硼,[1-[3-[5-[(3,5-二甲基-2H-吡咯-2-亚基-kN)甲基]-1H-吡咯-2-基-kN]-1-羰基丙氧基]-2,5-吡咯烷二酮酸根]二氟-,(T-4)- | 146616-66-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吡咯
• 中文名称: 硼,[1-[3-[5-[(3,5-二甲基-2H-吡咯-2-亚基-kN)甲基]-1H-吡咯-2-基-kN]-1-羰基丙氧基]-2,5-吡咯烷二酮酸根]二氟-,(T-4)-
• 英文名称: BODIPY FL NHS ester
• 英文别名: 4,4-difluoro-5,7-dimethyl-4-bora-3a,4a-diaza-s-indacene-3-propionic acid succinimidyl ester；Bodipy NHS ester；BODIPY FL SE；BDP FL NHS ester；(2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 3-(2,2-difluoro-10,12-dimethyl-1-aza-3-azonia-2-boranuidatricyclo[7.3.0.03,7]dodeca-3,5,7,9,11-pentaen-4-yl)propanoate
• CAS: 146616-66-2
• 化学式: C₁₈H₁₈BF₂N₃O₄
• 分子量: 389.166
• InChiKey: SDVMGNSTOAJONW-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.09
• 重原子数：
  28
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  71.6
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  7

安全信息

• 储存条件：
  -20°C下存储，需置于惰性气体中，并避免光照、潮湿和加热导致的分解。

制备方法与用途

BODIPY-FL NHS酯是一种明亮的绿色荧光染料。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  硼,[1-[3-[5-[(3,5-二甲基-2H-吡咯-2-亚基-kN)甲基]-1H-吡咯-2-基-kN]-1-羰基丙氧基]-2,5-吡咯烷二酮酸根]二氟-,(T-4)- 以 aq. phosphate buffer 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 4.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  2-（（烷硫基）（芳基）亚甲基）丙二腈与 1,2-氨基硫醇的缩合作为位点特异性蛋白质修饰和肽环化的新型生物正交反应

  摘要：

  肽和蛋白质的位点特异性修饰在探测和扰动生物系统中具有广泛的应用。在此我们报告了 1,2-氨基硫醇可以在生物相容性条件下与 2-((烷硫基)(芳基)亚甲基)丙二腈 (TAMM) 快速、特异性和有效地反应。该反应经历了一种独特的机制，包括硫醇-乙烯基硫化物交换、环化和二氰基甲烷的消除，以形成 2-芳基-4,5-二氢噻唑 (ADT) 作为稳定的产物。可以将 1,2-氨基硫醇官能团作为 N 端半胱氨酸或非天然氨基酸引入肽或蛋白质中。该反应的生物正交性通过不仅合成肽和纯化的重组蛋白而且哺乳动物细胞和噬菌体上的蛋白质的位点特异性标记来证明。与生物正交反应中的其他试剂不同，TAMM 的化学和物理特性可以轻松调整。TAMM 还可用于生成基于噬菌体的环肽文库，而不会降低噬菌体的感染性。使用这种方法，我们鉴定了对不同蛋白质靶标具有高亲和力的 ADT 环肽，为生物学研究和潜在治疗提供了有价值的工具。此外，TAMM

  DOI：

  10.1021/jacs.9b11875
• 作为产物：
  描述：

  N-羟基丁二酰亚胺 、 3-氟硼吡咯-丙酸 以 二氯甲烷 为溶剂， 以95%的产率得到硼,[1-[3-[5-[(3,5-二甲基-2H-吡咯-2-亚基-kN)甲基]-1H-吡咯-2-基-kN]-1-羰基丙氧基]-2,5-吡咯烷二酮酸根]二氟-,(T-4)-
  参考文献：
  名称：

  优化轴向配体以促进 BODIPY 共轭铂 (IV) 抗癌前药的光活化

  摘要：

  含有轴向羧酸盐的基于卡铂的铂 ( IV ) 前药相对难以还原释放活性铂 ( II ) 物质并杀死癌细胞。为了促进活化过程，二吡咯亚甲基硼 (BODIPY) 配体被用作轴向位置的光吸收剂，以光活化卡铂基铂 ( IV ) 配合物。然而，轴向配体对铂中心光活化速率和随后的生物活性的影响仍然未知。在本研究中，我们报道了一系列含有不同长度的BODIPY轴向配体的卡铂基光活化铂( IV )前药的设计和合成。所得的 BODIPY 共轭铂 ( IV ) 前药OH2C–OH8C在相反的轴向位置带有羟基配体，在黑暗中比相应的含有乙酰基配体的前药AC2C–AC8C稳定性稍差。前药OH3C-OH8C在照射下可在8分钟内光活化，前药AC3C-AC8C的光活化速率进一步提高，仅需20秒。此外，前药AC3C ，其中BODIPY光吸收剂和铂中心之间的连接体具有适当的长度，在乙酰化前药AC2C-AC8C中光活化最快。高细胞

  DOI：

  10.1039/d1dt02362d

文献信息

• SUBSTITUTED BRIDGED UREA ANALOGS AS SIRTUIN MODULATORS
  申请人：GLAXOSMITHKLINE LLC

  公开号：US20150152108A1

  公开（公告）日：2015-06-04

  The present invention relates to novel substituted bridged urea compounds, corresponding related analogs, pharmaceutical compositions and methods of use thereof. Sirtuin-modulating compounds of the present invention may be used for increasing the lifespan of a cell, and treating and/or preventing a wide variety of diseases and disorders, which include, but are not limited to, for example, diseases or disorders related to aging or stress, diabetes, obesity, neurodegenerative diseases, cardiovascular disease, blood clotting disorders, inflammation, cancer, and/or flushing as well as diseases or disorders that would benefit from increased mitochondrial activity. The present invention also related to compositions comprising a sirtuin-modulating compound in combination with another therapeutic agent.

  本发明涉及新型取代桥式脲化合物，相应的相关类似物，药物组合物以及其使用方法。本发明的抑制素调节化合物可用于延长细胞寿命，并治疗和/或预防各种疾病和疾病，包括但不限于与衰老或压力、糖尿病、肥胖、神经退行性疾病、心血管疾病、血液凝块疾病、炎症、癌症和/或潮红有关的疾病或疾病，以及那些会受益于增加线粒体活性的疾病或疾病。本发明还涉及包含抑制素调节化合物与另一治疗剂组合的组合物。
• Rational Design and Development of Near-Infrared-Emitting Firefly Luciferins Available In Vivo
  作者：Ryosuke Kojima、Hideo Takakura、Takeaki Ozawa、Yukio Tada、Tetsuo Nagano、Yasuteru Urano

  DOI：10.1002/anie.201205151

  日期：2013.1.21

  Shine on: A new rational design strategy for near‐infrared‐emitting firefly luciferins that are available in vivo has been developed using intramolecular bioluminescence resonance energy transfer (BRET). The emission wavelength could be freely tuned by the choice of BRET acceptor, and NIR bioluminescence could be detected in living cells and mice without the need for luciferase manipulation.

  发光：利用分子内生物发光共振能量转移（BRET）为体内可用的近红外发射萤火虫荧光素开发了一种新的合理设计策略。可以通过选择BRET受体自由调节发射波长，并且可以在不需要荧光素酶操作的情况下在活细胞和小鼠中检测NIR生物发光。
• [EN] PENICILLIN-BINDING PROTEIN INHIBITORS<br/>[FR] INHIBITEURS DE PROTÉINES DE LIAISON À LA PÉNICILLINE
  申请人：VENATORX PHARMACEUTICALS INC

  公开号：WO2018218190A1

  公开（公告）日：2018-11-29

  Described herein are certain boron-containing compounds, compositions, preparations and their use as modulators of the transpeptidase function of bacterial penicillin-binding proteins and as antibacterial agents. In some embodiments, the compounds described herein inhibit penicillin-binding proteins. In certain embodiments, the compounds described herein are useful in the treatment of bacterial infections.

  本文描述了某些含硼化合物、组合物、制剂及它们作为细菌青霉素结合蛋白的跨肽酶功能调节剂和抗菌剂的用途。在某些实施例中，本文描述的化合物抑制青霉素结合蛋白。在某些实施例中，本文描述的化合物在治疗细菌感染方面是有用的。
• [EN] SILANOL BASED THERAPEUTIC PAYLOADS<br/>[FR] CHARGES UTILES THÉRAPEUTIQUES À BASE DE SILANOL
  申请人：BLINKBIO INC

  公开号：WO2017214491A1

  公开（公告）日：2017-12-14

  Described herein in part are silanol based therapeutic payloads comprising a silanol terminus, a divalent spacer moiety, and a drug moiety capable of effecting a target cell or tissue.

  本文部分描述了基于硅醇的治疗载荷，包括硅醇末端、二价间隔基团和能够影响靶细胞或组织的药物基团。
• [EN] DESIGN AND SYNTHESIS OF NOVEL DISULFIDE LINKER BASED NUCLEOTIDES AS REVERSIBLE TERMINATORS FOR DNA SEQUENCING BY SYNTHESIS<br/>[FR] DÉRIVÉS NUCLÉOTIDIQUES ET LEURS MÉTHODES D'UTILISATION
  申请人：UNIV COLUMBIA

  公开号：WO2017058953A1

  公开（公告）日：2017-04-06

  Disclosed herein, inter alia, are compounds, compositions, and methods of use thereof in the sequencing a nucleic acid.

  在此披露的内容包括化合物、组合物以及它们在核酸测序中的使用方法。