(3S,4R,5S)-allyl 4-[(S)-2-amino-3-(tritylthio)propanamido]-3-(tert-butyldimethylsilyloxy)-5-methylheptanoate | 1027785-12-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: (3S,4R,5S)-allyl 4-[(S)-2-amino-3-(tritylthio)propanamido]-3-(tert-butyldimethylsilyloxy)-5-methylheptanoate
• 英文别名: prop-2-enyl (3S,4R,5S)-4-[[(2S)-2-amino-3-tritylsulfanylpropanoyl]amino]-3-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-methylheptanoate
• CAS: 1027785-12-1
• 化学式: C₃₉H₅₄N₂O₄SSi
• 分子量: 675.02
• InChiKey: DARSWGONZAGHNN-FECPPZIISA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  8.08
• 重原子数：
  47
• 可旋转键数：
  19
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.44
• 拓扑面积：
  116
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (3S,4R,5S)-allyl 4-[(S)-2-amino-3-(tritylthio)propanamido]-3-(tert-butyldimethylsilyloxy)-5-methylheptanoate 、 (R)-2-[(S,E)-3-(4-methoxybenzyloxy)-7-(tritylthio)hept-4-enamido]hexanoic acid 在 N-羟基-7-氮杂苯并三氮唑 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 5.0h， 以90%的产率得到(7S,11R,14S,17R,18S,E)-allyl 17-[(S)-sec-butyl]-11-butyl-18-(tert-butyldimethylsilyloxy)-7-(4-methoxybenzyloxy)-9,12,15-trioxo-1,1,1-triphenyl-14-(tritylthiomethyl)-2-thia-10,13,16-triazaicos-5-en-20-oate
  参考文献：
  名称：

  Total Synthesis of Thailandepsin B, a Potent HDAC Inhibitor Isolated from a Microorganism

  摘要：

  泰国肽 B 是一种双环去肽组蛋白去乙酰化酶抑制剂，从市售的 D-正亮氨酸甲酯和已知的(S,E)-3-(4-甲氧基苄氧基)-7-(三苯乙硫基)庚-4-烯酸开始，通过八个步骤高效合成，总产率为 51%。该方法的特点是通过含 D-异亮氨酸-D-半胱氨酸段与含 D-正亮氨酸段的缩合，直接组装出相应的仲酸，而仲酸是大内酯化过程中的关键前体。

  DOI：

  10.1248/cpb.c16-00060
• 作为产物：
  描述：

  (3S,4R,5S)-allyl 4-[(S)-2-(tert-butoxycarbonylamino)-3-(tritylthio)propanamide]-3-(tert-butyldimethylsilyloxy)-5-methylheptanoate 在 2,6-二甲基吡啶 、 三氟甲磺酸三甲基硅酯 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 1.0h， 以99%的产率得到(3S,4R,5S)-allyl 4-[(S)-2-amino-3-(tritylthio)propanamido]-3-(tert-butyldimethylsilyloxy)-5-methylheptanoate
  参考文献：
  名称：

  螺旋藻抑素B是一种有效的组蛋白脱乙酰基酶抑制剂，是从微生物中完全合成的。

  摘要：

  一种有效的组蛋白脱乙酰基酶抑制剂spiruchostatin B的第一个全合成以收敛的方式得以实现。合成在C5''位置建立了立体化学。

  DOI：

  10.1039/b718310k

文献信息

• Total synthesis of burkholdacs A and B and 5,6,20-tri-epi-burkholdac A: HDAC inhibition and antiproliferative activity
  作者：Yurie Fukui、Koichi Narita、Singo Dan、Takao Yamori、Akihiro Ito、Minoru Yoshida、Tadashi Katoh

  DOI：10.1016/j.ejmech.2014.02.044

  日期：2014.4

  The bicyclic depsipeptide histone deacetylase (HDAC) inhibitors burkholdacs A and B were efficiently synthesized in a highly convergent and unified manner. The synthesis features the amide coupling of a d-valine-d-cysteine- or d-allo-isoleucine-d-cysteine-containing segment with a d-methionine-containing segment to directly assemble the corresponding seco-acids, key precursors for macrolactonization

  双环二肽组蛋白去乙酰化酶（HDAC）抑制剂burkholDACs A和B以高度收敛和统一的方式高效合成。合成功能的酰胺耦合d -valine- d -cysteine-或d -异体-isoleucine- d段与含半胱氨酸- d含蛋氨酸片段直接装配相应的开环-acids，用于macrolactonization关键前体。使用同样的方法，5,6,20三-外延还合成了-burkholDACA。合成的双肽肽的HDAC抑制试验和细胞生长抑制分析表明，与临床批准的双肽肽FK228（romidepsin）相比，这类双环双肽肽的效价顺序更高。还揭示了这类化合物中的新型结构-活性关系。
• Total Synthesis of the Bicyclic Depsipeptide HDAC Inhibitors Spiruchostatins A and B, 5′′-<i>epi</i>-Spiruchostatin B, FK228 (FR901228) and Preliminary Evaluation of Their Biological Activity
  作者：Koichi Narita、Takuya Kikuchi、Kazuhiro Watanabe、Toshiya Takizawa、Takamasa Oguchi、Kyosuke Kudo、Keisuke Matsuhara、Hideki Abe、Takao Yamori、Minoru Yoshida、Tadashi Katoh

  DOI：10.1002/chem.200901552

  日期：2009.10.26

  Julia–Kocienski olefination of a 1,3‐propanediol‐derived sulfone and a L‐ or D‐malic acid‐derived aldehyde to access the most synthetically challenging unit, (3S or 3R,4E)‐3‐hydroxy‐7‐mercaptohept‐4‐enoic acid, present in a D‐alanine‐ or D‐valine‐containing segment; ii) a condensation of a D‐valine‐D‐cysteine‐ or D‐allo‐isoleucine‐D‐cysteine‐containing segment with a D‐alanine‐ or D‐valine‐containing

  双环去肽肽组蛋白去乙酰化酶（HDAC）抑制剂spiruchostatins A和B，5'′- epi- spiruchostatin B和FK228可以通过聚合和统一的方式高效合成。合成方法涉及以下关键步骤：i）1，3-丙二醇衍生的砜和L-或D-苹果酸衍生的醛的Julia-Kocienski烯化反应，以合成最具挑战性的单元（3 S或3 R，4 E）-3-羟基-7-巯基庚基-4-烯酸，存在于含有D-丙氨酸或D-缬氨酸的链段中；ii）D-缬氨酸-D-半胱氨酸-或D的缩合-同种异体-isoleucine- d -半胱氨酸含与段d -alanine-或d含缬氨酸段直接组装相应的开环-acids; 和iii）的大环化开环使用椎名法或光延法构造必需15-或16-元大环内酯-酸。本合成已建立了螺旋藻抑素B的C5'立体化学。此外，对合成的二肽的HDAC抑制测定和细胞生长抑制分析确定了其效力的顺序，并揭示了