tert-butyl N-[3-[2-amino-8-(dimethylcarbamoyl)-8,9-dihydro-7H-pyrano[2,3-g]benzimidazol-1-yl]-propyl]-N-methylcarbamate | 1269695-67-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物
• 英文名称: tert-butyl N-[3-[2-amino-8-(dimethylcarbamoyl)-8,9-dihydro-7H-pyrano[2,3-g]benzimidazol-1-yl]-propyl]-N-methylcarbamate
• 英文别名: 2-amino-1-(3'-[N'-methyl-N'-tert-butoxycarbonyl]propyl)-8-(N,N-dimethylcarboxamide)-1,7,8,9-tetrahydrochromeno[5,6-d]imidazole；tert-butyl N-[3-[2-amino-8-(dimethylcarbamoyl)-8,9-dihydro-7H-pyrano[2,3-g]benzimidazol-1-yl]-propyl]-N-methylcarbamate
• CAS: 1269695-67-1
• 化学式: C₂₂H₃₃N₅O₄
• 分子量: 431.535
• InChiKey: YULYPIRELLIYBP-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.51
• 重原子数：
  31.0
• 可旋转键数：
  5.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.59
• 拓扑面积：
  102.92
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  7.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  tert-butyl N-[3-[2-amino-8-(dimethylcarbamoyl)-8,9-dihydro-7H-pyrano[2,3-g]benzimidazol-1-yl]-propyl]-N-methylcarbamate 在 lithium aluminium tetrahydride 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 1.5h， 以89%的产率得到8-((dimethylamino)methyl)-1-(3-(dimethylamino)propyl)-1,7,8,9-tetrahydrochromeno[5,6-d]imidazol-2-amine
  参考文献：
  名称：

  An Efficient New Route to Dihydropyranobenzimidazole Inhibitors of HCV Replication

  摘要：

  最近发现了一类二氢吡喃苯并咪唑抑制剂，具有以新方式对抗丙型肝炎病毒（HCV）的作用，它们与病毒RNA高度保守的5'非翻译区的IRES-IIa亚域结合，从而阻止核糖体启动翻译。然而，这些化合物的合成报道过程漫长且产率较低， intermediates的纯化则相当麻烦，而且该合成路线不利于库的构建。我们报告了一种精简的合成途径，能够显著提高产率，并且大多数中间体是晶体。此外，关键的可变侧链在合成后期引入，使得容易合成类似物以优化抗病毒活性。

  DOI：

  10.3390/molecules16010281
• 作为产物：
  描述：

  5-chloro-N,N-dimethylchromane-3-carboxamide 在 N-甲基吡咯烷酮 、 二氯乙酸 、 sodium nitrate 、 palladium 10% on activated carbon 、 氢气 、 三氟乙酸 作用下， 以 乙醇 为溶剂， 75.0 ℃ 、101.33 kPa 条件下， 反应 65.0h， 生成 tert-butyl N-[3-[2-amino-8-(dimethylcarbamoyl)-8,9-dihydro-7H-pyrano[2,3-g]benzimidazol-1-yl]-propyl]-N-methylcarbamate
  参考文献：
  名称：

  Syntheses and Binding Testing of N1-Alkylamino-Substituted 2-Aminobenzimidazole Analogues Targeting the Hepatitis C Virus Internal Ribosome Entry Site

  摘要：

  我们合成了一系列 2-氨基苯并咪唑类似物，并测试了它们与丙型肝炎病毒（HCV）内部核糖体进入位点（IRES）中先前确定的病毒翻译抑制剂 RNA 靶点的结合情况。新抑制剂化合物的合成采用了一种高度趋同的策略，该策略允许以较高的总产率（8 个步骤，4-22%）加入不同的三级氨基取代基。结构-活性关系（SAR）研究的重点是在抑制剂结合部位与 RNA 主干发生氢键作用的叔胺取代基。SAR 研究进一步与硅学对接实验相关联。类似化合物显示出良好的活性（半数最大有效浓度，EC50：21-89µM）。合成的类似物的结构及其结合模式的相关性为探索选择性靶向 HCV IRES IIa 亚域所需的参数提供了机会，该亚域在 HCV 翻译过程中起着 RNA 构象转换的作用。

  DOI：

  10.1071/ch19526

文献信息

• Structure-based virtual screening of unbiased and RNA-focused libraries to identify new ligands for the HCV IRES model system
  作者：Elisabeth Kallert、Laura Almena Rodriguez、Jan-Åke Husmann、Kathrin Blatt、Christian Kersten

  DOI：10.1039/d3md00696d

  日期：——

  Using structure-based virtual screening, FRET and MST assays, novel ligands of the hepatitis C virus internal ribosome entry site were identified. This proof-of-concept study demonstrated the feasibility of RNA–ligand docking for hit identification.