4-氨基-5-氯-2(1H)-嘧啶酮 | 2347-43-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 中文名称: 4-氨基-5-氯-2(1H)-嘧啶酮
• 中文别名: 2-羟基-4-氨基-5-氯嘧啶；5-氯胞嘧啶
• 英文名称: 5-chloro-cytosine
• 英文别名: 6-amino-5-chloro-1H-pyrimidin-2-one
• CAS: 2347-43-5
• 化学式: C₄H₄ClN₃O
• mdl: MFCD09753492
• 分子量: 145.548
• InChiKey: PNWOYKVCNDZOLS-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 熔点：
  >288 °C (decomp)(Solv: water (7732-18-5))
• 密度：
  1.79±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.3
• 重原子数：
  9
• 可旋转键数：
  0
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.0
• 拓扑面积：
  67.5
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  2

安全信息

• 海关编码：
  2933599090

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  氯乙醛 、 4-氨基-5-氯-2(1H)-嘧啶酮 在 sodium acetate 作用下， 以 水 为溶剂， 反应 2.17h， 以76%的产率得到8-chloroimidazo[1,2-c]pyrimidin-5(6H)-one
  参考文献：
  名称：

  胞嘧啶碘代咪唑并[1,2 - c ]嘧啶-5（6 H）-的合成，结构与重排

  摘要：

  我们描述了各种8-取代的咪唑并[1,2 - c ]嘧啶-5（6 H）-ones（ethenocytosines）的温和和选择性碘化。通过将5-卤代胞嘧啶与氯乙醛环化或随后的Suzuki-Miyaura交叉偶联在8-碘咪唑并[1,2 - c ]嘧啶-5（6 H）-1d和相应的芳基硼酸中获得起始的胞嘧啶。当咪唑并[1,2 Ç ]嘧啶5（6 ħ） -酮或8碘咪唑并[1,2- c ^ ]嘧啶5（6 ħ） -酮1D通过碘化Ñ在DMF碘代丁二酰亚胺（NIS） ，纯3,8-二碘代衍生物2d获得了。在碱性或酸性条件下，该分子会重排为2,8-二十二烷基衍生物3d，随后可将其碘代为2,3,8-三十二烷基衍生物4d。由于仅通过NMR光谱不能令人信服地确定碘原子在咪唑环上的位置，因此对2d进行X射线分析以毫无疑问地确认其结构。将相同的反应顺序应用于另外八个乙炔胞嘧啶，可提供出色的区域选择性，易重排和高产率的碘化产物。通过1

  DOI：

  10.1016/j.tet.2014.11.049
• 作为产物：
  描述：

  胞嘧啶 在 N-氯代丁二酰亚胺 、 溶剂黄146 作用下， 反应 4.0h， 以84.4%的产率得到4-氨基-5-氯-2(1H)-嘧啶酮
  参考文献：
  名称：

  基于胞嘧啶的TET酶抑制剂。

  摘要：

  DNA甲基化因其在调节局部基因转录中的关键作用而被称为prima donna后生标记。整个基因组中DNA甲基化景观的变化发生在细胞转变过程中，例如分化和神经元可塑性改变，并在疾病状态（例如癌症）中失调。已知TET酶家族负责催化反向过程，该过程是通过识别5-甲基胞嘧啶并通过Fe（II）/α-酮戊二酸依赖性机制氧化甲基来进行的DNA去甲基化。在这里，我们描述了新型基于胞嘧啶的TET酶抑制剂的设计，合成和评估，这是一类先前尚未开发但在表观遗传学领域中广泛需要的小分子探针。我们确定了一种有前途的基于胞嘧啶的先导化合物Bobcat339，对TET1和TET2具有中等μM的抑制活性，但不抑制DNA甲基转移酶DNMT3a。TET酶活性位点的计算机模拟用于合理化Bobcat339和其他基于胞嘧啶的抑制剂的活性。这些新的分子工具将对表观遗传学领域有用，并成为针对DNA甲基化和基因转录的新疗法的起点。

  DOI：

  10.1021/acsmedchemlett.8b00474

文献信息

• Structure−Activity Relationships of 2‘-Deoxy-2‘,2‘-difluoro-<scp>l</scp>-<i>erythro</i>-pentofuranosyl Nucleosides
  作者：Lakshmi P. Kotra、Yuejun Xiang、M. Gary Newton、Raymond F. Schinazi、Yung-C. Cheng、Chung K. Chu

  DOI：10.1021/jm970275y

  日期：1997.10.1

  -pentofuranosyl nucleosides as potential antiviral agents. The target compounds were synthesized via the key intermediates 7a or 7b from L-gulono gamma-lactone. Compound 2 was oxidatively cleaved and coupled with ethyl bromodifluoroacetate in the presence of activated zinc under Reformatsky conditions to obtain a diasteomeric mixture of 4(R) and 4(S), in a 4:1 ratio. The major 4(R) isomer was cyclized

  根据最近的发现，一些L-核苷比其D-对应物更有效或相等，我们合成了2'-脱氧-2'，2'-二氟-L-赤型戊呋喃糖基核苷作为潜在的抗病毒剂。通过关键中间体7a或7b从L-古洛诺γ-内酯合成目标化合物。在活化锌存在下，在Reformatsky条件下，将化合物2氧化裂解并与溴二氟乙酸乙酯偶联，以4：1的比例获得4（R）和4（S）的非对映异构混合物。使主要的4R异构体环化并进行适当处理，以获得甲磺酸酯8a或8b，将其与各种甲硅烷基保护的嘧啶缩合。在Mitsunobu条件下将醇7a或7b与6-氯嘌呤缩合，得到6-氯嘌呤类似物53a或53b和54a或54b。进一步处理化合物53a，54a和53b，54b，分别得到肌苷和腺嘌呤衍生物57-60。2-氨基-6-氯嘌呤与化合物8a的缩合，然后用2-巯基乙醇/甲醇钠处理，得到鸟嘌呤类似物63和64。评估了所有合成的核苷31-52、57-60、63和64抗病毒活
• Synthesis of 2′,3′-Dideoxy-2′-Fluoro-l-<i>threo</i>-Pentofuranosyl Nucleosides as Potential Antiviral Agents
  作者：Socrates C. H. Cavalcanti、Yuejun Xiang、M. Gary Newton、Raymond F. Schinazi、Yung-Chi Cheng、Chung K. Chu

  DOI：10.1080/07328319908044878

  日期：1999.10

  A series of 2',3'-dideoxy-2'-fluoro-L-threo-pentofuranosyl nucleosides has been synthesized as potential antiviral agents. The synthesized compounds were evaluated against HIV-1, HBV, HSV-1, and HSV-2. Among the synthesized analogues, only the cytosine derivative showed moderate antiviral activity against HIV and HBV.

  已合成了一系列2'，3'-二脱氧-2'-氟-L-苏-戊呋喃糖基核苷作为潜在的抗病毒药。评估合成化合物的抗HIV-1，HBV，HSV-1和HSV-2。在合成的类似物中，只有胞嘧啶衍生物显示出对HIV和HBV的中等抗病毒活性。
• Structure−Activity Relationships of 1-(2-Deoxy-2-fluoro-β-<scp>l</scp>-arabino- furanosyl)pyrimidine Nucleosides as Anti-Hepatitis B Virus Agents
  作者：Tianwei Ma、S. Balakrishna Pai、Yong Lian Zhu、Ju Sheng Lin、Kirupa Shanmuganathan、Jinfa Du、Chunguang Wang、Hongbum Kim、M. Gary Newton、Yung Chi Cheng、Chung K. Chu

  DOI：10.1021/jm960098l

  日期：1996.1.1

  synthesized, the lead compound, L-FMAU (13), exhibited the most potent anti-HBV activity (EC50 0.1 microM). None of the other uracil derivatives showed significant anti-HBV activity up to 10 microM. Among the cytosine analogues, the cytosine (27) and 5-iodocytosine (35) derivatives showed moderately potent anti-HBV activity (EC50 1.4 and 5 microM, respectively). The cytotoxicity of these nucleoside analogues

  由于2'-氟-5-甲基-β-L-阿拉伯呋喃糖基尿嘧啶（L-FMAU）已被证明是一种有效的体外抗HBV药物，因此研究相关核苷的构效关系十分重要。因此，已经合成了一系列的1-（2-脱氧-2-氟-β-L-阿拉伯呋喃糖基）嘧啶核苷，并评估了在2.2.15细胞中针对HBV的抗病毒活性。在本研究中，最初使用L-核糖作为起始原料。由于L-核糖的商业成本，我们开发了一种制备L-核糖衍生物6的有效方法。从L-木糖开始，通过重铬酸吡啶鎓氧化，可得到6的极好的总收率（70％）。 3-OH基团，然后用NaBH4进行立体选择性还原。它进一步转换为1,3，5-三-O-苯甲酰基-2-脱氧-2-氟-α-L-呋喃呋喃糖（10），然后与各种5-取代的嘧啶碱基缩合，得到核苷。在合成的化合物中，主要化合物L-FMAU（13）表现出最有效的抗HBV活性（EC50为0.1 microM）。直至10 microM，其他尿嘧啶衍生物均未
• CYTOSINE-BASED TET ENZYME INHIBITORS
  申请人：President and Trustees of Bates College

  公开号：US20200316069A1

  公开（公告）日：2020-10-08

  Provided herein, in some embodiments, are cytosine analogs, compositions comprising cytosine analogs, and methods of use for inhibiting a Ten-eleven translocation (TET) enzyme.

  以下是一些实施例：胞嘧啶类似物、包含胞嘧啶类似物的组合物，以及用于抑制十一转位（TET）酶的方法。
• Detection and Quantification of 5-Chlorocytosine in DNA by Stable Isotope Dilution and Gas Chromatography/Negative Ion Chemical Ionization/Mass Spectrometry
  作者：Hauh-Jyun Candy Chen、Shin-Wei Row、Chia-Liang Hong

  DOI：10.1021/tx015578g

  日期：2002.2.1

  (5Cl-Cyt). In this report, a gas chromatography/negative ion chemical ionization/mass spectrometry (GC/NICI/MS) assay with stable isotope dilution was developed for detection and quantification of 5Cl-Cyt in DNA. During hydrolysis of DNA, 5Cl-Cyt undergoes spontaneous deamination quantitatively forming 5-chlorouracil (5Cl-Ura). The stable isotope of 5Cl-Ura with six mass units higher than the normal

  在感染和炎症过程中，活化吞噬细胞会生成次氯酸（HOCl）。HOCl与DNA反应的主要产物之一是5-氯胞嘧啶（5Cl-Cyt）。在本报告中，开发了一种具有稳定同位素稀释度的气相色谱/负离子化学电离/质谱（GC / NICI / MS）分析方法，用于检测和定量DNA中的5Cl-Cyt。在DNA水解过程中，5Cl-Cyt自发地进行脱氨基反应，定量形成5-氯尿嘧啶（5Cl-Ura）。合成了比正常5Cl-Ura高6个质量单位的5Cl-Ura稳定同位素，并将其用作测定的内标。在对GC / NICI / MS进行分析之前，用五氟苄基溴将DNA水解产物的加合物富集部分衍生化，并在双五氟苄基化5Cl-Ura及其同位素类似物的[M-181]（-）片段上进行选定的离子监测。检测限为20 amol（S / N = 8）的双五氟苄基化5Cl-Ura色谱柱，采用选择性离子监测模式进样，整个测定的定量限为14 fmol