamycic, streptolic and sorbic acids to cephalosporin
  申请人：The Upjohn Company

  公开号：US04623644A1

  公开（公告）日：1986-11-18

  This invention relates to the hybridization of streptolydigin, tirandamycin and sorbic acid to penicillin and cephalosporin nuclei.

  本发明涉及将链霉亲素、替兰达霉素和山梨酸与青霉素和头孢菌素核进行杂交。