由于他氟前列素结构复杂,合成纯品极为困难。现有制备方法路线较长,中间体的多个步骤均涉及柱层析纯化,导致溶剂用量大、成本高。特别是在TF-6(他氟前列素酸)的合成中,Witing反应不可避免地产生一定量的反式异构体杂质。这些杂质是影响他氟前列素成品质量的关键因素之一。由于他氟前列素及他氟前列素酸均为粘稠状液体化合物,因此异构体杂质难以通过重结晶或精馏纯化。
他氟前列素酸作为合成他氟前列素的中间体,具有重要作用。他氟前列素是一种选择性的FP前列腺素受体激动剂,能够通过增加葡萄膜巩膜外流来降低眼内压。