(3aS,4S,7R,9aS,9bS)methyl 4-azido-2,2-dimethyl-5-oxohexahydro-3aH-[1,3]dioxolo[4,5-c]thiazolo[3,2-a]pyridine-7-carboxylate | 1334590-56-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: (3aS,4S,7R,9aS,9bS)methyl 4-azido-2,2-dimethyl-5-oxohexahydro-3aH-[1,3]dioxolo[4,5-c]thiazolo[3,2-a]pyridine-7-carboxylate
• CAS: 1334590-56-5
• 化学式: C₁₂H₁₆N₄O₅S
• 分子量: 328.349
• InChiKey: IBQBLZSKYHIGDY-RPLNLOMXSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.64
• 重原子数：
  22.0
• 可旋转键数：
  2.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.83
• 拓扑面积：
  113.83
• 氢给体数：
  0.0
• 氢受体数：
  7.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (3aS,4S,7R,9aS,9bS)methyl 4-azido-2,2-dimethyl-5-oxohexahydro-3aH-[1,3]dioxolo[4,5-c]thiazolo[3,2-a]pyridine-7-carboxylate 在 palladium on carbon 、 氢气 、 三乙胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 (3R,6S,7S,8S,8aS)methyl 6-acetamido-7,8-dihydroxy-5-oxohexahydro-2H-thiazolo[3,2-a]pyridine-3-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  改进的δ-戊内酰胺模板，可通过硼酸酯形成来组装Aβ-迷你淀粉样物†

  摘要：

  所述6,7,8,8a-顺（清一色顺式的）取代的δ-戊内酰胺10，11和12是用于硼酸酯的形成高亲和力的二醇，优于相应的6,7-反式类似物1，3和4。X射线和NMR结构分析已经确定了六元环构象的差异，这些差异导致了全顺式立体异构体的酯化性能得到改善。同源低聚的顺式δ-戊内酰胺46–48被用作多肽低聚物49–52自组装的多元醇模板。通过动态共价化学。模板具有约5的二醇间隔，适合于由目标肽，2-甲酰基苯基硼酸和相应模板之间的定量反应组装支链肽。根据该策略，四聚体Aβ-最小淀粉样蛋白52由三组分系统中的九个单个分子自发形成。基于三聚体Aβ（32-40）-迷你淀粉样蛋白51的完整顺序分配进行的详细NMR分析确定了其在溶液中的三维结构。

  DOI：

  10.1039/c6ob00565a
• 作为产物：
  描述：

  (3aS,4R,7R,9aS,9bS)methyl 4-hydroxy-2,2-dimethyl-5-oxohexahydro-3aH-[1,3]dioxolo[4,5-c]thiazolo[3,2-a]pyridine-7-carboxylate 在 吡啶 、 sodium azide 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 (3aS,4S,7R,9aS,9bS)methyl 4-azido-2,2-dimethyl-5-oxohexahydro-3aH-[1,3]dioxolo[4,5-c]thiazolo[3,2-a]pyridine-7-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  改进的δ-戊内酰胺模板，可通过硼酸酯形成来组装Aβ-迷你淀粉样物†

  摘要：

  所述6,7,8,8a-顺（清一色顺式的）取代的δ-戊内酰胺10，11和12是用于硼酸酯的形成高亲和力的二醇，优于相应的6,7-反式类似物1，3和4。X射线和NMR结构分析已经确定了六元环构象的差异，这些差异导致了全顺式立体异构体的酯化性能得到改善。同源低聚的顺式δ-戊内酰胺46–48被用作多肽低聚物49–52自组装的多元醇模板。通过动态共价化学。模板具有约5的二醇间隔，适合于由目标肽，2-甲酰基苯基硼酸和相应模板之间的定量反应组装支链肽。根据该策略，四聚体Aβ-最小淀粉样蛋白52由三组分系统中的九个单个分子自发形成。基于三聚体Aβ（32-40）-迷你淀粉样蛋白51的完整顺序分配进行的详细NMR分析确定了其在溶液中的三维结构。

  DOI：

  10.1039/c6ob00565a

文献信息

• Structural characterization of a β-turn mimic within a protein–protein interface
  作者：Björn Eckhardt、Wolfgang Grosse、Lars-Oliver Essen、Armin Geyer

  DOI：10.1073/pnas.1004187107

  日期：2010.10.26

  β-turns are secondary structure elements not only exposed on protein surfaces, but also frequently found to be buried in protein–protein interfaces. Protein engineering so far considered mainly the backbone-constraining properties of synthetic β-turn mimics as parts of surface-exposed loops. A β-turn mimic, Hot═Tap, that is available in gram amounts, provides two hydroxyl groups that enhance its turn-inducing properties besides being able to form side-chain-like interactions. NMR studies on cyclic hexapeptides harboring the Hot═Tap dipeptide proved its strong β-turn-inducing capability. Crystallographic analyses of the trimeric fibritin-foldon/Hot═Tap hybrid reveal at atomic resolution how Hot═Tap replaces a βI’-turn by a βII’-type structure. Furthermore, Hot═Tap adapts to the complex protein environment by participating in several direct and water-bridged interactions across the foldon trimer interface. As building blocks, β-turn mimics capable of both backbone and side-chain mimicry may simplify the design of synthetic proteins.

  β-转是次要结构元素，不仅暴露在蛋白质表面，而且经常发现埋藏在蛋白质-蛋白质界面中。迄今为止，蛋白工程主要考虑了合成β-转模拟物的主链约束特性，作为表面暴露环的一部分。一种β-转模拟物Hot═Tap，可提供克级别的量，除了能够形成类似侧链的相互作用外，还提供了两个羟基团，增强了其诱导转变的性质。对含有Hot═Tap二肽的环六肽的NMR研究证实了其强烈的β-转诱导能力。三聚体纤维蛋白-折叠子/Hot═Tap混合物的晶体学分析揭示了Hot═Tap如何以原子分辨率取代βI'-转而形成βII'-型结构。此外，Hot═Tap通过参与折叠子三聚体界面上的数个直接和水桥接相互作用，适应了复杂的蛋白质环境。作为构建模块，既能模拟主链又能模拟侧链的β-转模拟物可能简化了合成蛋白质的设计。