Pro(2)-Ile(3)-S-deoxoamaninamide | 78897-50-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: Pro(2)-Ile(3)-S-deoxoamaninamide
• 英文别名: 2-[(1R,4S,10S,13S,16S,34S)-13,34-bis[(2S)-butan-2-yl]-2,5,11,14,30,33,36,39-octaoxo-27-thia-3,6,12,15,25,29,32,35,38-nonazapentacyclo[14.12.11.06,10.018,26.019,24]nonatriaconta-18(26),19,21,23-tetraen-4-yl]acetamide
• CAS: 78897-50-4
• 化学式: C₃₉H₅₄N₁₀O₉S
• 分子量: 838.985
• InChiKey: VSUWJMOOQSBLQH-PRGUOHEVSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.6
• 重原子数：
  59
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  308
• 氢给体数：
  9
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Fmoc-S-三苯甲基-L-半胱氨酸 、 Pro(2)-Ile(3)-S-deoxoamaninamide 在 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 0.33h， 生成
  参考文献：
  名称：

  环内Savige-Fontana反应：将一类单环肽一步转化为另一类双环肽。

  摘要：

  环化和交联策略对于合成环状和双环肽很重要。这些大内酰胺由于与线性类似物相比具有增强的生物活性而引起人们的极大兴趣。在本文中，我们描述了含有Hpi毒基团的环状肽的合成，让人联想到phakellistatins和omphalotins。然后提出了这种肽的首次环内交联：使用纯TFA催化Savige-Fontana色氨酸的亚硫酰化，将含Hpi的肽转化为双环酰胺毒素类似物。这样，该方法学代表了用于交联肽的有效环化方法，并揭示了两种不同类别的肽天然产物之间迄今未实现的关系。这一发现增加了用于文库生成的潜在化学空间的程度。

  DOI：

  10.1002/chem.200701088
• 作为产物：
  描述：

  [syn-cis]-cyclo(Cys(Tr)-Asn(Tr)-Pro-Ile-Hpi-Gly-Ile-Glu) 在 三氟乙酸 作用下， 反应 5.0h， 以59%的产率得到Pro(2)-Ile(3)-S-deoxoamaninamide
  参考文献：
  名称：

  环内Savige-Fontana反应：将一类单环肽一步转化为另一类双环肽。

  摘要：

  环化和交联策略对于合成环状和双环肽很重要。这些大内酰胺由于与线性类似物相比具有增强的生物活性而引起人们的极大兴趣。在本文中，我们描述了含有Hpi毒基团的环状肽的合成，让人联想到phakellistatins和omphalotins。然后提出了这种肽的首次环内交联：使用纯TFA催化Savige-Fontana色氨酸的亚硫酰化，将含Hpi的肽转化为双环酰胺毒素类似物。这样，该方法学代表了用于交联肽的有效环化方法，并揭示了两种不同类别的肽天然产物之间迄今未实现的关系。这一发现增加了用于文库生成的潜在化学空间的程度。

  DOI：

  10.1002/chem.200701088

文献信息

• Synthesis, Characterisation, and In Vitro Evaluation of Pro2-Ile3-S-Deoxo-Amaninamide and Pro2-D-allo-Ile3-S-Deoxo-Amaninamide: Implications for Structure–Activity Relationships in Amanitin Conformation and Toxicity
  作者：Jonathan P. May、Pierre Fournier、Brian O. Patrick、David M. Perrin

  DOI：10.1002/chem.200701297

  日期：2008.4.7

  structure as previously suggested in syntheses of related amanitin analogues. Crystallographic data of 1 a confirms the presence of a betaII-turn, rather than a betaI-turn common to the natural toxin and 1 b. This difference explains the large variation in CD spectra, although it seems to have relatively little effect on the bioactivity in vitro. These data provide new insights into the bicyclic amatoxin

  Amatoxins是抑制RNA聚合酶II的有毒双环肽家族。在本文中，我们讨论了通过固相方法从容易获得的氨基酸中改进这些化合物的合成。有趣的是，在最终的宏观环化之后，我们获得了两种质量相同的产品，这与某些先前报告中所述的相似产品分布有关。这些产品之一是所需的amatoxin。Pro（2）-Ile（3）-S-脱氧-天麻酰胺1 b。经过深入研究后，另一种化合物被确认为差向异构体Pro（2）-D-allo-Ile（3）-S-deoxo-天麻酰胺1a，而不是先前在相关天冬氨酸类似物的合成中建议的阻转异构体结构。1 a的晶体学数据证实存在betaII-turn，而不是天然毒素和1b共有的betaI-turn。这种差异解释了CD光谱的巨大变化，尽管它似乎对体外生物活性的影响相对较小。这些数据为双环amatoxin结构提供了新的见解。