N-FMOC-(S)-2-甲氨基丁酸 | 1310575-53-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 中文名称: N-FMOC-(S)-2-甲氨基丁酸
• 中文别名: N-Fmoc-(S)-2-甲氨基丁酸
• 英文名称: L-NMeabuFmoc
• 英文别名: Fmoc-N-methyl-L-2-aminobutyric acid；(2S)-2-[9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonyl(methyl)amino]butanoic acid
• CAS: 1310575-53-1
• 化学式: C₂₀H₂₁NO₄
• 分子量: 339.391
• InChiKey: WBNLTUKBCCEZSD-SFHVURJKSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.8
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.3
• 拓扑面积：
  66.8
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

安全信息

• 危险性防范说明：
  P261,P264,P270,P271,P280,P301+P312,P302+P352,P304+P340,P330,P363,P501
• 危险性描述：
  H302,H312,H332

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  H-Ala-2-chlorotrityl resin 、 Fmoc-L-缬氨酸 、 Fmoc-L-丙氨酸 、 N-FMOC-(S)-2-甲氨基丁酸 、 Fmoc-N-甲基-L-亮氨酸 、 Fmoc-D-丙氨酸 、 芴甲氧羰酰基肌氨酸 、 N-芴甲氧羰基-L-2-氨基丁酸 在 N-羟基-7-氮杂苯并三氮唑 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 、 哌啶 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 0.75h， 生成 CSA-1Leu11Abu
  参考文献：
  名称：

  Lipophilic Permeability Efficiency Reconciles the Opposing Roles of Lipophilicity in Membrane Permeability and Aqueous Solubility

  摘要：

  As drug discovery moves increasingly toward previously "undruggable" targets such as protein-protein interactions, lead compounds are becoming larger and more lipophilic. Although increasing lipophilicity can improve membrane permeability, it can also incur serious liabilities, including poor water solubility, increased toxicity, and faster metabolic clearance. Here we introduce a new efficiency metric, especially relevant to "beyond rule of 5" molecules, that captures, in a simple, unitless value, these opposing effects of lipophilicity on molecular properties. Lipophilic permeability efficiency (LPE) is defined as log D-dec/w(7.4) - m(lipo)cLogP + b(scaffold), where log D-dec/w(7.4) is the experimental decadiene-water distribution coefficient (pH 7.4), cLogP is the calculated octanol-water partition coefficient, and m(lipo) and b(scaffold) are scaling factors to standardize LPE values across different cLogP metrics and scaffolds. Using a variety of peptidic and nonpeptidic macrocycle drugs, we show that LPE provides a functional assessment of the efficiency with which a compound achieves passive membrane permeability at a given lipophilicity.

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.8b01259
• 作为产物：
  描述：

  聚合甲醛 、 N-芴甲氧羰基-L-2-氨基丁酸 在 D(+)-10-樟脑磺酸 、 三乙基硅烷 、 三氟乙酸 作用下， 以 甲苯 、 二氯甲烷 为溶剂， 以91 %的产率得到N-FMOC-(S)-2-甲氨基丁酸
  参考文献：
  名称：

  通过主链和侧链修饰控制环孢菌素衍生物的变色行为和膜渗透性

  摘要：

  一些大环化合物通过不同环境极性下的构象转换表现出增强的膜渗透性，这种特性被称为变色龙行为。在这项研究中，我们展示了特定的主链和侧链修饰，可以使用环孢菌素 O (CsO) 支架控制变色行为和被动膜通透性。为了量化变色行为，我们使用了每种 CsO 衍生物在极性溶剂和非极性溶剂中获得的闭合构象的总体比率。我们发现1位（ 1和3）的β-羟基化可以编码变色性并提高通透性。然而，通过添加额外的跨环氢键（2和5）引起的构象稳定导致膜渗透速率减慢得多。我们的 CsO 支架为系统研究构象、膜通透性、溶解度和蛋白质结合之间的关系提供了一个平台。这些知识有助于发现能够靶向不可成药靶标的强效超越五规则（bRo5）大环化合物。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.3c01140

文献信息

• CYCLIC PEPTIDE COMPOUND HAVING HIGH MEMBRANE PERMEABILITY, AND LIBRARY CONTAINING SAME
  申请人：Chugai Seiyaku Kabushiki Kaisha

  公开号：US20200131669A1

  公开（公告）日：2020-04-30

  The present inventors have found that when screening for cyclic peptide compounds that can specifically bind to a target molecule, the use of a library including cyclic peptide compounds having a long side chain in the cyclic portion can improve the hit rate for cyclic peptide compounds that can specifically bind to the target molecule. Meanwhile, the present inventors have found that tryptophan and tyrosine residues, which have conventionally been used in oral low molecular-weight pharmaceuticals and are amino acid residues having an indole skeleton or a hydroxyphenyl group, are not suitable for peptides intended to attain high membrane permeability.