(Z)-4-(2,5-dimethoxybenzylidene)-1,2-dimethyl-1H-imidazol-5(4H)-one | 1246401-08-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: (Z)-4-(2,5-dimethoxybenzylidene)-1,2-dimethyl-1H-imidazol-5(4H)-one
• 英文别名: (5Z)-5-[(2,5-dimethoxyphenyl)methylidene]-2,3-dimethylimidazol-4-one
• CAS: 1246401-08-0
• 化学式: C₁₄H₁₆N₂O₃
• 分子量: 260.293
• InChiKey: WIMIMDPHJZANFE-WQLSENKSSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.5
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.29
• 拓扑面积：
  51.1
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (Z)-4-(2,5-dimethoxybenzylidene)-1,2-dimethyl-1H-imidazol-5(4H)-one 在 三溴化硼 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 4.0h， 以89%的产率得到(Z)-5-(2-hydroxy-5-methoxybenzylidene)-2,3-dimethyl-3,5-dihydro-4H-imidazol-4-one
  参考文献：
  名称：

  带有绿色荧光蛋白发色团邻羟基的激发态分子内质子转移分子

  摘要：

  合成了绿色荧光蛋白生色团的邻羟基类似物1a – g。通过X射线单晶分析，电化学和发光特性研究了它们的结构和电子性能。在固体和非极性溶剂中1a – g主要以Z的形式存在具有七元环氢键并经历激发态分子内质子转移（ESIPT）反应的构象异构体，导致质子转移互变异构体发射。荧光上转换动力学揭示了一种相干类型的ESIPT，随后是快速振动/溶剂弛豫（<1 ps）到扭曲（关于exo-C（5）–C（4）–C（3）键）构象，在环己烷中分辨出了几到几十皮秒的快速人口衰减。因此，质子互变异构体转移发射强度适中（0.08英寸1E）至弱（〜10 -4在1A）的环己烷。1g中更强的分子内氢键抑制芳基-烯烃键的旋转，从而导致发射互变异构体的高产率（Φ ˚F ≈0.2）。在固态下，由于抑制了exo-C（5）–C（4）–C（3）的旋转，对于1a – g，可获得强互变异构体发射，量子产率为0.1–0.9 。取决于取代基在HO

  DOI：

  10.1021/jo2012384
• 作为产物：
  描述：

  2,5-二甲氧基苯甲醛 在 sodium acetate 、 potassium carbonate 作用下， 以 乙醇 、 水 、 乙酸酐 为溶剂， 反应 8.0h， 生成 (Z)-4-(2,5-dimethoxybenzylidene)-1,2-dimethyl-1H-imidazol-5(4H)-one
  参考文献：
  名称：

  带有绿色荧光蛋白发色团邻羟基的激发态分子内质子转移分子

  摘要：

  合成了绿色荧光蛋白生色团的邻羟基类似物1a – g。通过X射线单晶分析，电化学和发光特性研究了它们的结构和电子性能。在固体和非极性溶剂中1a – g主要以Z的形式存在具有七元环氢键并经历激发态分子内质子转移（ESIPT）反应的构象异构体，导致质子转移互变异构体发射。荧光上转换动力学揭示了一种相干类型的ESIPT，随后是快速振动/溶剂弛豫（<1 ps）到扭曲（关于exo-C（5）–C（4）–C（3）键）构象，在环己烷中分辨出了几到几十皮秒的快速人口衰减。因此，质子互变异构体转移发射强度适中（0.08英寸1E）至弱（〜10 -4在1A）的环己烷。1g中更强的分子内氢键抑制芳基-烯烃键的旋转，从而导致发射互变异构体的高产率（Φ ˚F ≈0.2）。在固态下，由于抑制了exo-C（5）–C（4）–C（3）的旋转，对于1a – g，可获得强互变异构体发射，量子产率为0.1–0.9 。取决于取代基在HO

  DOI：

  10.1021/jo2012384

文献信息

• Red‐Shifted Substrates for FAST Fluorogen‐Activating Protein Based on the GFP‐Like Chromophores
  作者：Natalia V. Povarova、Snizhana O. Zaitseva、Nadezhda S. Baleeva、Alexander Yu. Smirnov、Ivan N. Myasnyanko、Marina B. Zagudaylova、Nina G. Bozhanova、Dmitriy A. Gorbachev、Kseniya K. Malyshevskaya、Alexey S. Gavrikov、Alexander S. Mishin、Mikhail S. Baranov

  DOI：10.1002/chem.201901151

  日期：2019.7.22

  A genetically encoded fluorescent tag for live cell microscopy is presented. This tag is composed of previously published fluorogen‐activating protein FAST and a novel fluorogenic derivative of green fluorescent protein (GFP)‐like chromophore with red fluorescence. The reversible binding of the novel fluorogen and FAST is accompanied by three orders of magnitude increase in red fluorescence (580–650 nm)

  提出了用于活细胞显微镜的遗传编码的荧光标签。该标签由先前发布的荧光激活蛋白FAST和绿色荧光蛋白（GFP）样发色团的新型荧光衍生物组成，具有红色荧光。新型氟和FAST的可逆结合伴随着红色荧光（580-650 nm）增加了三个数量级。与以前发表的flugen：FAST复合物相比，所提出的染料可立即染色与FAST融合的靶细胞蛋白，在很短的时间内被洗掉，并在共聚焦和宽视野显微镜中显示出更高的荧光信号光稳定性。
• Design of red-shifted and environment-sensitive fluorogens based on GFP chromophore core
  作者：Alexander Yu. Smirnov、Maxim M. Perfilov、Elvira R. Zaitseva、Marina B. Zagudaylova、Snizhana O. Zaitseva、Alexander S. Mishin、Mikhail S. Baranov

  DOI：10.1016/j.dyepig.2020.108258

  日期：2020.6

  of the recent fundamental advances in this field is the development of fluorogenic dyes - compounds that have no pronounced fluorescence in the free state but acquire it upon binding with the target object, allowing for simple no-wash labeling. Among these dyes, it is worth to note compounds whose fluorescence is particularly sensitive to the properties of the microenvironment (e.g., solvent), which

  荧光染色是研究生命系统必不可少的方法。该领域最近的一项基本进展是开发了荧光染料-荧光染料在自由状态下没有明显的荧光，但在与目标物体结合后会获得荧光，因此无需清洗标签。在这些染料中，值得注意的是其荧光对微环境（例如溶剂）的特性特别敏感的化合物，例如可用于染色细胞器。在本文中，我们提出了一种新颖的技术，用于创建具有较大斯托克斯频移的环境敏感型和红移荧光染料。新型染料基于GFP发色团核心，并显示出最大发射位置和荧光量子产率的高溶剂依赖性变化。