(S)-tert-butyl 2-(4-methoxy-1H-indole-2-carboxamido)-4-methylpentanoate | 1471484-96-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: (S)-tert-butyl 2-(4-methoxy-1H-indole-2-carboxamido)-4-methylpentanoate
• 英文别名: tert-butyl (2S)-2-[(4-methoxy-1H-indole-2-carbonyl)amino]-4-methyl-pentanoate；tert-butyl (4-methoxy-1H-indole-2-carbonyl)-L-leucinate；tert-butyl (2S)-2-[(4-methoxy-1H-indole-2-carbonyl)amino]-4-methylpentanoate
• CAS: 1471484-96-4
• 化学式: C₂₀H₂₈N₂O₄
• 分子量: 360.453
• InChiKey: ULTUEZGZKGEQNS-INIZCTEOSA-N

物化性质

• 沸点：
  561.4±40.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.129±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.3
• 重原子数：
  26
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  80.4
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (S)-tert-butyl 2-(4-methoxy-1H-indole-2-carboxamido)-4-methylpentanoate 在 potassium carbonate 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 12.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  一种新型拟肽衍生物及其药物组合物和用途

  摘要：

  本发明公开了一种新型拟肽衍生物及其药物组合物和用途，所述新型拟肽衍生物如式(I0‑1)所示；该化合物可用于制备抗病毒的药物。

  公开号：

  CN115806570A
• 作为产物：
  描述：

  4-甲氧基吲哚-2-羧酸 、 L-亮氨酸叔丁酯盐酸盐 在 三乙胺 、 1-丙基磷酸酐 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 以431.2 mg的产率得到(S)-tert-butyl 2-(4-methoxy-1H-indole-2-carboxamido)-4-methylpentanoate
  参考文献：
  名称：

  炔烃作为潜在弹头共价靶向 SARS-CoV-2 主要蛋白酶

  摘要：

  迫切需要改进治疗方法，以更好地控制持续的 COVID-19 大流行。主要蛋白酶 M pro在 SARS-CoV-2 复制中发挥着关键作用，因此成为抗病毒开发的一个有吸引力的靶点。我们寻求识别新型亲电子弹头，以有效、共价抑制 M pro 。通过比较安装在通用支架上的一组弹头与 M pro的功效，我们发现末端炔烃可以共价修饰 M pro作为潜在弹头。我们的生化和 X 射线结构分析揭示了炔烃和 M pro的催化半胱氨酸之间乙烯基硫键的不可逆形成。开发了基于炔烃抑制剂的可点击探针来测量靶标结合、药物停留时间和脱靶效应。最好的含炔抑制剂可有效抑制细胞感染模型中的 SARS-CoV-2 感染。我们的研究结果强调了炔烃作为潜在弹头针对病毒及其他物质中的胱氨酸蛋白酶的巨大潜力。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.3c00810

文献信息

• Inhibitors of cysteine proteases and methods of use thereof
  申请人：Pardes Biosciences, Inc.

  公开号：US11124497B1

  公开（公告）日：2021-09-21

  The disclosure provides compounds with warheads and their use in treating medical diseases or disorders, such as viral infections. Pharmaceutical compositions and methods of making various compounds with warheads are provided. The compounds are contemplated to inhibit proteases, such as the 3C, CL- or 3CL-like protease. Exemplary compounds provided include Formula II-I, where R3, RB are provided herein:

  该披露提供了具有战斗头的化合物及其在治疗医学疾病或紊乱，如病毒感染方面的用途。提供了制药组合物和制备各种带有战斗头的化合物的方法。这些化合物被认为能够抑制蛋白酶，如3C、CL-或3CL样蛋白酶。提供的示例化合物包括Formula II-I，其中R3、RB如下所示：
• Development of potent dipeptide-type SARS-CoV 3CL protease inhibitors with novel P3 scaffolds: Design, synthesis, biological evaluation, and docking studies
  作者：Pillaiyar Thanigaimalai、Sho Konno、Takehito Yamamoto、Yuji Koiwai、Akihiro Taguchi、Kentaro Takayama、Fumika Yakushiji、Kenichi Akaji、Shen-En Chen、Aurash Naser-Tavakolian、Arne Schön、Ernesto Freire、Yoshio Hayashi

  DOI：10.1016/j.ejmech.2013.07.037

  日期：2013.10

  We report the design and synthesis of a series of dipeptide-type inhibitors with novel P3 scaffolds that display potent inhibitory activity against SARS-CoV 3CLpro. A docking study involving binding between the dipeptidic lead compound 4 and 3CLpro suggested the modification of a structurally flexible P3 N-(3-methoxyphenyl)glycine with various rigid P3 moieties in 4. The modifications led to the identification

  我们报告了一系列具有新型 P3 支架的二肽型抑制剂的设计和合成，这些抑制剂对 SARS-CoV 3CLpro 显示出有效的抑制活性。一项涉及二肽先导化合物 4 和 3CLpro 之间结合的对接研究表明，用 4 中的各种刚性 P3 部分对结构灵活的 P3 N-(3-甲氧基苯基)甘氨酸进行修饰。这些修饰导致了几种有效衍生物的鉴定，包括 5c -k 和 5n 的抑制活性（Ki 或 IC50）在亚微摩尔至纳摩尔范围内。尤其是化合物 5h，显示出最有效的抑制活性，Ki 值为 0.006 μM。该效力比先导化合物 4 的效力高 65 倍 (Ki=0.39 μM)。此外，5h 的 Ki 值与等温滴定量热法 (ITC) 中观察到的结合亲和力 (16 nM) 非常吻合。围绕先导 4 中 P3 基团的 SAR 研究发现刚性吲哚-2-羰基单元是最佳 P3 部分之一 (5c)。进一步优化表明，吲哚单元4位的甲氧基取代非常有利于增强抑制效力。
• INHIBITORS OF CYSTEINE PROTEASES AND METHODS OF USE THEREOF
  申请人：Pardes Biosciences, Inc.

  公开号：US20210355111A1

  公开（公告）日：2021-11-18

  The disclosure provides compounds with warheads and their use in treating medical diseases or disorders, such as viral infections. Pharmaceutical compositions and methods of making various compounds with warheads are provided. The compounds are contemplated to inhibit proteases, such as the 3C, CL- or 3CL-like protease.
• [EN] INHIBITORS OF CYSTEINE PROTEASES AND METHODS OF USE THEREOF<br/>[FR] INHIBITEURS DE CYSTÉINE PROTÉASES ET LEURS PROCÉDÉS D'UTILISATION
  申请人：PARDES BIOSCIENCES INC

  公开号：WO2021252644A1

  公开（公告）日：2021-12-16

  The disclosure provides compounds of formula II with warheads and their use in treating medical diseases or disorders, such as viral infections. Pharmaceutical compositions and methods of making various compounds with warheads are provided. The compounds are contemplated to inhibit proteases, such as the 3C, CL- or 3CL-like protease. Formula II