amino(((1S,2S)-1-(2-((4-chloro-3-fluorophenyl)amino)-2-oxoacetamido)-2,3-dihydro-1H-inden-2-yl)amino)methaniminium formate | 1374035-59-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: amino(((1S,2S)-1-(2-((4-chloro-3-fluorophenyl)amino)-2-oxoacetamido)-2,3-dihydro-1H-inden-2-yl)amino)methaniminium formate
• 英文别名: N1-(4-chloro-3-fluorophenyl)-N2-[(1S,2S)-2-guanidino-2,3-dihydro-1H-inden-1-yl]oxalamide formate；DMJ-I-228；N1-(4-Chloro-3-fluorophenyl)-N2-((1S,2S)-2-guanidino-2,3-dihydro-1H-inden-1-yl)oxalamide formate；N'-(4-chloro-3-fluorophenyl)-N-[(1S,2S)-2-(diaminomethylideneamino)-2,3-dihydro-1H-inden-1-yl]oxamide;formic acid
• CAS: 1374035-59-2
• 化学式: CH₂O₂*C₁₈H₁₇ClFN₅O₂
• 分子量: 435.842
• InChiKey: WUILLEJRRYSPRZ-YYLIZZNMSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.17
• 重原子数：
  30
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.16
• 拓扑面积：
  160
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  (1S,2R)-1-(2-((4-chloro-3-fluorophenyl)amino)-2-oxoacetamido)-2,3-dihydro-1H-inden-2-yl 4-methylbenzenesulfonate 在 sodium azide 、 Pb-poisoned 5% Pd-CaCO3 、 氢气 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 甲醇 、 二甲基亚砜 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 20.5h， 生成 amino(((1S,2S)-1-(2-((4-chloro-3-fluorophenyl)amino)-2-oxoacetamido)-2,3-dihydro-1H-inden-2-yl)amino)methaniminium formate
  参考文献：
  名称：

  双热点小分子 HIV-1 进入抑制剂的基于结构的设计、合成和表征

  摘要：

  HIV-1 的细胞感染始于病毒包膜糖蛋白 gp120 和细胞受体蛋白 CD4 之间的结合事件。CD4-gp120 界面由两个热点控制：由 Phe43 CD4封盖的疏水 gp120 腔和残基 Arg59 CD4和 Asp368 gp120之间的静电相互作用。CD4 模拟小分子 NBD-556 ( 1 ) 结合在 gp120 腔内；然而，1和相关的同源物表现出有限的病毒中和广度。在此，我们报告了 gp120 与同时结合两个结合热点的小分子复合物的设计、合成、表征和 X 射线结构。这些化合物特异性地抑制 42 种二级进化枝 B 和 C 病毒的病毒感染，并被证明是进入 CD4 阴性细胞的拮抗剂。因此，双热点设计既提供了一种增强 HIV-1 进入抑制剂的中和效力的方法，又提供了一种抑制 CD4-gp120 蛋白质-蛋白质相互作用的新型结构范式。

  DOI：

  10.1021/jm300265j

文献信息

• Structure-Based Design, Synthesis, and Characterization of Dual Hotspot Small-Molecule HIV-1 Entry Inhibitors
  作者：Judith M. LaLonde、Young Do Kwon、David M. Jones、Alexander W. Sun、Joel R. Courter、Takahiro Soeta、Toyoharu Kobayashi、Amy M. Princiotto、Xueling Wu、Arne Schön、Ernesto Freire、Peter D. Kwong、John R. Mascola、Joseph Sodroski、Navid Madani、Amos B. Smith

  DOI：10.1021/jm300265j

  日期：2012.5.10

  neutralization breadth. Herein, we report the design, synthesis, characterization, and X-ray structures of gp120 in complex with small molecules that simultaneously engage both binding hotspots. The compounds specifically inhibit viral infection of 42 tier 2 clades B and C viruses and are shown to be antagonists of entry into CD4-negative cells. Dual hotspot design thus provides both a means to enhance neutralization

  HIV-1 的细胞感染始于病毒包膜糖蛋白 gp120 和细胞受体蛋白 CD4 之间的结合事件。CD4-gp120 界面由两个热点控制：由 Phe43 CD4封盖的疏水 gp120 腔和残基 Arg59 CD4和 Asp368 gp120之间的静电相互作用。CD4 模拟小分子 NBD-556 ( 1 ) 结合在 gp120 腔内；然而，1和相关的同源物表现出有限的病毒中和广度。在此，我们报告了 gp120 与同时结合两个结合热点的小分子复合物的设计、合成、表征和 X 射线结构。这些化合物特异性地抑制 42 种二级进化枝 B 和 C 病毒的病毒感染，并被证明是进入 CD4 阴性细胞的拮抗剂。因此，双热点设计既提供了一种增强 HIV-1 进入抑制剂的中和效力的方法，又提供了一种抑制 CD4-gp120 蛋白质-蛋白质相互作用的新型结构范式。