2,3,3-trimethyl-1-(5-methylcarbonyloxypentyl)-3H-benzo[b]azolium iodide | 198422-81-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: 2,3,3-trimethyl-1-(5-methylcarbonyloxypentyl)-3H-benzo[b]azolium iodide
• 英文别名: 1-(5-Acetoxypentyl)-2,3,3-trimethylindoleninium iodide；5-(2,3,3-trimethylindol-1-ium-1-yl)pentyl acetate;iodide
• CAS: 198422-81-0
• 化学式: C₁₈H₂₆NO₂*I
• 分子量: 415.314
• InChiKey: BXWSPSHTYZRKGM-UHFFFAOYSA-M

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.82
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  29.3
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2,3,3-trimethyl-1-(5-methylcarbonyloxypentyl)-3H-benzo[b]azolium iodide 、 方酸 在 potassium carbonate 作用下， 以 甲醇 、 正丁醇 为溶剂， 生成 2-4-Bis-(1-(5-hydroxypentyl)-3,3-dimethyl-2-indolinylidenemethyl)-cyclobutenediylium-1,3-diolate
  参考文献：
  名称：

  Squarate dyes and their use in fluorescent sequencing method

  摘要：

  描述了新型方酸染料，并描述了这些染料与生物学上重要的化学物种如核苷或核苷酸的加合物。这些加合物对于荧光核酸测序方法具有有用的特性。

  公开号：

  US06140494A1
• 作为产物：
  描述：

  2,3,3-三甲基-3H-吲哚 、 5-iodopentyl acetate 以 邻二氯苯 为溶剂， 生成 2,3,3-trimethyl-1-(5-methylcarbonyloxypentyl)-3H-benzo[b]azolium iodide
  参考文献：
  名称：

  Cyanine dyes as labeling reagents for detection of biological and other materials by luminescence methods

  摘要：

  靛菁及相关染料，如甲基靛菁、苯乙烯和氧酮醇染料，具有强光吸收和高发光性能。具有功能基团的靛菁及相关染料使其能够与氨基、羟基和巯基等基团发生共价结合，被连接到蛋白质、核酸、碳水化合物、糖类、细胞及其组合物等生物和非生物材料上，使这些材料变得荧光，从而可以被检测到。标记的材料然后可以在利用激发光源和发光检测器的测定中使用。例如，荧光靛菁及相关染料可以连接到亲和素、抗体和凝集素的氨基、羟基或巯基上。因此，标记有靛菁类染料的亲和素可用于定量生物素化材料，而与靛菁类染料结合的抗体可用于检测和测量抗原和半抗原。此外，靛菁连接的凝集素可用于检测特定的碳水化合物基团。此外，DNA或RNA的靛菁连接片段可用于识别DNA或RNA中互补核苷酸序列的存在。

  公开号：

  US06225050B1

文献信息

• Cyanine dyes as labeling reagents for detection of biological and other
  申请人：Carnegie Mellon University

  公开号：US06048982A1

  公开（公告）日：2000-04-11

  Cyanine and related dyes, such as merocyanine, styryl and oxonol dyes, are strongly light-absorbing and highly luminescent. Cyanine and related dyes having functional groups make them reactive with amine, hydroxy and sulfhydryl groups are covalently attached to proteins, nucleic acids, carbohydrates, sugars, cells and combinations thereof, and other biological and nonbiological materials, to make these materials fluorescent so that they can be detected. The labeled materials can then be used in assays employing excitation light sources and luminescence detectors. For example, fluorescent cyanine and related dyes can be attached to amine, hydroxy or sulfhydryl groups of avidin and to antibodies and to lectins. Thereupon, avidin labeled with cyanine type dyes can be used to quantify biotinylated materials and antibodies conjugated with cyanine-type dyes can be used to detect and measure antigens and haptens. In addition, cyanine-conjugated lectins can be used to detect specific carbohydrate groups. Also, cyanine-conjugated fragments of DNA or RNA can be used to identify the presence of complementary nucleotide sequences in DNA or RNA.

  青光素染料和相关染料，例如甲氧基青光素、苯乙烯基和氧酮醇染料，具有强烈的吸光性和高度的发光性。具有功能基团的青光素染料和相关染料使它们与胺基、羟基和巯基反应，可以共价地附着于蛋白质、核酸、碳水化合物、糖、细胞和它们的组合，以使这些材料发出荧光，从而可以被检测到。标记后的材料可以在激发光源和发光检测器的检测下用于测定。例如，荧光青光素染料和相关染料可以附着于亲和素、抗体和凝集素的胺基、羟基或巯基上。因此，用青光素型染料标记的亲和素可以用于定量生物素化材料，用青光素型染料偶联的抗体可以用于检测和测量抗原和半抗原。此外，青光素偶联的凝集素可以用于检测特定的碳水化合物基团。此外，青光素偶联的DNA或RNA片段可以用于鉴定DNA或RNA中互补核苷酸序列的存在。
• SQUARATE DYES AND THEIR USE IN FLUORESCENT SEQUENCING METHOD
  申请人：Amersham Pharmacia Biotech UK Limited

  公开号：EP0898596A1

  公开（公告）日：1999-03-03
• US6048982A
  申请人：——

  公开号：US6048982A

  公开（公告）日：2000-04-11
• US6140494A
  申请人：——

  公开号：US6140494A

  公开（公告）日：2000-10-31
• US6225050B1
  申请人：——

  公开号：US6225050B1

  公开（公告）日：2001-05-01