(R)-2,2,4,6-tetramethyl-3-oxoheptanoic acid | 1428850-37-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 酮酸及其衍生物
• 英文名称: (R)-2,2,4,6-tetramethyl-3-oxoheptanoic acid
• CAS: 1428850-37-6
• 化学式: C₁₁H₂₀O₃
• 分子量: 200.278
• InChiKey: JUIOZKORXDSSSY-MRVPVSSYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.35
• 重原子数：
  14.0
• 可旋转键数：
  5.0
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.82
• 拓扑面积：
  54.37
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  2.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (R)-2,2,4,6-tetramethyl-3-oxoheptanoic acid 、 在 2,4,6-三甲基吡啶 、 (1-cyano-2-ethoxy-2-oxoethylidenaminooxy)dimethylaminomorpholinocarbenium hexafluorophosphate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 1.0h， 以0.685 mg的产率得到
  参考文献：
  名称：

  雅库酰胺B的14种立体异构体的全合成和功能评价。立体化学对疏水性和细胞毒性的重要性

  摘要：

  雅库酰胺B是高度不饱和的线性三肽和极强的细胞毒素。在这里，我们描述了使用统一的组装策略合成Yaku'amide B的14种新的立体异构体。

  DOI：

  10.1039/c6ob00640j
• 作为产物：
  描述：

  (2S,3S)-3,5-bis(benzyloxy)-2,4,4-trimethylpentanal 在 正丁基锂 、 2-氮杂金刚烷-N-氧自由基 、 碘苯二乙酸 、 palladium 10% on activated carbon 、 氢气 作用下， 以 四氢呋喃 、 aq. phosphate buffer 、 正己烷 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 164.5h， 生成 (R)-2,2,4,6-tetramethyl-3-oxoheptanoic acid
  参考文献：
  名称：

  Yaku'amide A的全合成和完整结构分配

  摘要：

  在这里，我们报告了 yaku'amide A 的第一次全合成和完整的立体化学分配。 Yaku'amide A (1) 是从海绵 Ceratopsion sp. 中分离出来的。作为一种非常有效的细胞毒素。除了 N 端酰基 (NTA) 中的 C4 立体化学外，确定了其结构。这种十三肽由 2 个蛋白原氨基酸残基和 11 个非蛋白原氨基酸残基组成，并用 NTA 和一个 C 端胺 (CTA) 封端。α,β-脱氢缬氨酸、E- 和 Z-α,β-脱氢异亮氨酸是 1 中最不寻常的非蛋白质残基，因此需要开发新的组装方法。因此，Cu 介导的交叉偶联反应有效地用于 E/Z 选择性合成三种二肽与脱氢异亮氨酸以及构建四肽与脱氢缬氨酸。然后以逐步方式从四肽延长肽以提供 1 的两种可能的 C4-差向异构体。广泛的 NMR 研究表明，天然 1 具有 C4S-立体化学，使用 P388 小鼠白血病细胞的生物学分析表明，C4-差向异构体具有相当的毒性。用于构建

  DOI：

  10.1021/ja401457h

文献信息

• Target Identification of Yaku’amide B and Its Two Distinct Activities against Mitochondrial F_oF₁-ATP Synthase
  作者：Kai Kitamura、Hiroaki Itoh、Kaori Sakurai、Shingo Dan、Masayuki Inoue

  DOI：10.1021/jacs.8b07339

  日期：2018.9.26

  four β,β-dialkylated α,β-unsaturated amino acid residues. Growth-inhibitory profile of 1b against a panel of 39 human cancer cell lines is distinct from those of clinically used anticancer drugs, suggesting a novel mechanism of action. We achieved total syntheses of chemical probes based on 1b and elucidated the cellular target and mode of action of 1b. Fluorescent (3, 4) and biotinylated (5, 6) derivatives

  Yaku'amide B (1b) 是一种结构独特的十四肽，带有四个 β,β-二烷基化 α,β-不饱和氨基酸残基。1b 对一组 39 种人类癌细胞系的生长抑制特征与临床使用的抗癌药物不同，表明了一种新的作用机制。我们实现了基于 1b 的化学探针的全合成，并阐明了 1b 的细胞靶点和作用方式。分别制备了 1b 的荧光 (3, 4) 和生物素化 (5, 6) 衍生物用于细胞成像研究和下拉分析。此外，合成了1b的非天然对映体（ent-1b）及其荧光探针（ent-3）用于对照实验。使用 3 和 4 进行的亚细胞定位分析表明，1b 选择性地积聚在 MCF-7 人乳腺癌细胞的线粒体中。6 的下拉分析显示 FoF1-ATP 合酶是 1b 的主要靶蛋白。与这些发现一致，生化活性测定表明 1b 抑制由线粒体 FoF1-ATP 合酶催化的 ATP 产生。值得注意的是，还发现 1b 能够增强 FoF1-ATP 合酶的
• Elucidation and Total Synthesis of the Correct Structures of Tridecapeptides Yaku’amides A and B. Synthesis-Driven Stereochemical Reassignment of Four Amino Acid Residues
  作者：Takefumi Kuranaga、Hiroyuki Mutoh、Yusuke Sesoko、Tomomi Goto、Shigeki Matsunaga、Masayuki Inoue

  DOI：10.1021/jacs.5b05550

  日期：2015.7.29

  and B (2) possess four α,β-dehydroamino acid residues in their linear tridecapeptide sequence and differ in their residue-3 (Gly for 1 and Ala for 2). The highly unsaturated peptide structure, characteristic cytotoxicity profile, and extreme scarcity from natural sources motivated us to launch synthetic studies of 1 and 2. Here, we report the total synthesis of the originally proposed structure of yaku'amide

  Yaku'amides A (1) 和 B (2) 在其线性十三肽序列中具有四个 α,β-脱氢氨基酸残基，并且它们的残基 3 不同（Gly 表示 1，Ala 表示 2）。高度不饱和的肽结构、特征性细胞毒性特征和来自天然来源的极度稀缺促使我们启动 1 和 2 的合成研究。在这里，我们报告了最初提出的 yaku'amide B (2a) 结构的全合成，通过应用通往 1a 的路线，这是我们小组之前建立的。然而，这一成就仅证明 2a 和天然 2 在结构上不同，并促使研究旨在确定 2 的真实结构。 Marfey 对微量天然 2 及其降解产物的广泛分析向我们展示了可能的立体异构体，所有这些都是合成制备的，用于与 2 的真实片段进行色谱比较。基于这项检测工作，我们提出了 yaku'amide B (2c) 的校正结构，其中残基 7 和残基 -8 的顺序以及残基 - 11 和 -12 是相反的。最后，2c