succinic acid mono-2’,3’-O-isopropylideneuridin-5’yl ester | 1173990-79-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: succinic acid mono-2’,3’-O-isopropylideneuridin-5’yl ester
• 英文别名: succinic acid mono-2',3'-O-isopropylidene-uridin-5'-yl ester；succinic acid mono-2',3'-isopropylidene-uridin-5'-yl ester；5'-O-succinyl-2',3'-O-isopropylideneuridine；5'-succinyl-2',3'-O-isopropylidene uridine
• CAS: 1173990-79-8
• 化学式: C₁₆H₂₀N₂O₉
• 分子量: 384.343
• InChiKey: HGWIPXLEMOACNJ-HKSFMPNISA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.64
• 重原子数：
  27.0
• 可旋转键数：
  6.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.62
• 拓扑面积：
  146.15
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  9.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  succinic acid mono-2’,3’-O-isopropylideneuridin-5’yl ester 、 (5-amino-2-pyridyl) 2,3,4,6-tetra-O-acetyl-1-thio-β-D-galactopyranoside 在 N-甲基吗啉 、 4-(4,6-二甲氧基三嗪-2-基)-4-甲基吗啉盐酸盐 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 2.0h， 以41%的产率得到[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-6-yl]methyl 4-oxo-4-[[6-[(2S,3R,4S,5S,6R)-3,4,5-triacetyloxy-6-(acetyloxymethyl)oxan-2-yl]sulfanylpyridin-3-yl]amino]butanoate
  参考文献：
  名称：

  糖基转移酶底物的新型硫糖基类似物作为抗经典猪瘟病毒和丙型肝炎病毒的抗病毒化合物

  摘要：

  丙型肝炎病毒（HCV）和经典猪瘟病毒（CSFV）是重要的病原体，急需新的治疗方法。在这里，我们报告了新设计的糖基转移酶底物的硫代糖基类似物的合成，使用基于细胞的分析方法对两种病毒的细胞毒性和抗病毒活性进行了评估。使用假斑减少测定法证实了合成化合物对CSFV和HCV的抗病毒活性，其中在选定化合物的存在下观察到了明显的病毒生长停滞。我们显示了该系列化合物13和14对体外CSFV和HCV感染发挥了最显着的抑制作用。糖缀合物13和14不仅抑制病毒在低微摩尔范围内的IC 50值的传播，而且以剂量依赖的方式有效地抑制了病毒蛋白的产生。另外，使用体外HCV感染和复制模型的研究表明，这两种化合物均能够显着减少病毒基因组复制。我们证明了化合物13和14表现出强烈的抑制作用，最多可复制90％，这使它们成为开发新的抗-CSFV和抗-HCV药物的有前途的替代方法。

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2017.05.051
• 作为产物：
  描述：

  丁二酸酐 、 2’,3’邻异亚丙基尿苷 在 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 以57%的产率得到succinic acid mono-2’,3’-O-isopropylideneuridin-5’yl ester
  参考文献：
  名称：

  尿嘧啶肽类抗生素的作用机理：与转位酶MraY中的蛋白质-蛋白质相互作用位点的意外连接。

  摘要：

  pacidamycin和muraymycin uridyl肽抗生素显示出与Arg-Trp-xx-Trp序列基序在结构上相似，用于噬菌体varphiX174蛋白E和大肠杆菌转位酶MraY之间的蛋白-蛋白相互作用。已发现UPA类成员和合成的尿苷肽类似物对F288L或E287A突变型MraY酶的抑制作用降低，这表明UPA在此胞外位点相互作用是酶抑制机制的一部分。

  DOI：

  10.1039/c4cc06516f

文献信息

• Novel Uridine Glycoconjugates, Derivatives of 4-Aminophenyl 1-Thioglycosides, as Potential Antiviral Compounds
  作者：Ewelina Krol、Gabriela Pastuch-Gawolek、Binay Chaubey、Gabriela Brzuska、Karol Erfurt、Boguslaw Szewczyk

  DOI：10.3390/molecules23061435

  日期：——

  series of uridine glycoconjugates, derivatives of 4-aminophenyl 1-thioglycosides, was designed and synthesized. All compounds were evaluated in vitro for their antiviral activity against hepatitis C virus (HCV) and classical swine fever virus (CSFV), two important human and animal viral pathogens for which new or improved therapeutic options are needed. The antiviral activity of all synthesized compounds

  设计并合成了一系列新颖的尿苷糖缀合物，即4-氨基苯基1-硫代糖苷的衍生物。体外评估了所有化合物对丙型肝炎病毒（HCV）和经典猪瘟病毒（CSFV）的抗病毒活性，丙型肝炎病毒是两种重要的人和动物病毒病原体，需要新的或改良的治疗方法。使用假斑减少测定法证实了所有合成化合物的抗病毒活性，其中在这些化合物的存在下观察到了CSFV和HCV生长的明显停滞。两种合成的化合物9和12对HCV和CSFV传播表现出显着的抑制作用，HCV的IC50值分别为4.9和13.5 µM，CSFV的IC50值分别为4.2和4 µM，具有低细胞毒性。使用各种感染和复制模型，我们已经表明，这两种化合物均能够在低微摩尔范围内将IC50值显着降低高达90％的病毒基因组复制。合成化合物的结构活性分析表明，高抗病毒活性归因于糖缀合物的疏水性以及将能够协调金属离子的元素引入连接糖和尿苷部分的间隔基，这可用于开发新的未来的抗病毒化合物。
• 5-Amino-2-pyridyl 1-thioglycosides in synthesis of analogs of glycosyltransferases substrates
  作者：Gabriela Pastuch-Gawolek、Tadeusz Bieg、Wieslaw Szeja、Jakub Flasz

  DOI：10.1016/j.bioorg.2009.04.002

  日期：2009.6

  We present the synthesis of 1-thioglycosyl derivatives of uridine. which were designed to act as potential donor substrates for glycosyltransferases. We constructed such analogs using 5-amino-2-pyridyl 1-thioglycosides as glycosyl units which were connected to uridine via succinic linker. For preparation of the amide bonds we applied different condensation procedures. (C) 2009 Elsevier Inc. All rights reserved.
• Inhibition of Escherichia coli glycosyltransferase MurG and Mycobacterium tuberculosis Gal transferase by uridine-linked transition state mimics
  作者：Amy E. Trunkfield、Sudagar S. Gurcha、Gurdyal S. Besra、Timothy D.H. Bugg

  DOI：10.1016/j.bmc.2010.02.026

  日期：2010.4

  Glycosyltransferase MurG catalyses the transfer of N-acetyl-D-glucosamine to lipid intermediate I on the bacterial peptidoglycan biosynthesis pathway, and is a target for development of new antibacterial agents. A transition state mimic was designed for MurG, containing a functionalised proline, linked through the alpha-carboxylic acid, via a spacer, to a uridine nucleoside. A set of 15 functionalised prolines were synthesised, using a convergent dipolar cycloaddition reaction, which were coupled via either a glycine, proline, sarcosine, or diester linkage to the 5'-position of uridine. The library of 18 final compounds were tested as inhibitors of Escherichia coli glycosyltransferase MurG. Ten compounds showed inhibition of MurG at 1 mM concentration, the most active with IC50 400 mu M. The library was also tested against Mycobacterium tuberculosis galactosyltransferase GlfT2, and one compound showed effective inhibition at 1 mM concentration. (C) 2010 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• Komor, Roman; Pastuch-Gawołek, Gabriela; Sobania, Agnieszka, Acta poloniae pharmaceutica, 2012, vol. 69, # 6, p. 1259 - 1269
  作者：Komor, Roman、Pastuch-Gawołek, Gabriela、Sobania, Agnieszka、Jadwiński, Michał、Szeja, Wiesław

  DOI：——

  日期：——
• Pastuch, Gabriela; Komor, Roman; Grec, Marta, Acta poloniae pharmaceutica, 2010, vol. 67, # 6, p. 642 - 651
  作者：Pastuch, Gabriela、Komor, Roman、Grec, Marta、Szeja, Wieslaw

  DOI：——

  日期：——