8-(2-deoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)-2-<<(dimethylamino)methylidene>amino>-8H-imidazo<1,2-a><1,3,5>triazin-4-one | 220859-68-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 唑类
• 英文名称: 8-(2-deoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)-2-<<(dimethylamino)methylidene>amino>-8H-imidazo<1,2-a><1,3,5>triazin-4-one
• CAS: 220859-68-7
• 化学式: C₁₃H₁₈N₆O₄
• 分子量: 322.324
• InChiKey: PUKKVFDIYOGUJB-IVZWLZJFSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.25
• 重原子数：
  23.0
• 可旋转键数：
  4.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.54
• 拓扑面积：
  117.48
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  9.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  8-(2-deoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)-2-<<(dimethylamino)methylidene>amino>-8H-imidazo<1,2-a><1,3,5>triazin-4-one 在 氨 作用下， 以 水 为溶剂， 生成 2-<(dimethylamino)methylidene>amino-8H-imidazo<1,2-a><1,3,5>triazin-4-one
  参考文献：
  名称：

  5-Aza-7-deaza-2'-deoxyguanosine：双碱基核心中具有新颖碱基对，平行链取向和质子化位点的寡核苷酸双链体

  摘要：

  合成了含有5-氮杂-7-脱氮-2'-脱氧鸟苷（1）的寡核苷酸。用膦酸酯15或亚磷酰胺5进行固相合成。还使用了氨基未保护的膦酸酯4。含有1个寡核苷酸的杂交研究导致新的碱基对导致双链具有平行（ps）或反平行（aps）链取向。在具有平行链的那些中，在5-氮杂-7-脱氮鸟嘌呤和鸟嘌呤或7-脱氮鸟嘌呤之间观察到稳定的“嘌呤-嘌呤”碱基对。当5-氮杂-7-脱氮鸟嘌呤与胞嘧啶配对时，会形成反平行链双链体。该碱基对在中性条件下仅具有两个氢键，但在酸性介质中被第三个氢键稳定。在1的碱基和异鸟嘌呤（中性培养基）之间也检测到新的碱基对。

  DOI：

  10.1002/(sici)1099-0690(199902)1999:2<485::aid-ejoc485>3.0.co;2-j
• 作为产物：
  描述：

  5-aza-7-deaza-2'-deoxyguanosine 、 N,N-二甲基甲酰胺二甲基缩醛 以 甲醇 为溶剂， 以66%的产率得到8-(2-deoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)-2-<<(dimethylamino)methylidene>amino>-8H-imidazo<1,2-a><1,3,5>triazin-4-one
  参考文献：
  名称：

  5-Aza-7-deaza-2'-deoxyguanosine：双碱基核心中具有新颖碱基对，平行链取向和质子化位点的寡核苷酸双链体

  摘要：

  合成了含有5-氮杂-7-脱氮-2'-脱氧鸟苷（1）的寡核苷酸。用膦酸酯15或亚磷酰胺5进行固相合成。还使用了氨基未保护的膦酸酯4。含有1个寡核苷酸的杂交研究导致新的碱基对导致双链具有平行（ps）或反平行（aps）链取向。在具有平行链的那些中，在5-氮杂-7-脱氮鸟嘌呤和鸟嘌呤或7-脱氮鸟嘌呤之间观察到稳定的“嘌呤-嘌呤”碱基对。当5-氮杂-7-脱氮鸟嘌呤与胞嘧啶配对时，会形成反平行链双链体。该碱基对在中性条件下仅具有两个氢键，但在酸性介质中被第三个氢键稳定。在1的碱基和异鸟嘌呤（中性培养基）之间也检测到新的碱基对。

  DOI：

  10.1002/(sici)1099-0690(199902)1999:2<485::aid-ejoc485>3.0.co;2-j