2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-3'-hydroxyimino-3'-deoxyuridine | 218967-30-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-3'-hydroxyimino-3'-deoxyuridine
• CAS: 218967-30-7
• 化学式: C₁₅H₂₅N₃O₆Si
• 分子量: 371.466
• InChiKey: XWFQETWCDVUETI-OASPWFOLSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.65
• 重原子数：
  25.0
• 可旋转键数：
  4.0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.67
• 拓扑面积：
  126.14
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  8.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-3'-hydroxyimino-3'-deoxyuridine 在 吡啶 、 sodium tetrahydroborate 、 palladium 10% on activated carbon 、 氢气 、 溶剂黄146 作用下， 以 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 6.0h， 生成 2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-3'-N-(methanesulfonyl)amino-3'-deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  5'-磷酸化可提高 DNA 修复酶 SNM1A 核苷抑制剂的功效

  摘要：

  提高癌症化疗疗效的一个有希望的策略是抑制与链间交联修复有关的酶。一种这样的靶酶是 SNM1A，一种锌依赖性核酸外切酶。我们制备了几个系列的核苷衍生物，并将它们作为 SNM1A 抑制剂进行了测试。除了催化锌离子外，利用与酶的磷酸盐结合袋的相互作用，显着提高了抑制效力。

  DOI：

  10.1002/cmdc.202100603
• 作为产物：
  描述：

  2',5'-bis-O-(tert-butyldimethylsilyl)-3'-hydroxyimino-3'-deoxyuridine 在 三氟乙酸 作用下， 反应 0.5h， 以99%的产率得到2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-3'-hydroxyimino-3'-deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  核苷和核苷酸。180.在糖部分的2'-或3'-位具有羟氨基而不是羟基的核苷的合成和抗肿瘤活性。

  摘要：

  设计和合成潜在的抗肿瘤抗代谢物2'-脱氧-2'-（羟基氨基）尿苷（15），-胞苷（19，2'-DHAC）和-腺苷（35），其区域异构体，3'-脱氧- 3'-（羟基氨基）尿苷（40）和-胞苷（45，3'-DHAC）及其2'-脱氧类似物，2'，3'-二脱氧-3'-（羟基氨基）尿苷（49）和-描述了胞苷（52，3'-dDHAC）。我们使用13C NMR光谱法分别测量了15和40中羟氨基的pKa值与pH的关系，分别为2.9和3.4。我们还发现这些核苷在中性溶液中逐渐分解，而在酸性溶液中则不分解。这种分解可能与在糖部分上的氨氧基自由基的产生有关。使用L1210和KB细胞评估了这些核苷的体外细胞毒性。2' -DHAC（19）抑制L1210和KB细胞的生长，IC50值分别为1.58和1.99 microM。3'-DHAC（45）和3'-dDHAC（52）对L1210细胞也有细胞毒性，IC50值分别为4.03和1

  DOI：

  10.1021/jm980466g

文献信息

• Synthesis and evaluation of squaramide and thiosquaramide inhibitors of the DNA repair enzyme SNM1A
  作者：Mark Berney、William Doherty、Werner Theodor Jauslin、Manav T Manoj、Eva-Maria Dürr、Joanna Francelle McGouran

  DOI：10.1016/j.bmc.2021.116369

  日期：2021.9

  of developing SNM1A inhibitors, but the full potential of this enzyme as a drug target has yet to be explored. Herein, the synthesis of a family of squaramide- and thiosquaramide-bearing nucleoside derivatives and their evaluation as SNM1A inhibitors is reported. A gel electrophoresis assay was used to identify nucleoside derivatives bearing an N-hydroxysquaramide or squaric acid moiety at the 3’-position

  SNM1A 是一种锌依赖性核酸酶，参与从 DNA 中去除链间交联损伤。抑制链间交联修复酶如 SNM1A 是提高交联化疗药物疗效的有前途的策略。最初的研究已经证明了开发 SNM1A 抑制剂的可行性，但这种酶作为药物靶点的全部潜力还有待探索。在此，报道了带有方酸酰胺和硫代方酰胺的核苷衍生物家族的合成及其作为 SNM1A 抑制剂的评价。凝胶电泳分析用于鉴定在 3'-位带有N-羟基方酸酰胺或方酸部分的核苷衍生物，以及带有 5'-硫代方酸酰胺的胸苷衍生物，作为候选 SNM1A 抑制剂。定量IC50测定表明，带有 5'-硫代方酸酰胺的胸苷衍生物是最有效的抑制剂，其次是带有 3'-方酸的胸苷衍生物。进行紫外-可见滴定以评估（硫代）方酸酰胺与锌离子的结合，从而使抑制效力的顺序合理化。研究了活性抑制剂的膜渗透性，其中几种化合物显示出未来体内应用的前景。