((2R,3R,4R,5R)-3,4-bis((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-2-yl)methyl sulfamate | 1608115-46-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: ((2R,3R,4R,5R)-3,4-bis((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-2-yl)methyl sulfamate
• CAS: 1608115-46-3
• 化学式: C₂₁H₄₁N₃O₈SSi₂
• 分子量: 551.809
• InChiKey: ZXTQWNLSJPVLEP-VDHUWJSZSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.43
• 重原子数：
  35.0
• 可旋转键数：
  8.0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.81
• 拓扑面积：
  151.94
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  9.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  ((2R,3R,4R,5R)-3,4-bis((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-2-yl)methyl sulfamate 在 水 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 、 三氟乙酸 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 27.0h， 生成 5'-O-(N-L-isoleucyl)sulfamoyluridine
  参考文献：
  名称：

  碱基取代的5'- O-（N-异亮氨酰）氨磺酰基核苷类似物作为潜在的抗菌剂

  摘要：

  氨基酰基氨磺酰基腺苷是体外相应的原核和真核tRNA合成酶的众所周知的纳摩尔抑制剂。受Cubist Pharmaceuticals含芳基四唑的化合物和天然抗生素albomycin中发现的修饰碱基的启发，氨磺酰化腺苷的选择性问题促使我们研究腺嘌呤碱基在药理上的重要性。因此，我们合成并评估了几种异亮氨酰氨磺酰基核苷类似物，它们具有尿嘧啶，胞嘧啶，次黄嘌呤，鸟嘌呤，1，3-二氮杂腺嘌呤（苯并咪唑）或4-硝基苯并咪唑作为杂环碱基。基于微霉素C的结构和抗菌活性，我们还制备了它们的六肽基缀合物，以提高它们的吸收潜力。我们进一步在体外和细胞分析中将它们的抗菌活性与母体异亮氨酰氨磺酰基腺苷（Ile-SA）进行了比较。令人惊讶地，发现含有尿嘧啶类似物的最强的体外抑制作用16楼。不幸的是，由于低吸收，仅发现非常弱的生长抑制特性。根据先前的文献发现对结果进行讨论。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2014.03.040
• 作为产物：
  描述：

  尿嘧啶核苷 在 咪唑 、 甲酸 、 氯磺酰异氰酸酯 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基乙酰胺 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 26.0h， 生成 ((2R,3R,4R,5R)-3,4-bis((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)tetrahydrofuran-2-yl)methyl sulfamate
  参考文献：
  名称：

  嘧啶取代的氨基酰基-氨磺酰基酰基核苷作为靶向I类氨基酰基-tRNA合成酶的潜在抑制剂的比较分析

  摘要：

  氨酰基-tRNA合成酶（aaRSs）催化氨基酸与其同源tRNA的ATP依赖性偶联。aaRSs对于蛋白质翻译至关重要，被认为是开发新型抗菌剂的有希望的目标。5'- O-（N-氨基酰基）-氨磺酰基腺苷（aaSA）是aaRS反应中间体的不可水解类似物，已显示是该酶家族的有效抑制剂，但易于化学不稳定和酶促修饰。为了改善该支架的分子性质，我们合成了一系列碱基取代的aaSA类似物，其包括靶向胞嘧啶，酪氨酰基和异亮氨酰-tRNA合成酶的胞嘧啶，尿嘧啶和N 3-甲基尿嘧啶。在体外九种抑制剂中的七种检测结果表明K i app值在低纳摩尔范围内。为了补充生物化学研究，淋病奈瑟氏球菌亮氨酰tRNA合成酶和大肠杆菌的X射线晶体学结构测定了与新合成的化合物复合的酪氨酰-tRNA合成酶。这些突显了在限定相对抑制活性中碱基部分和靶酶之间的微妙相互作用。受此数据的鼓励，我们研究了嘧啶同源物是否可以逃避天然抗性机制，涉及通

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2019.04.003