从海门酸海绵中分离的环状八肽环(-Pro-Pro-Tyr-Val-ProLeu-Ile-Ile-)(1)合成并使用NMR和分子动力学模拟进行构象检查。合成物1的大多数结构参数与所报道的分离材料一致。我们的研究表明,在1 H和13 C-NMR共振的赋值与天然物质的赋值中,存在一些细微但显着的差异。使用1确定
CHCl3和
DMSO中的构象H-NMR和分子动力学模拟。在模拟过程中,NOE和耦合常数均被用作实验约束,明确使用了与NMR研究相同的溶剂。检查了溶剂与1相互作用的差异,从而洞悉了所观察到的构象差异。显性构象包含分别在CHCl 3和
DMSO中围绕Pro 1 -Pro 2顺式肽键的Ile 8 -Tyr 3的ßVIa转角和围绕Val 4 -Ile 7的βI或ßII转角。