| 1554584-16-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吡咯烷类
• CAS: 1554584-16-5
• 化学式: C₁₆H₂₀N₂O₈S
• 分子量: 410.33
• InChiKey: ODAKOWJLAZQEMJ-TXNVYZHYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.21
• 重原子数：
  27.0
• 可旋转键数：
  10.0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.62
• 拓扑面积：
  127.36
• 氢给体数：
  0.0
• 氢受体数：
  9.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  在 间氯过氧苯甲酸 作用下， 以 氯仿 为溶剂， 以70%的产率得到(2,5-Dioxopyrrolidin-1-yl) 3,3,3-trideuterio-2-[dideuterio-[1,1,3,3,3-pentadeuterio-2-(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl)oxycarbonylpropyl]sulfinylmethyl]propanoate
  参考文献：
  名称：

  Developing New Isotope-Coded Mass Spectrometry-Cleavable Cross-Linkers for Elucidating Protein Structures

  摘要：

  蛋白质复合物的结构表征对于理解其功能和调节机制至关重要。然而，由于现有工具的局限性，这项工作仍然充满挑战。随着最近技术的进步，交联质谱（XL-MS）已成为定义蛋白质相互作用和阐明蛋白质复合物结构拓扑的一种有力策略。为了进一步推进XL-MS研究，我们在此介绍新型同位素编码的MS可裂解同源双功能交联剂：d0和d10标记的二甲基二琥珀酰亚胺基亚砜（DMDSSO）。对DMDSSO交联肽的详细表征进一步表明，含亚砜的MS可裂解交联剂能够对交联肽提供稳定且可预测的MS2碎片，从而允许后续的MS3分析，以进行简化且明确的鉴定。同时使用这些试剂可提供DMDSSO交联肽的特征双峰模式，从而有助于通过MSn分析提高交联鉴定的置信度。更重要的是，独特的同位素谱图允许对交联肽进行定量分析，从而扩展了XL-MS策略分析静态和动态蛋白质相互作用的能力。总之，我们的工作为未来研究建立了一种新的XL-MS工作流程，以了解蛋白质复合物的结构动力学。

  DOI：

  10.1021/ac403636b
• 作为产物：
  描述：

  在 吡啶 、 三氟乙酸酐 、 lithium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成
  参考文献：
  名称：

  Developing New Isotope-Coded Mass Spectrometry-Cleavable Cross-Linkers for Elucidating Protein Structures

  摘要：

  蛋白质复合物的结构表征对于理解其功能和调节机制至关重要。然而，由于现有工具的局限性，这项工作仍然充满挑战。随着最近技术的进步，交联质谱（XL-MS）已成为定义蛋白质相互作用和阐明蛋白质复合物结构拓扑的一种有力策略。为了进一步推进XL-MS研究，我们在此介绍新型同位素编码的MS可裂解同源双功能交联剂：d0和d10标记的二甲基二琥珀酰亚胺基亚砜（DMDSSO）。对DMDSSO交联肽的详细表征进一步表明，含亚砜的MS可裂解交联剂能够对交联肽提供稳定且可预测的MS2碎片，从而允许后续的MS3分析，以进行简化且明确的鉴定。同时使用这些试剂可提供DMDSSO交联肽的特征双峰模式，从而有助于通过MSn分析提高交联鉴定的置信度。更重要的是，独特的同位素谱图允许对交联肽进行定量分析，从而扩展了XL-MS策略分析静态和动态蛋白质相互作用的能力。总之，我们的工作为未来研究建立了一种新的XL-MS工作流程，以了解蛋白质复合物的结构动力学。

  DOI：

  10.1021/ac403636b